[發明專利]一種基于高通量測序技術檢測DMD基因變異的引物及其應用在審
| 申請號: | 201811633167.6 | 申請日: | 2018-12-29 |
| 公開(公告)號: | CN109554443A | 公開(公告)日: | 2019-04-02 |
| 發明(設計)人: | 任緒義;張鋒;金亞南;周韻;趙鈴鈴 | 申請(專利權)人: | 杭州迪安醫學檢驗中心有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6858 | 分類號: | C12Q1/6858;C12Q1/6883;C12N15/11 |
| 代理公司: | 南京蘇高專利商標事務所(普通合伙) 32204 | 代理人: | 丁靜靜;肖明芳 |
| 地址: | 310030 浙江*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 檢測 高通量測序技術 外顯子缺失 核酸序列 檢測試劑 點突變 試劑盒 假肥大型肌營養不良癥 多重PCR引物 高通量測序 內含子區域 變異信息 產前診斷 基因變異 建庫技術 多重PCR 均一性 擴增子 靈敏度 外顯子 一次性 重復 患兒 引物 捕獲 發病率 應用 | ||
1.一種基于高通量測序技術檢測DMD基因變異的PCR引物,其特征在于,包括SEQ IDNO:1~SEQ ID NO:260所示的核苷酸序列。
2.根據權利要求1所述基于高通量測序技術檢測DMD基因變異的PCR引物,其特征在于,SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:260所示核苷酸序列的5’端連接有Illumina測序平臺建庫所需的序列。
3.根據權利要求2所述基于高通量測序技術檢測DMD基因變異的PCR引物,其特征在于,正向引物5’端連接序列如SEQ ID NO:261所示;反向引物5’端連接序列如SEQ ID NO:262所示。
4.一種檢測DMD基因變異的試劑盒,其特征在于,該試劑盒中包括,SEQ ID NO:1~SEQID NO:260所示核苷酸序列。
5.檢測DMD基因變異的的方法,其特征在于,該方法包括以下步驟:
(1)將SEQ ID NO.1~SEQ ID NO:260所示核苷酸序列分為兩組,SEQ ID NO:1~SEQ IDNO:130所示核苷酸序列為A組引物,SEQ ID NO:131~SEQ ID NO:260所示核苷酸序列為B組引物,以樣本DNA為模板,進行第一輪多重PCR,得到第一輪PCR產物;
(2)使用P5通用引物、P7index引物,以與第一輪PCR產物為模板進行第二輪PCR擴增,對第二輪擴增產物進行純化,獲得DMD基因變異測序文庫;
(3)文庫質控、高通量測序,對下機數據進行生物信息學分析。
6.根據權利要求5所述檢測DMD基因變異的的方法,其特征在于,所述P5通用引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:263所示,所述P7index引物的核苷酸序列為SEQ ID NO:264、六個隨機堿基、SEQ ID NO:265依次連接。
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