[發明專利]診斷菌群失調的方法

在審

• 申請號: 201880047453.6
• 申請日: 2018-07-17
• 公開（公告）號: CN110892081A
• 公開（公告）日: 2020-03-17
• 發明（設計）人: M·史密斯
• 申請（專利權）人: 智能DNA股份有限公司
• 主分類號: C12Q1/689
• 分類號: C12Q1/689;C12Q1/06;G01N33/50;G01N33/569
• 代理公司: 中國國際貿易促進委員會專利商標事務所 11038
• 代理人: 陳曉娜

1.一種確定受試者中腸易激綜合征(IBS)亞型的方法，其包括確定來自所述受試者或所述受試者的環境的樣品中至少10個細菌屬的豐度，其中所述至少10個細菌屬選自嗜堿菌屬(Alkaliphilus)、鞘氨醇單胞菌屬(Sphingomonas)、Pelotomaculum、埃格特菌屬(Eggerthella)、真桿菌屬(Eubacterium)、副球菌屬(Paracoccus)、Lachnoclostridium、芽孢桿菌屬(Bacillus)、棍狀厭氧菌屬(Anaerorhabdus)、放線菌屬(Actinomyces)、甲基桿菌屬(Methylobacterium)、假單胞菌屬(Pseudomonas)、鏈球菌屬(Streptococcus)、葡萄球菌屬(Staphylococcus)、Peptoclostridium、Erysipelatoclostridium、Anaerostipes、薩頓氏菌屬(Sutterella)、短波單胞菌屬(Brevundimonas)、梭菌屬(Clostridium)、消化鏈球菌科(Peptostreptococcaceae)、史雷克氏菌屬(Slackia)、芽單胞菌屬(Blastomonas)、乳桿菌屬(Lactobacillus)、克雷伯氏菌屬(Klebsiella)、土壤桿菌屬(Agrobacterium)以及葉桿菌屬(Phyllobacterium)。

2.根據權利要求1所述的方法，其中確定至少20個細菌屬的豐度。

3.一種確定受試者中IBS亞型的方法，其包括確定來自所述受試者或所述受試者的環境的樣品中至少5個細菌種的豐度，其中所述至少5個細菌種選自小克里斯滕森氏菌(Christensenella minuta)、Papillibacter cinnamivorans、沃氏嗜膽菌(Bilophilawadsworthia)、布氏瘤胃球菌(Ruminococcus bromii)、Soleaferrea massiliensis、嗜粘蛋白阿克曼氏菌(Akkermansia muciniphila)、顫桿菌(Oscillibacter valericigenes)、Desulfitobacterium frappieri、Anaerofilum pentosovorans、Lactobacillusjaponicas、Catabacter hongkongensis、球孢梭菌(Clostridium sporosphaeroides)以及普拉梭菌(Faecalibacterium prausnitzii)。

4.根據權利要求3所述的方法，其中確定至少10個細菌種的豐度。