[發(fā)明專利]水稻廣譜抗稻瘟病基因Pigm的SNP標記開發(fā)和應(yīng)用有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201811512430.6 | 申請日： | 2018-12-11 |
| 公開（公告）號： | CN109628627B | 公開（公告）日： | 2022-03-18 |
| 發(fā)明（設(shè)計）人： | 彭佩;江南;李為國;梁毅;肖金華 | 申請（專利權(quán)）人： | 華智生物技術(shù)有限公司 |
| 主分類號： | C12Q1/6895 | 分類號： | C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京市中聯(lián)創(chuàng)和知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11364 | 代理人： | 康秀敏;王錚 |
| 地址： | 410000 湖*** | 國省代碼： | 湖南;43 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關(guān)鍵詞： | 水稻 廣譜 稻瘟病 基因 pigm snp 標記 開發(fā) 應(yīng)用 | ||
1.一種與抗稻瘟病基因Pigm緊密連鎖的SNP分子標記在檢測抗稻瘟病基因Pigm中的應(yīng)用，其特征在于，所述分子標記是與抗稻瘟病基因Pigm共分離的SNP標記K_060508，所述K_060508的多態(tài)性堿基為G或A，所述K_060508位于水稻第6號染色體的第10421726位堿基處；檢測所述K_060508的引物組合包括：兩條特異性引物：Primer X：5’-CCAAGCAAATTACCACAACG-3’；Primer Y：5’-CCAAGCAAATTACCACAACA-3’；一條通用引物：Primer C：5’-TTGTTATACGGTTTAATTAAGGTGA-3’。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的應(yīng)用，其特征在于，所述抗稻瘟病基因Pigm緊密連鎖的SNP分子標記的檢測方法包括如下步驟：
S1、提取水稻樣品基因組DNA；
S2、以水稻基因組DNA為模板，利用權(quán)利要求1所述引物組合進行KASP反應(yīng)檢測；其中，兩條特異性引物分別連接不同的熒光接頭；
S3、若只檢測到引物Primer Y所連熒光接頭對應(yīng)的熒光信號，則檢測位點為堿基A，判斷水稻樣品為攜帶抗稻瘟病基因Pigm的純和型；若只檢測到引物Primer X所連熒光接頭對應(yīng)的熒光信號，則檢測位點為堿基G，判斷水稻樣品為不含抗稻瘟病基因Pigm的純和型；若同時檢測到兩種熒光，則判斷水稻樣品為抗稻瘟病基因Pigm的雜合型。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的應(yīng)用，其特征在于，引物Primer Y、Primer X的5’段連接FAM或HEX熒光接頭。
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