[發明專利]一種檢測尿嘧啶-DNA糖基化酶的生物傳感器及其制備方法有效
| 申請號: | 201910022818.6 | 申請日: | 2019-01-10 |
| 公開(公告)號: | CN109752362B | 公開(公告)日: | 2021-06-15 |
| 發明(設計)人: | 王玉;李莎莎;劉素;黃加棟;張儒峰;趙一菡;瞿曉南;孫文玉;王業茹;張曼如 | 申請(專利權)人: | 濟南大學 |
| 主分類號: | G01N21/65 | 分類號: | G01N21/65 |
| 代理公司: | 濟南泉城專利商標事務所 37218 | 代理人: | 李桂存 |
| 地址: | 250022 山東*** | 國省代碼: | 山東;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 檢測 嘧啶 dna 糖基化酶 生物 傳感器 及其 制備 方法 | ||
本發明涉及生物傳感器技術領域,特別涉及基于納米金DNA分子機器與表面增強拉曼散射的生物傳感器。為了解決以上現有技術中檢測UDG活性的方法特異性和靈敏度都比較低、成本高的問題。一種基于DNA分子機器表面增強拉曼散射檢測UDG活性的生物傳感器,將納米金分子機器與表面增強拉曼相結合,均相反應混合液。制備方法:合成金納米粒子;將Hairpin Probe和Track DNA以及拉曼染料修飾到金納米粒子表面;將標記的納米金溶液與均相反應溶液混合。利用了內切酶IV的特異性切割實現DNA分子機器開啟,利用表面增強拉曼檢測實現了高靈敏性檢測;利用外切酶Ⅲ,實現了DNA分子機器的循環,起到了信號放大的作用。
技術領域
本發明屬于生物傳感器技術領域,特別涉及基于DNA分子機器表面增強拉曼散射檢測尿嘧啶-DNA糖基化酶活性的生物傳感器,還涉及其制備方法。
背景技術
基因組由特定配對的DNA堿基組成,其穩定和準確性是所有生物體的先決條件。然而,DNA堿基的結構特性可能被多種環境因子和內源性活性氧物質破壞,導致基因組不穩定性和誘導癌變。尿嘧啶是DNA中常見的受損堿基,在DNA復制過程中dUTP錯誤摻入或胞嘧啶水解脫氨的結果,從而導致G:C堿基對轉變成A:U堿基對,最終導致基因突變。通常通過堿基切除修復系統中的尿嘧啶-DNA糖基化酶(UDG)來修復DNA內的尿嘧啶。尿嘧啶-DNA糖基化酶(UDG)是一種高度保守的損傷修復酶,它可以通過催化尿嘧啶和DNA骨架之間的糖苷鍵的裂解來特異性地識別和切除尿嘧啶,釋放受損的堿基并產生無堿基位點(AP位點),并最終與其他修復蛋白質協調以完成整個DNA修復。UDG在維持基因組完整性方面發揮著至關重要的作用,而UDG的異常表達與人類免疫缺陷,淋巴瘤,神經變性和癌癥等多種疾病直接相關。因此,精確檢測UDG活性對于生物醫學研究和臨床診斷至關重要。
傳統的UDG活性檢測方法有凝膠電泳法,核酸標記等方法,然而,它們需要復雜的核酸標記和凝膠電泳程序,并且耗時且靈敏度差,很難普遍化。為了克服以上缺陷,一些基于比色和熒光的UDG活性檢測方法發展起來,這些新技術給UDG活性檢測方面帶來了巨大的進步;但要實現更加靈敏、特異性檢測UDG還有待進一步改善。
發明內容
為了實現更加靈敏的、特異性的檢測UDG活性,本申請提出了一種基于雙酶輔助和DNA分子機器介導納米金顆粒聚集檢測DNA糖基化酶的生物傳感器。
一種檢測尿嘧啶-DNA糖基化酶的生物傳感器,包括納米金溶液、Hairpin Probe、Track DNA、拉曼染料、拉曼染料、均相反應液;
所述的Hairpin Probe、Track DNA序列為:
Hairpin Probe:
5’-SH-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGTATGTAGTAT
CTCTTTTTCUACATACTGTTTTTT-3’ 序列如SEQ No.1所示;
Track DNA: 5’-SH-TTTTGAGATACTACATAC-3’ 序列如SEQ No.2所示;
所述的DNA序列中,Hairpin Probe和Track DNA的5’端修飾-SH;
所述的Hairpin Probe序列5’第67位修飾U。
所述的均相反應液,包括內切酶IV、外切酶Ⅲ、待測物UDG、PBS。
所述的內切酶IV濃度為1 U/mL,所述的外切酶Ⅲ濃度為10U/mL,待測物UDG的濃度為1 U/mL。
所述的PBS為10mM Tris-HCL、50mM NaCl、10mM MgCl2、1mM DTT,pH=7.9。
上述生物傳感器的制備方法,包括以下步驟:
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