[發(fā)明專利]一種確定藥物和藥物靶點(diǎn)關(guān)聯(lián)關(guān)系的方法

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201811382264.2
• 申請日: 2018-11-20
• 公開（公告）號: CN109493925B
• 公開（公告）日: 2020-09-15
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 陳壯志;賴力鵬;鄭昱豪;溫書豪;馬健
• 申請（專利權(quán)）人: 北京晶派科技有限公司
• 主分類號: G16C20/50
• 分類號: G16C20/50
• 代理公司: 北京思睿峰知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11396
• 代理人: 謝建云;趙愛軍

本發(fā)明提供了一種確定藥物和藥物靶點(diǎn)關(guān)聯(lián)關(guān)系的方法，包括步驟：采集表征藥物、藥物靶點(diǎn)、疾病和副作用之間關(guān)聯(lián)關(guān)系的數(shù)據(jù)；基于所采集到的數(shù)據(jù)分別生成藥物和藥物靶點(diǎn)對應(yīng)的向量；組合各藥物和各藥物靶點(diǎn)所對應(yīng)的向量，以生成對應(yīng)的各藥物?藥物靶點(diǎn)向量；以及基于預(yù)定模型確定出表征藥物?藥物靶點(diǎn)向量所對應(yīng)的藥物和藥物靶點(diǎn)的關(guān)聯(lián)關(guān)系的分值。基于該方法，本發(fā)明一并公開了一種異質(zhì)信息網(wǎng)絡(luò)和預(yù)測藥物和藥物靶點(diǎn)相互作用關(guān)系的方法。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及數(shù)據(jù)處理領(lǐng)域，尤其涉及確定藥物和藥物靶點(diǎn)關(guān)聯(lián)關(guān)系的方法。

背景技術(shù)

鑒于研發(fā)全新藥物的成功率低且成本高昂，而舊藥新用大大縮短了藥物研發(fā)所需的時(shí)間、經(jīng)費(fèi)，且其研發(fā)的成功率遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于傳統(tǒng)的藥物研發(fā)，故，制藥公司等機(jī)構(gòu)越來越重視關(guān)于藥物重新定位方案的研究，以尋找舊藥新的藥物靶點(diǎn)及其新應(yīng)用。相比研發(fā)全新藥物，藥物重新定位可以大幅度降低制藥成本，加快監(jiān)管審批，因此該方法受到醫(yī)藥公司、研究者、臨床醫(yī)生、乃至政府的高度重視。

現(xiàn)有的方案中，如申請?zhí)枮?01210584373.9的中國專利申請?zhí)岢隽艘环N基于藥物相互作用相似性識別藥物靶標(biāo)的系統(tǒng)，但是這種基于藥物相互作用的方法并沒有考慮藥物與藥物靶點(diǎn)、藥物與副作用、藥物與疾病、藥物靶點(diǎn)與藥物靶點(diǎn)、藥物靶點(diǎn)與疾病之間的相互作用或關(guān)聯(lián)。此外，申請?zhí)枮?01210140708.8的中國專利申請?zhí)岢隽艘环N利用靶點(diǎn)晶體數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫中的小分子化學(xué)結(jié)構(gòu)構(gòu)建藥物靶點(diǎn)方法。但是這種基于化學(xué)結(jié)構(gòu)的預(yù)測方法，并不適用于化學(xué)結(jié)構(gòu)可能因代謝而改變的藥物。申請?zhí)枮?01110396287.0的中國專利申請也提出了一種基于基因組學(xué)的預(yù)測藥物靶點(diǎn)方法，但是這種基于基因組學(xué)的研究成本非常高昂。

鑒于上述弊端，需要一種新的預(yù)測藥物和藥物靶點(diǎn)之間相互作用關(guān)系的方案。

發(fā)明內(nèi)容

為此，本發(fā)明提供了一種確定藥物和藥物靶點(diǎn)關(guān)聯(lián)關(guān)系的方案，以力圖解決或者至少緩解上面存在的至少一個(gè)問題。

根據(jù)本發(fā)明的一個(gè)方面，提供了一種確定藥物和藥物靶點(diǎn)關(guān)聯(lián)關(guān)系的方法，包括步驟：采集表征藥物、藥物靶點(diǎn)、疾病和副作用之間關(guān)聯(lián)關(guān)系的數(shù)據(jù)；基于所采集到的數(shù)據(jù)分別生成藥物和藥物靶點(diǎn)對應(yīng)的向量；組合各藥物和各藥物靶點(diǎn)所對應(yīng)的向量，以生成對應(yīng)的各藥物-藥物靶點(diǎn)向量；以及基于預(yù)定模型確定出表征藥物-藥物靶點(diǎn)向量所對應(yīng)的藥物和藥物靶點(diǎn)的關(guān)聯(lián)關(guān)系的分值。

可選地，在根據(jù)本發(fā)明的方法中，在組合各藥物和各藥物靶點(diǎn)所對應(yīng)的向量、以生成對應(yīng)的各藥物-藥物靶點(diǎn)向量的步驟之后，還包括步驟：根據(jù)所采集的數(shù)據(jù)對各藥物-藥物靶點(diǎn)向量進(jìn)行歸類。

可選地，在根據(jù)本發(fā)明的方法中，根據(jù)所采集的數(shù)據(jù)對各藥物-藥物靶點(diǎn)向量進(jìn)行歸類的步驟包括：若在所采集的數(shù)據(jù)中藥物和藥物靶點(diǎn)之間已存在關(guān)聯(lián)關(guān)系，則將該藥物-藥物靶點(diǎn)向量歸到第一樣本集合；以及若在所采集的數(shù)據(jù)中藥物和藥物靶點(diǎn)之間不存在關(guān)聯(lián)關(guān)系，則將該藥物-藥物靶點(diǎn)向量歸到第二樣本集合。

可選地，在根據(jù)本發(fā)明的方法中，基于預(yù)定模型確定出表征藥物-藥物靶點(diǎn)向量所對應(yīng)的藥物和藥物靶點(diǎn)的關(guān)聯(lián)關(guān)系的分值的步驟包括：利用第二樣本集合中的藥物-藥物靶點(diǎn)向量生成第一子集和第二子集；基于預(yù)定模型，利用第一子集和第一樣本集合中的藥物-藥物靶點(diǎn)向量確定出第二子集中的藥物-藥物靶點(diǎn)向量對應(yīng)的分值；以及基于預(yù)定模型，利用第二子集和第一樣本集合中的藥物-藥物靶點(diǎn)向量確定出第一子集中的藥物-藥物靶點(diǎn)向量對應(yīng)的分值。