[發明專利]一種與蘇淮豬肌肉滴水損失相關的SNP標記及檢測方法

在審

• 申請號: 201811633961.0
• 申請日: 2018-12-29
• 公開（公告）號: CN109825600A
• 公開（公告）日: 2019-05-31
• 發明（設計）人: 黃瑞華;高琛;李平華;周五朵;王彬彬;蒲廣;王歡;蘭亭旭;牛培培;張總平;李強
• 申請（專利權）人: 南京農業大學
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 南京天華專利代理有限責任公司 32218
• 代理人: 傅婷婷;徐冬濤

1.一種與蘇淮豬肌肉滴水損失相關的SNP標記，特征在于所述SNP標記為國際豬基因組11.1版本參考序列豬6號染色體上rs337473375核苷酸位點，表現為C/T多態性，所述SNP標記與蘇淮豬肌肉的滴水損失值極顯著相關，TT型個體滴水損失極顯著高于CT型和CC型。

2.一種基于權利要求1所述的SNP標記開發分子標記的方法，其特征在于以含有權利要求1所述的SNP標記的苷核酸序列為基礎序列，設計引物對，以蘇淮豬基因組DNA為模板進行PCR擴增，使權利要求1所述的SNP標記轉化為分子標記。

3.根據權利要求2所述的方法，其特征在于所述的引物對序列為上游引物：SEQID NO：2，下游引物：SEQ ID NO：3，所述的分子標記序列如SEQ ID NO：1所示，所述的位點位于第166位，存在C/T多態性。

4.按照權利要求2或3所述的方法得到的分子標記。

5.根據權利要求4所述的分子標記，其特征在于分子標記序列如SEQ ID NO：1所示，所述的SNP位點位于第166位，存在C/T多態性。

6.一種用于權利要求1所述的SNP標記的引物對，其特征在于上游引物為：SEQID NO：2，下游引物為：SEQ ID NO：3。

7.一種用于檢測權利要求1所述的SNP標記的方法，其特征在于包含PCR擴增蘇淮豬基因組中含有權利要求1所述的SNP標記的一段序列，對擴增產物進行測序，判讀該位點的C/T多態性。

8.根據權利要求7所述的方法，其特征在于包括以下步驟：

(1)取蘇淮豬的耳組織樣品并提取總DNA；

(2)用已提取的蘇淮豬基因組DNA為模板，使用權利要求6所述的引物對進行PCR擴增；

(3)擴增產物進行測序，分析測序結果，判讀在SEQ ID NO：1第166位的C/T多態性。

9.權利要求6所述的引物對在篩選低滴水損失的蘇淮豬品系中的應用。

10.一種篩選肌肉低滴水損失的蘇淮豬品系的方法，其特征在于包括檢測蘇淮豬國際豬基因組11.1版本參考序列豬6號染色體上rs337473375核苷酸位點的基因型，選育rs337473375核苷酸位點的CC型個體作為種豬。