[發明專利]基于Cpf1的植物轉錄調控系統

在審

• 申請號: 201880090026.6
• 申請日: 2018-12-21
• 公開（公告）號: CN112204147A
• 公開（公告）日: 2021-01-08
• 發明（設計）人: M·拉布斯;A·赫梅爾;梅鈺
• 申請（專利權）人: 科沃施種子歐洲股份兩合公司
• 主分類號: C12N15/82
• 分類號: C12N15/82;C12N15/63;A01H4/00;A01H1/08
• 代理公司: 永新專利商標代理有限公司 72002
• 代理人: 左路;區斌

1.一種合成轉錄因子或編碼其的核苷酸序列，所述合成轉錄因子包含至少一個識別結構域和至少一個激活結構域，其中所述合成轉錄因子配置為調控細胞系統中形態發生基因的表達。

2.一種合成轉錄因子或編碼其的核苷酸序列，所述合成轉錄因子包含至少一個識別結構域和至少一個激活結構域，其中所述合成轉錄因子配置為激活細胞系統中內源基因的表達。

3.根據權利要求1或2所述的合成轉錄因子，其中所述至少一個識別結構域是至少一個解除武裝的CRISPR/核酸酶系統，或是至少一個解除武裝的CRISPR/核酸酶系統的片段。

4.根據權利要求3所述的合成轉錄因子，其中所述至少一個解除武裝的CRISPR/核酸酶系統是CRISPR/dCpf1系統，其中所述至少一個解除武裝的CRISPR/核酸酶系統包含至少一個向導RNA。

5.根據權利要求1或2所述的合成轉錄因子，其中所述至少一個激活結構域選自酸性轉錄激活結構域，優選地，其中所述至少一個激活結構域來自水稻白葉枯病菌(Xanthomonasoryzae)的無毒基因、單純皰疹病毒的VP16或四聚體VP64、VPR、SAM、Scaffold、Suntag、P300、VP160或其任何組合。

6.根據權利要求1或2所述的合成轉錄因子，其中所述至少一個激活結構域相對于所述至少一個識別結構域位于N-末端和/或C-末端。

7.根據權利要求1所述的合成轉錄因子，其中所述形態發生基因選自BBM、WUS(包括WUS2)、WOX基因、WUS或BBM同源物、Lec1、Lec2、WIND1、ESR1、PLT3、PLT5、PLT7、IPT、IPT2、Knotted1和RKD4。

8.根據權利要求1所述的合成轉錄因子，其中所述合成轉錄因子配置為通過結合位于相對于起始密碼子一定距離處的調控區域而調控所述形態發生基因的表達，優選地調控所述形態發生基因的轉錄。

9.根據權利要求2所述的合成轉錄因子，其中，所述內源基因選自：編碼對非生物脅迫的抗性或耐受性的基因，所述非生物脅迫包括干旱脅迫、滲透脅迫、熱脅迫、冷脅迫、氧化脅迫、重金屬脅迫、氮缺乏、磷缺乏、鹽脅迫或漬水；編碼除草劑抗性的基因，所述除草劑抗性包括草甘膦抗性、草銨膦/磷絲菌素抗性、潮霉素抗性、2,4-D抗性或耐受性、原卟啉原氧化酶(PPO)抑制劑抗性或耐受性、ALS抑制劑抗性或耐受性和麥草畏抗性或耐受性；編碼對生物脅迫的抗性或耐受性的基因，包括病毒抗性基因、真菌抗性基因、細菌抗性基因、昆蟲抗性基因；或編碼產量相關性狀的基因，所述產量相關性狀包括抗倒伏性、開花時間、抗落粒性、種子顏色、胚乳成分或營養含量。

10.根據權利要求1或2所述的合成轉錄因子，其中所述合成轉錄因子和/或所述至少一個識別結構域包含SEQ ID NO:276、277、282、283、284、288、289、290中任一個所示的序列，或包含與SEQ ID NO:276、277、282、283、284、288、289、290中的任一個在全長上具有至少85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％或99％相同性的序列。

11.根據權利要求1或2所述的合成轉錄因子，其中所述細胞系統選自至少一個真核細胞或真核生物體，優選地，其中所述至少一個真核細胞是至少一個植物細胞，和/或其中所述至少一個真核生物體是植物或植物的一部分。

12.如權利要求11所述的合成轉錄因子，其中所述植物的至少一部分選自葉、莖、根、初生胚根、花、花部分、花瓣、果實、花粉、花粉管、花藥花絲、胚珠、胚囊、卵細胞、子房、合子、胚、合子胚、體細胞胚、頂端分生組織、維管束、中柱鞘、種子、根和插枝。