[發(fā)明專利]一種自動解析穩(wěn)定同位素標(biāo)記糖鏈定量質(zhì)譜數(shù)據(jù)的方法

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201811650390.1
• 申請日: 2018-12-31
• 公開（公告）號: CN109738532B
• 公開（公告）日: 2022-07-22
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 黃江銘;蔣碧云;曹緯倩;楊芃原
• 申請（專利權(quán)）人: 復(fù)旦大學(xué)
• 主分類號: G01N30/02
• 分類號: G01N30/02;G01N30/06;G01N33/68
• 代理公司: 上海正旦專利代理有限公司 31200
• 代理人: 陸飛;陸尤

1.一種自動解析穩(wěn)定同位素標(biāo)記糖鏈定量質(zhì)譜數(shù)據(jù)的方法，其特征在于，基于糖鏈的理論同位素分布模式和質(zhì)譜碎裂特性，通過最高理論同位素強(qiáng)度峰定量，對同位素交疊進(jìn)行準(zhǔn)確的校正，具體步驟如下：

（1）對公開數(shù)據(jù)庫中的糖鏈信息，計算出對應(yīng)的每種糖型對應(yīng)的元素組成，計算出不同元素天然同位素的二項分布，并進(jìn)行線性加和，生成理論同位素峰分布；

（2）根據(jù)步驟（1）的結(jié)果，挑選用于定量的同位素峰；

（3）對于標(biāo)記質(zhì)量差較小的同位素標(biāo)記定量時，對同位素峰進(jìn)行準(zhǔn)確的校正和交疊部分扣除；

（4）通過校正以后的峰強(qiáng)度的比，輸出定量結(jié)果；

步驟（2）中所述挑選用于定量的同位素峰，是挑選強(qiáng)度最高的同位素峰進(jìn)行定量；糖鏈同位素峰挑選原則為：分子量在2250以下的選擇第一同位素峰作為定量基準(zhǔn)峰，2250-3850的分子量中第二同位素峰作為定量基準(zhǔn)峰，以此類推；

步驟（3）中所述對同位素峰進(jìn)行準(zhǔn)確的 校正，對于單電荷的分子，采用如下算法：設(shè)H,L分別為輕、重標(biāo)記選定的質(zhì)譜譜峰報道值，Htrue, Ltrue為輕重標(biāo)記的真實(shí)質(zhì)譜峰強(qiáng)度，i表示最高強(qiáng)度同位素峰相比單同位素峰的位置，m表示搜庫出來的糖鏈對應(yīng)在譜圖上的真實(shí)質(zhì)荷比，Ltrue、Htrue前面的系數(shù)由gQuant軟件直接導(dǎo)出；于是校正算式為：

式中，△m表示所用的同位素標(biāo)記試劑的輕重同位素質(zhì)量數(shù)差異，l和 h分別表示數(shù)據(jù)庫對應(yīng)糖鏈的同位素峰分布的計算值；下標(biāo)i，i+△m，i-△m分別表示選定用于積分的峰序數(shù)，選定用于積分的峰序數(shù)增加△m，選定用于積分的峰序數(shù)減去△m；

步驟（4）中所述通過校正以后的峰強(qiáng)度的比，輸出定量結(jié)果，是將該糖鏈不同綴合物、不同價態(tài)的定量比值疊加，得到最終的定量比值，公式如下：

式中，第一項表示所有的綴合物的加和，將加納峰加鉀峰都加上，第二項表示所有的價態(tài)，將帶一個電荷的、兩個電荷的都加上。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其特征在于，采用gQuant軟件計算數(shù)據(jù)庫中的糖鏈的理論同位素分布，所述數(shù)據(jù)庫是理論糖鏈數(shù)據(jù)庫、實(shí)驗獲得糖鏈數(shù)據(jù)庫或者使用者指定的糖庫。