[發明專利]一種乳桿菌特異性數據庫及其應用

在審

• 申請號: 201910012202.0
• 申請日: 2019-01-07
• 公開（公告）號: CN109680082A
• 公開（公告）日: 2019-04-26
• 發明（設計）人: 徐巖;吳群;杜如冰
• 申請（專利權）人: 江南大學
• 主分類號: C12Q1/689
• 分類號: C12Q1/689;C12Q1/686;C12Q1/06;C40B40/06;C12M1/34;C12M1/00
• 代理公司: 哈爾濱市陽光惠遠知識產權代理有限公司 23211
• 代理人: 張勇

1.一種乳桿菌特異性數據庫，其特征在于，所述數據庫中至少包括2種以上不同乳桿菌的

(i)特異性基因的序列；或者

(ii)特異性基因的NCBI登錄號，或者其他基因或蛋白數據庫登錄號；或者

(iii)擴增特異性基因的引物序列。

2.根據權利要求1所述的乳桿菌特異性數據庫，其特征在于，所述2種以上乳桿菌選自如下16種乳桿菌：Lactobacillus acetotolerans、Lactobacillus brevis、Lactobacillusbuchneri、Lactobacillus acidipiscis、Lactobacillus crustorum、Lactobacilluscurvatus、Lactobacillus delbrueckii、Lactobacillus diolivorans、Lactobacillusfermentum、Lactobacillus harbinensis、Lactobacillus hilgardii、Lactobacillusjohnsonii、Lactobacillus murinus、Lactobacillus panis、Lactobacillus plantarum、Lactobacillus reuteri。

3.根據權利要求1所述的乳桿菌特異性數據庫，其特征在于，所述特異性基因的序列為NCBI上登錄號如下所示的基因的序列中的一個或者多個。

4.一種定位乳桿菌特異性基因的裝置或方法，其特征在于，包括存儲權利要求1-3任一所述的乳桿菌特異性數據庫的模塊，或者可調取權利要求1-3任一所述的乳桿菌特異性數據庫的模塊。

5.根據權利要求4所述的裝置或方法，其特征在于，所述裝置或方法中，含有乳桿菌種類的選項；以及對應乳桿菌種類的特異性基因的序列、特異性基因的登錄號或者擴增特異性基因的引物中的任意一種以上。

6.根據權利要求4所述的裝置或方法，其特征在于，所述裝置或方法，還包括登錄模塊。

7.根據權利要求4所述的裝置或方法，其特征在于，還包括輸入裝置，用以輸入乳桿菌的種信息；以及輸出裝置，用以輸出所述乳桿菌的特異性基因信息或者可擴增特異性基因的引物。

8.一種定量或定性分析輔助乳桿菌的系統，其特征在于，包括存儲權利要求1-3任一所述的乳桿菌特異性數據庫的模塊，或者可調取權利要求1-3任一所述的乳桿菌特異性數據庫的模塊。

9.根據權利要求8所述的系統，其特征在于，所述系統還包括如下裝置中的任意一種或多種：引物設計裝置、引物合成裝置、PCR信息存儲裝置、PCR裝置、基因組提取信息存儲裝置、用于基因組提取的試劑存儲裝置等。

10.一種定性或者定量乳桿菌的方法，其特征在于，所述方法包括利用乳桿菌的

(i)特異性基因的序列；或者

(ii)特異性基因的NCBI登錄號，或者其他基因或蛋白數據庫登錄號；或者

(iii)擴增特異性基因的引物序列。

所述乳桿菌選自如下16種乳桿菌：Lactobacillus acetotolerans、Lactobacillusbrevis、Lactobacillus buchneri、Lactobacillus acidipiscis、Lactobacilluscrustorum、Lactobacillus curvatus、Lactobacillus delbrueckii、Lactobacillusdiolivorans、Lactobacillus fermentum、Lactobacillus harbinensis、Lactobacillushilgardii、Lactobacillus johnsonii、Lactobacillus murinus、Lactobacillus panis、Lactobacillus plantarum、Lactobacillus reute。