[發(fā)明專利]中國(guó)黃牛PPP2R2B基因4個(gè)重復(fù)缺失多態(tài)性位點(diǎn)的檢測(cè)方法及應(yīng)用

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201910011409.6
• 申請(qǐng)日: 2019-01-07
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN109628609B
• 公開(kāi)（公告）日: 2021-11-12
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 王淑輝;孫秀柱;李澤;樊路杰;王國(guó)艷;江鈞益;劉世榮;易曉華
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 西北農(nóng)林科技大學(xué)
• 主分類號(hào): C12Q1/6888
• 分類號(hào): C12Q1/6888
• 代理公司: 西安恒泰知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所 61216
• 代理人: 李鄭建

1.一種中國(guó)黃牛PPP2R2B基因4個(gè)重復(fù)缺失多態(tài)性位點(diǎn)的檢測(cè)方法，其特征在于，該方法以中國(guó)黃牛全基因組DNA為模板，用引物對(duì)P1、P2、P3和P4通過(guò)PCR擴(kuò)增中國(guó)黃牛PPP2R2B基因部分片段；再對(duì)PCR擴(kuò)增得到的產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳；根據(jù)電泳結(jié)果鑒定中國(guó)黃牛PPP2R2B基因上的插入/缺失多態(tài)性位點(diǎn)的基因型；其中：

引物對(duì)P1為：

上游引物：5'-GCATCAGCCCTAAATCCCA-3'；

下游引物：5'- CAGAAAATATCAAAATGCCAGAA-3'；

引物對(duì)P2為：

上游引物：5'-AGTCTTAGTTTAGAGGGCTTCC-3'；

下游引物：5'- GCTTAGTCATTCAGCCATTTT-3'；

引物對(duì)P3為：

上游引物：5'-GCTGATCCCTCAAATATGGC-3'；

下游引物：5'-TGAAAGCGTCAAGAGCAAG-3'；

引物對(duì)P4為：

上游引物：5'-CAACTGGAAAAGCTAAGGC-3'；

下游引物：5'-TGGAATCAGATGGAAGAAAG-3'；

所述中國(guó)黃牛PPP2R2B基因上的插入/缺失多態(tài)性位點(diǎn)是指：

中國(guó)黃牛PPP2R2B基因位點(diǎn)1（L1）AC_000164.1

g.60192910_60192929del：GCTTGCTATATGTGATTCTG；

中國(guó)黃牛PPP2R2B基因位點(diǎn)2（L2）AC_000164.1

g.60117040_60117065del：GCCTGAAAAATCCCATGGACAGAGAA；

中國(guó)黃牛PPP2R2B基因位點(diǎn)3（L3）AC_000164.1

g.60254430_60254454del：TCCCCAATCCAGCAATGCTGGATGT；和

中國(guó)黃牛PPP2R2B基因位點(diǎn)4（L4）AC_000164.1

g.60149610_60149643del：CATCTTTTCAAAATTTCTATAGCATTCTATAGCA；

上述四個(gè)位點(diǎn)上存在的不同的重復(fù)缺失多態(tài)性片段；

電泳結(jié)果鑒定如下：

中國(guó)黃牛PPP2R2B基因上位點(diǎn)1（L1）的插入/缺失多態(tài)性位點(diǎn)的基因型分別為：

插入/插入（II）基因型，表現(xiàn)為197bp一條帶紋；

插入/缺失（ID）基因型，表現(xiàn)為197bp和177bp兩條帶紋；

缺失/缺失（DD）基因型，表現(xiàn)為177bp一條帶紋；

其中，缺失/缺失（DD）基因型作為秦川牛生長(zhǎng)性狀的分子標(biāo)記，與秦川牛的體高、胸圍、胸寬、胸深、臀寬、臀長(zhǎng)相關(guān)；

插入/缺失（ID）基因型作為南陽(yáng)牛生長(zhǎng)性狀的分子標(biāo)記，與南陽(yáng)牛體高、體長(zhǎng)、胸圍、腹圍、臀寬、腰角寬、重高比相關(guān)；

中國(guó)黃牛PPP2R2B基因上位點(diǎn)2（L2）的插入/缺失多態(tài)性位點(diǎn)的基因型分別為：

插入/插入（II）基因型，表現(xiàn)為235bp一條帶紋；

插入/缺失（ID）基因型，表現(xiàn)為235bp和209bp兩條帶紋；

其中，插入/缺失（ID）基因型作為南陽(yáng)牛或秦川牛生長(zhǎng)性狀的分子標(biāo)記，與南陽(yáng)牛的體長(zhǎng)、胸圍、體重、腹圍、臀寬、腰角寬、重高比相關(guān)；與秦川牛的胸圍、胸寬、胸深、臀寬、腹圍、臀長(zhǎng)相關(guān)；

中國(guó)黃牛PPP2R2B基因上位點(diǎn)3（L3）的插入/缺失多態(tài)性位點(diǎn)的基因型分別為：

插入/插入（II）基因型，表現(xiàn)為284bp一條帶紋；

插入/缺失（ID）基因型，表現(xiàn)為284bp和259bp兩條帶紋；

缺失/缺失（DD）基因型，表現(xiàn)為259bp一條帶紋；

其中，插入/插入（II）基因型作為南陽(yáng)牛生長(zhǎng)性狀的分子標(biāo)記，與南陽(yáng)牛的體高、體長(zhǎng)、胸圍、腹圍、臀寬、腰角寬、臀高、體重、重高比相關(guān)；

插入/缺失（ID）基因型作為秦川牛生長(zhǎng)性狀的分子標(biāo)記，與秦川牛的體高、胸圍、胸寬、胸深、腰高、臀高、臀長(zhǎng)、腹圍、臀寬相關(guān)；

中國(guó)黃牛PPP2R2B基因上位點(diǎn)4（L4）的插入/缺失多態(tài)性位點(diǎn)的基因型分別為：

插入/插入（II）基因型，表現(xiàn)為247bp一條帶紋；

插入/缺失（ID）基因型，表現(xiàn)為247bp和213bp兩條帶紋；

缺失/缺失（DD）基因型，表現(xiàn)為213bp一條帶紋；

其中，插入/缺失（ID）基因型作為南陽(yáng)牛或秦川牛生長(zhǎng)性狀的分子標(biāo)記，與南陽(yáng)牛的體長(zhǎng)、體高、胸圍、腹圍、臀寬、腰角寬、臀高、體重、重高比相關(guān)；與秦川牛的體高、胸圍、胸寬、胸深、腰高、臀高、體長(zhǎng)、臀長(zhǎng)、腹圍、臀寬相關(guān)。