[發(fā)明專利]用于腫瘤治療的靶基因識別方法在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201880011110.4 | 申請日： | 2018-02-05 |
| 公開（公告）號： | CN110603593A | 公開（公告）日： | 2019-12-20 |
| 發(fā)明（設(shè)計）人： | 南都鉉;李振求;J·K·H·史 | 申請（專利權(quán)）人： | 社會福祉法人三星生命公益財團 |
| 主分類號： | G16B20/00 | 分類號： | G16B20/00;G16B40/00;C12Q1/68 |
| 代理公司： | 11410 北京市中倫律師事務(wù)所 | 代理人： | 鐘錦舜 |
| 地址： | 韓國*** | 國省代碼： | 韓國;KR |
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| 摘要： | |||
| 搜索關(guān)鍵詞： | 樣本 腫瘤 藥物敏感度 遺傳變異 靶基因 異質(zhì)性 藥物篩選 腫瘤治療 測量 分析 采集 | ||
根據(jù)本發(fā)明的用于腫瘤治療的靶基因識別方法包括：從患者的腫瘤中采集多個樣本的步驟；分析所述多個樣本的遺傳變異的步驟；對所述多個樣本進行藥物篩選以測量每個樣本的藥物敏感度的步驟；利用所述遺傳變異的分析結(jié)果及所述藥物敏感度的測量結(jié)果來分析所述腫瘤的異質(zhì)性(heterogeneity)的步驟；以及利用所述腫瘤的異質(zhì)性的分析結(jié)果來識別所述腫瘤的靶基因的步驟。
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明涉及一種用于腫瘤治療的靶基因的識別方法，具體地，涉及一種采集多個腫瘤樣本以通過基因變異分析與藥物篩選來找出腫瘤的祖先變異(ancestral mutation)的靶基因識別方法。
背景技術(shù)
腫瘤是因細胞的遺傳變異而異常地生長的細胞團塊。此時，從導(dǎo)致初期腫瘤發(fā)生的祖先突變(ancestral genetic alteration)開始發(fā)生各種次生遺傳突變(secondarygenetic alteration)，因此，腫瘤可以根據(jù)其細胞具有各種不同的基因變異。因此，難以決定選擇哪種基因為靶(target)基因以治療這些腫瘤。
例如，在患者體內(nèi)發(fā)生第一腫瘤與第二腫瘤時，如果用于治療第一腫瘤的藥物以只發(fā)生在第一腫瘤的基因變異作為目的的話，這種藥物可能對第二腫瘤沒有效果，甚至可以惡化第二腫瘤。因此，探明哪種基因變異為祖先驅(qū)動(ancestral driver)變異是重要的。
最近出現(xiàn)分析腫瘤內(nèi)異質(zhì)性(intratumor heterogeneity)的方法。腫瘤內(nèi)異質(zhì)性意味腫瘤細胞的多元性。例如，Marco Gerlinger.et al.的現(xiàn)有技術(shù)文獻2公開了一種方法，所述方法是在從腫瘤的多個部位采集細胞后獲得遺傳信息來從每個細胞共同具有的(ubiquitous)突變中分析各細胞固有(private)的突變以分析腫瘤的系統(tǒng)關(guān)系(phylogenetic relationships)的方法。
類似地，美國公開專利第2015-0227687號也公開了利用遺傳信息來決定腫瘤內(nèi)異質(zhì)性的系統(tǒng)以及方法。
發(fā)明內(nèi)容
然而，上述的方法只是單純分析腫瘤內(nèi)異質(zhì)性或腫瘤的系統(tǒng)關(guān)系的方法，并沒有實際提出發(fā)掘具有最佳治療效果的靶基因的方法。并且，基因變異分析有一定程度的不準確性而并不是能夠始終準確地分析腫瘤內(nèi)異質(zhì)性。換言之，在現(xiàn)有的方法中存在沒有可以檢驗基因變異分析是否正確的其他方法的問題。
為了解決包括上述問題的諸多問題，本發(fā)明的目的在于提供靶基因識別方法，其通過基因變異分析與藥物篩選互補性地識別用于腫瘤治療的靶基因以提出最佳的治療方法。然而，所述課題只是示例性的，本發(fā)明的范圍不受所述課題的限制。
根據(jù)本發(fā)明的用于腫瘤治療的靶基因識別方法包括：從患者的腫瘤中采集多個樣本的步驟；分析所述多個樣本的遺傳變異的步驟；對所述多個樣本進行藥物篩選以測量每個樣本的藥物敏感度的步驟；利用所述遺傳變異的分析結(jié)果及所述藥物敏感度的測量結(jié)果來分析所述腫瘤的腫瘤內(nèi)異質(zhì)性(intratumor heterogeneity)的步驟；以及利用所述分析腫瘤內(nèi)異質(zhì)性的分析結(jié)果來識別所述腫瘤的靶基因的步驟。
所述采集多個樣本的步驟可以是從所述患者的腫瘤的不同部位采集樣本的步驟。
所述采集多個樣本的步驟可以是從所述患者的在不同時間發(fā)生的腫瘤中分別采集樣本的步驟。
所述分析多個樣本的遺傳變異的步驟可以是通過下一代測序技術(shù)(NGS:Next-generation sequencing)進行的。
在所述測量藥物敏感度的步驟使用的藥物可以是抗癌劑(anticancer agent)。
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