[發明專利]杉木EST-SSR分子標記組合

有效

• 申請號: 201811393386.1
• 申請日: 2018-11-21
• 公開（公告）號: CN109576388B
• 公開（公告）日: 2021-08-27
• 發明（設計）人: 陳興彬;肖復明;何龍燕;婁永峰;徐海寧;程強強;熊彩云;宋曉琛
• 申請（專利權）人: 江西省林業科學院
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6806;C12N15/11
• 代理公司: 北京清亦華知識產權代理事務所(普通合伙) 11201
• 代理人: 何世磊

本發明涉及一種杉木EST?SSR分子標記組合，所開發的EST?SSR均為多態性標記，其編號分別為CLESTSSR08、CLESTSSR16、CLESTSSR22、CLESTSSR33、CLESTSSR76、CLESTSSR97、CLESTSSR193、CLESTSSR201、CLESTSSR 286。本發明開發的EST?SSR分子標記重復好，可靠性高，適用于杉木種質資源評價及其分子標記輔助育種等研究。

技術領域

本發明涉及分子生物學標記技術領域，特別涉及一種杉木EST-SSR分子標記組合。

背景技術

分子標記是以個體間遺傳物質內核苷酸序列變異為基礎的遺傳標記，能在DNA水平上反應植物遺傳基礎的差異。簡單重復序列(SSR)廣泛分布于各類真核生物基因組的不同位置，由于SSR的重復次數不同，使其呈現高度的多態性。與其它分子標記相比，SSR標記具有可靠性強、多態信息含量高、共顯性遺傳、操作簡單等優點，廣泛用于遺傳多樣性分析、遺傳圖譜構建、基因定位和標記輔助育種中。

SSR標記可分為基因組SSR(gSSR)和表達序列標簽SSR(EST-SSR)，EST-SSR標記源于基因的轉錄區，與gSSR標記相比，其免去了文庫構建和大量的序列測定，具有開發耗時短，花費低，效率高等優點。同時，EST作為基因轉錄本的一部分，更易獲得基因表達的信息，可為功能基因的直接鑒定提供重要依據。杉木(Cunninghamia lanceolata)是我國南方重要的速生用材樹種，廣泛分布于我國長江流域以及珠江流域的17個省區。杉木由于其生長快，材質好，易繁殖，易栽培，適應性強，深受廣大南方杉木產區人民的喜愛。

然而，杉木尚無全基因組序列信息，杉木SSR標記開發滯后，目前僅開發出少量SSR引物，分子標記數量不足，限制了杉木分子遺傳學研究。

發明內容

基于此，本發明的目的是為杉木分子遺傳學研究提供更多的多態性分子標記。

本發明提出一種杉木EST-SSR分子標記組合，其中，所述EST-SSR分子標記均為多態性標記，其編號分別為CLESTSSR08、CLESTSSR16、CLESTSSR22、CLESTSSR33、CLESTSSR76、CLESTSSR97、CLESTSSR193、CLESTSSR201或CLESTSSR 286，各分子標記對應的核苷酸序列分別為：

SEQCLESTSSR08：

GTGGCCAATTCTGCAAGCAATGGAGGGAGTTGCTGTGGCGGCAGTGGCAGTAGCAGTAGCAGTAGCAGTAGCAGTAGCAGTGGAGGAAGCTGCAGCAGTCATGGCAAGTCTTCTGATCTTTCTAATGTTGGGAAAGAGTTTGAAGCCATGGTTGCCAGAGCCACATTGACT；

SEQCLESTSSR16：

TGTTGCTTCAGTCGGGGTTTGCGGCAGAGGAAGCGGTTGTCCAGCGAATTGATCCACAGACCTCCTGGGCGCTAGAGCCGACGGAGACGGAGACGGAGACGGAGACGGATGTTGCTTCAGTCGGGGTTTGAATCGCCCAGCACGAAATCAACACTTCGCCTTGCTAAATCGTCGTTAGAACTTCGCCTCAATTTCGTAGGCGACGGAGACGGAGATCCAAAGCCGCTTCT；

SEQCLESTSSR22：