[發明專利]一種基于陰離子交換色譜柱的SUMO化肽段的富集方法有效
| 申請號: | 201811390002.0 | 申請日: | 2018-11-21 |
| 公開(公告)號: | CN111208243B | 公開(公告)日: | 2022-05-17 |
| 發明(設計)人: | 張麗華;李洋;孫明偉;單亦初;楊開廣;張玉奎 | 申請(專利權)人: | 中國科學院大連化學物理研究所 |
| 主分類號: | G01N30/08 | 分類號: | G01N30/08;G01N30/14 |
| 代理公司: | 沈陽科苑專利商標代理有限公司 21002 | 代理人: | 馬馳 |
| 地址: | 116023 遼寧省*** | 國省代碼: | 遼寧;21 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 基于 陰離子 交換 色譜 sumo 化肽段 富集 方法 | ||
1.一種基于陰離子交換色譜柱的 SUMO 化肽段的富集方法,其特征在于:包括: 1)蛋白質堿性位點酶切; 2)陰離子交換色譜柱分離:在堿性環境中通過陰離子交換色譜柱去除保留 弱的酶解肽段,收集保留較強的 SUMO 化肽段流出液;
其中步驟 2)所述的收集保留較強的 SUMO 化肽段流出液,具體步驟如下:在低鹽濃度流動相下的不保留肽段被洗脫后,收集在高鹽濃度流動相下的肽 段流出液,即在氯化鈉的摩爾濃度100 mM時不保留的肽段流出液,將溶液除鹽,凍干,得 SUMO 化肽段;所述的在堿性環境中通過陰離子交換色譜柱去除保留弱的酶解肽段,具體步驟如下:將蛋白酶解物溶液除鹽,凍干后,采用 A 相溶解并上樣到陰離子交換色譜柱上進行分離,流速為 0.1-3mL/min,在低鹽濃度的流動相下洗脫除去不保留的 酶解肽段,即氯化鈉的摩爾濃度≤100mM 時的不保留肽段;按體積百分濃度計,A 相:5-30%乙腈+1-10 mM 堿性溶液;B 相:5%-30%乙 腈+1-10 mM 堿性溶液+200-1000 mM 氯化鈉。
2.按照權利要求 1 所述富集方法,其特征在于:所述的蛋白質堿性位點酶切,具體步驟如下:于變性、還原、烷基化后的蛋白樣品溶液中加入蛋白水解酶進行酶解,蛋白水解酶用量為蛋白質質量的 1/5-1/100,酶解時間為 2-48 h,酶解溫度 25-45 °C,得到蛋白酶解物溶液。
3.按照權利要求1所述富集方法,其特征在于:陰離子交換色譜柱的分離梯度采用線性梯度或臺階梯度。
4.按照權利要求1 或 2 所述的方法,其特征在于:蛋白水解酶為胰蛋白酶,蛋白內切酶 Lys-C,蛋白內肽酶 Arg-C 中的一種或二種以上。
5.按照權利要求 1 或 3 所述的方法,其特征在于:所述的陰離子交換色譜柱的固定相為含有季銨基和/或叔胺基化學鍵合的聚合物基質材料;材料可以是顆粒材料或者整體材料;色譜柱內徑為 1-8 mm,長度為 5-30 cm。
6.按照權利要求 1 所述的方法,其特征在于:調節 pH 至堿性環境所采用的堿性溶液為 pH 為 8-14 的碳酸氫銨緩沖鹽溶液、pH為 8-14 的磷酸 緩沖鹽溶液、pH為 8-14 的三羥甲基氨基甲烷緩沖鹽溶液、氨水、碳酸鈉溶液、或氫氧化鈉溶液中的一種或二種以上配置而成;緩沖液濃度為 1-10 mM。
7.按照權利要求 5 所述的方法,其特征在于:聚合物基質材料包括聚丙烯 酸酯類基質、聚苯乙烯類基質、聚丙烯酰胺類基質中的一種或二種以上。
8.按照權利要求 1 所述的方法,其可應用于生物樣品中 SUMO 化修飾蛋白 2 以及肽段的富集和鑒定;生物樣品為細胞、組織、體液中的一種或二種以上。
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