[發明專利]水稻廣譜抗稻瘟病基因Pigm的SNP標記開發和應用

有效

• 申請號: 201811512430.6
• 申請日: 2018-12-11
• 公開（公告）號: CN109628627B
• 公開（公告）日: 2022-03-18
• 發明（設計）人: 彭佩;江南;李為國;梁毅;肖金華
• 申請（專利權）人: 華智生物技術有限公司
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 北京市中聯創和知識產權代理有限公司 11364
• 代理人: 康秀敏;王錚

1.一種與抗稻瘟病基因Pigm緊密連鎖的SNP分子標記在檢測抗稻瘟病基因Pigm中的應用，其特征在于，所述分子標記是與抗稻瘟病基因Pigm共分離的SNP標記K_060508，所述K_060508的多態性堿基為G或A，所述K_060508位于水稻第6號染色體的第10421726位堿基處；檢測所述K_060508的引物組合包括：兩條特異性引物：Primer X：5’-CCAAGCAAATTACCACAACG-3’；Primer Y：5’-CCAAGCAAATTACCACAACA-3’；一條通用引物：Primer C：5’-TTGTTATACGGTTTAATTAAGGTGA-3’。

2.根據權利要求1所述的應用，其特征在于，所述抗稻瘟病基因Pigm緊密連鎖的SNP分子標記的檢測方法包括如下步驟：

S1、提取水稻樣品基因組DNA；

S2、以水稻基因組DNA為模板，利用權利要求1所述引物組合進行KASP反應檢測；其中，兩條特異性引物分別連接不同的熒光接頭；

S3、若只檢測到引物Primer Y所連熒光接頭對應的熒光信號，則檢測位點為堿基A，判斷水稻樣品為攜帶抗稻瘟病基因Pigm的純和型；若只檢測到引物Primer X所連熒光接頭對應的熒光信號，則檢測位點為堿基G，判斷水稻樣品為不含抗稻瘟病基因Pigm的純和型；若同時檢測到兩種熒光，則判斷水稻樣品為抗稻瘟病基因Pigm的雜合型。

3.根據權利要求2所述的應用，其特征在于，引物Primer Y、Primer X的5’段連接FAM或HEX熒光接頭。