[發明專利]檢測CYP2C19基因多態性位點的引物組、試劑盒和方法

在審

• 申請號: 201811654430.X
• 申請日: 2018-12-30
• 公開（公告）號: CN109468378A
• 公開（公告）日: 2019-03-15
• 發明（設計）人: 朱陽進;趙薇薇;胡昌明;徐艷艷;湯愿笑;甘立佳;于世輝;嚴慧
• 申請（專利權）人: 廣州金域醫學檢驗中心有限公司
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 北京超凡志成知識產權代理事務所(普通合伙) 11371
• 代理人: 周文波

本發明公開了及一種檢測CYP2C19基因多態性位點的引物組、試劑盒和方法，涉及基因多態性檢測技術領域。本發明公開的引物組包括引物組合1?引物組合3中的一種或多種的組合。采用該引物組可以同時對CYP2C19基因上三個多態性位點進行檢測，具有檢測效率高、時間快、結果判讀簡單、結果準確等特點。

技術領域

本發明涉及基因多態性檢測技術領域，具體而言，涉及一種檢測CYP2C19基因多態性位點的引物組、試劑盒和方法。

背景技術

歸屬于細胞色素P450家族的CYP2C19酶是大量臨床藥物的主要代謝酶，可參與代謝抗抑郁類、苯二氮卓類、質子泵抑制劑、美芬妥英和抗血小板前藥氯吡格雷等藥物。同其他CYP450基因一樣，CYP2C19中遺傳物質變異及其可變的表達差異都會引起個體間CYP2C19底物代謝的差異。

經研究表明，CYP2C19酶對底物的代謝能力差異主要由基因中3個多態性位點(CYP2C19*2，*3和*17)引起，進而可將個體分為超快速、廣泛、中間或若代謝者。CYP2C19*17(rs12248560)的突變位點在啟動子區，為單堿基C到T的轉換，可產生GATA轉錄因子家族的共有結合位點，將導致CYP2C19表達和活性增加，在亞洲人群中存在有3％的突變。CYP2C19*2(rs4244285)是存在于第5外顯子區的同義G到A轉換，會產生異常剪接位點，進而改變了mRNA閱讀框架，截短了蛋白導致相關功能喪失，在亞洲人群中等位基因頻率達到29-35％。CYP2C19*3(rs4986893)是存在于第4外顯子區的G到A轉換，導致蛋白翻譯過早被終止，在亞洲人群中等位基因頻率達到2-9％。

基因表型不同，藥物的治療效果就存在顯著差異。因此為取得最佳療效，醫生應依據患者的基因型資料選取合適的藥物和劑量，即根據個體遺傳特征(基因型)，選擇有效的治療方案。實現“基因導向型”個體化藥物治療，“量體用藥”。但現有檢測CYP2C19基因的方法存在一些問題：

(1)檢測效率低、通量低、檢測成本高：傳統的檢測方法完成一次檢測周期較長，需要實驗人員較多；同時檢測配套試劑中，需要熒光標記引物或ddNTP或長片段引物，成本較高；

(2)基因結構復雜，結果準確度低：CYP2C19基因位于第10號染色體，該染色體內重復序列多，特異性擴增難、檢測難；

(3)干擾因素多：實驗流程長，樣品孔反復開蓋、加樣次數多；同時同一反應內多個基因位點競爭性擴增，相關干擾大。

(4)結果判讀復雜：傳統檢測方法得到的原始結果均無法在儀器上直觀顯示檢測結果，需要實驗員自行設置參數分析；

(5)失敗率高：傳統的檢測方法需要用到熒光標記的引物或ddNTP或是長片段引物，在室溫或是光照條件下暴露較長時間，或是反復凍融次數過多極易導致檢測失敗。

鑒于此，特提出本發明。

發明內容

本發明的目的在于提供一種檢測CYP2C19基因多態性位點的引物組，采用該引物組可以同時對CYP2C19基因上三個多態性位點進行檢測，具有檢測效率高、時間快、結果判讀簡單、結果準確等特點。

本發明的另一目的在于提供一種檢測CYP2C19基因多態性位點的試劑盒，該試劑盒可以同時對CYP2C19基因上三個多態性位點進行檢測，具有檢測效率高、時間快、結果判讀簡單、結果準確等特點。

本發明的另一目的在于提供一種檢測CYP2C19基因多態性位點的方法，該方法可以同時對CYP2C19基因上三個多態性位點進行檢測，具有檢測效率高、時間快、結果判讀簡單、結果準確等特點。

本發明是這樣實現的：

一方面，本發明提供了一種檢測CYP2C19基因多態性位點的引物組，其包括以下引物組合中的一種或多種的組合：