[發(fā)明專利]生物標(biāo)志在鑒定將對(duì)用PRMT5抑制劑治療有響應(yīng)的癌癥患者中的用途

在審

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201880013998.5
• 申請(qǐng)日: 2018-02-26
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN110382707A
• 公開(kāi)（公告）日: 2019-10-25
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: D.布瑞梅;L.貝克;D.S.加弗尼;C.H.莫伊
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 詹森藥業(yè)有限公司
• 主分類號(hào): C12Q1/48
• 分類號(hào): C12Q1/48;C12Q1/6886;G01N33/574
• 代理公司: 中國(guó)專利代理(香港)有限公司 72001
• 代理人: 李進(jìn);黃希貴

本發(fā)明涉及一種鑒定患者的方法，所述患者可能對(duì)用蛋白質(zhì)精氨酸N?甲基轉(zhuǎn)移酶5(PRMT5)抑制劑治療有響應(yīng)，所述方法包括：評(píng)估來(lái)自所述患者的生物學(xué)樣品中是否存在剪接體改變，其中任何所述改變的存在指示相比不存在任何所述突變或改變，所述患者對(duì)用所述PRMT5抑制劑治療有響應(yīng)的可能性更高。

技術(shù)領(lǐng)域

本文提供了鑒定患者的方法和治療所述患者的方法，所述患者對(duì)用蛋白質(zhì)精氨酸N-甲基轉(zhuǎn)移酶5抑制劑治療有響應(yīng)的可能性高。

背景技術(shù)

蛋白質(zhì)精氨酸N-甲基轉(zhuǎn)移酶5(PRMT5)，也被描述為Hsl7、Jbp1、Skb1、Capsuleen或Dart5，是負(fù)責(zé)精氨酸的單二甲基化作用和對(duì)稱二甲基化作用的主要甲基轉(zhuǎn)移酶之一。PRMT5屬于Sym Arg二甲基轉(zhuǎn)移酶家族。催化活性與致癌肺驅(qū)動(dòng)途徑激活(剪接和WNT信號(hào)傳導(dǎo))以及腫瘤抑制因子和腫瘤免疫原性趨化因子的表觀遺傳抑制相關(guān)聯(lián)。蛋白質(zhì)水平和定位與較高的細(xì)胞甲基化、支氣管上皮表型的喪失和不良的疾病進(jìn)展相關(guān)。

組蛋白和非組蛋白上的翻譯后精氨酸甲基化對(duì)于多種生物學(xué)過(guò)程是至關(guān)重要的，例如基因組組織、轉(zhuǎn)錄、分化、剪接體功能、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和細(xì)胞周期進(jìn)程的調(diào)控、干細(xì)胞和T細(xì)胞命運(yùn)。后生動(dòng)物的PRMT5與也稱為Wdr77的甲基轉(zhuǎn)移酶復(fù)合體蛋白50(MEP50)、雄激素受體輔激活物p44和Valois形成功能性復(fù)合體。升高的PRMT5-MEP50蛋白質(zhì)水平和細(xì)胞質(zhì)累積兩者均與癌癥腫瘤發(fā)生有關(guān)，并在最近才與不良的臨床結(jié)果相關(guān)。除綜合性酶學(xué)研究之外，解決PRMT5-MEP50復(fù)合體的催化功能和支架功能兩者的細(xì)胞拯救實(shí)驗(yàn)證實(shí)了蛋白質(zhì)水平、定位和酶功能之間的致癌聯(lián)系。這種相關(guān)性使PRMT5成為針對(duì)癌癥和其他疾病的必需小分子藥物靶標(biāo)。

PRMT5是II型PRMT亞家族的成員，該亞家族使用S-腺苷基甲硫氨酸(SAM)在組蛋白和非組蛋白底物上產(chǎn)生對(duì)稱二甲基化的精氨酸、和S-腺苷基高半胱氨酸(SAH)。PRMT5活性的調(diào)節(jié)通過(guò)大量不同的結(jié)合配偶體、翻譯后修飾、miRNA和亞細(xì)胞定位發(fā)生。Arg3上的組蛋白H2A和H4以及Arg8上的組蛋白H3的甲基化調(diào)節(jié)染色質(zhì)組織，以特異性抑制/激活參與分化、轉(zhuǎn)化、細(xì)胞周期進(jìn)展和腫瘤抑制的基因轉(zhuǎn)錄物。此外，PRMT5介導(dǎo)的Arg3上組蛋白H4的甲基化可能募集DNA甲基轉(zhuǎn)移酶DNMT3A以偶聯(lián)組蛋白和DNA甲基化以進(jìn)行長(zhǎng)期基因沉默。

非組蛋白甲基化可以在細(xì)胞質(zhì)或細(xì)胞核中發(fā)生，這取決于PRMT5的細(xì)胞定位。核剪接體組裝所需的Sm蛋白D1和D3的甲基化作為含有“甲基轉(zhuǎn)移酶復(fù)合體”的PRMT5的一部分發(fā)生在細(xì)胞質(zhì)中。通過(guò)小鼠神經(jīng)干細(xì)胞中的條件性PRMT5敲除提供了PRMT5參與剪接的進(jìn)一步證據(jù)。缺乏PRMT5的細(xì)胞顯示內(nèi)含子的選擇性保留和具有弱5’供體位點(diǎn)的外顯子的跳躍。除了在剪接中的作用外，PRMT5通過(guò)直接甲基化關(guān)鍵信號(hào)結(jié)節(jié)如p53、30EGFR、26CRAF、3PI3K/AKT、64和NFkB影響參與細(xì)胞命運(yùn)和體內(nèi)平衡的關(guān)鍵途徑。

由于PRMT5是主要的sym-Arg甲基轉(zhuǎn)移酶之一并且涉及多種細(xì)胞過(guò)程，因此增加的蛋白質(zhì)表達(dá)似乎是其致腫瘤性的重要因素。有趣的是，PRMT5在套細(xì)胞淋巴瘤(MCL)中的翻譯似乎受到miRNA的調(diào)節(jié)。盡管與正常B淋巴細(xì)胞相比，MCL細(xì)胞顯示較少的mRNA和較慢的PRMT5轉(zhuǎn)錄率，但是PRMT5水平以及H3R8和H4R3的甲基化顯著增加。結(jié)合PRMT5的3’UTR區(qū)域的miRNA的重新表達(dá)降低了PRMT5蛋白質(zhì)水平。引人注目的是，在人PRMT5基因中發(fā)現(xiàn)PRMT5反義RNA，這支持了特定翻譯調(diào)控的假設(shè)，而不是高mRNA表達(dá)水平。