[發明專利]一種用于鑒定Azospirillum sp.TSA2S菌株的引物及其應用

在審

• 申請號: 201811373334.8
• 申請日: 2018-11-19
• 公開（公告）號: CN109266769A
• 公開（公告）日: 2019-01-25
• 發明（設計）人: 高南;張歡歡;申衛收;應漢杰
• 申請（專利權）人: 南京工業大學;南京信息工程大學
• 主分類號: C12Q1/689
• 分類號: C12Q1/689;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/01
• 代理公司: 南京蘇高專利商標事務所(普通合伙) 32204
• 代理人: 丁靜靜;肖明芳

本發明公開了一種用于鑒定Azospirillum sp.TSA2S菌株的引物及其應用，包括SEQ ID NO 1～6所示的任意一種核苷酸序列，及SEQ ID NO 7～18所示的引物。本發明提供的引物能快速高效實現Azospirillum sp.TSA2S菌株鑒定，具有較好的應用前景。

技術領域

本發明屬于微生物信息學技術領域，具體涉及一種用于鑒定Azospirillumsp.TSA2S菌株的引物及其應用。

技術背景

對于親緣關系較近微生物的鑒別一直是微生物育種學家，特別是進行植物促生菌研究的專家的一項重要工作。以傳統的以形態、生理生化特性為基礎的鑒別方法具有很多缺陷，例如：同一個屬內的微生物的形態、生理生化特性基本相似，難以鑒別。

隨著分子生物學和生物信息學技術的發展，以及越來越多的微生物基因組測序的完成，以DNA片段作為鑒別物種的分子標記的各種方法不斷發展出來。這些技術具有特異性強、準確率高、可重復性強、時間短等特點，已經廣泛應用于各類治病微生物、環境微生物等的分析鑒定中。而這些技術對針對特定種屬的高度特異性的核酸序列，很難區分同一種屬內的不同菌株，針對某一特定目標微生物的特異性核酸序列篩選存在一定的難度。

發明內容

本發明的目的是提供一種用于鑒定Azospirillum sp.TSA2S的菌株的引物及其應用，以解決現有技術中同一種屬不同菌株鑒定困難的問題。

為解決上述技術問題，本發明采用如下技術方案：

一種用于鑒定Azospirillum sp.TSA2S的菌株的寡核苷酸片段，包括SEQ ID NO 1～6所示的任意一種核苷酸序列。

一種用于鑒定Azospirillum sp.TSA2S的菌株的引物，以SEQ ID NO 1～6任一所示的核苷酸序列為模板，設計得到的引物。

一種用于鑒定Azospirillum sp.TSA2S的菌株的引物，包括如下引物對中的任意一對：

2sFw12(SEQ ID NO.7)：GAAGAACAGGACACGTGCAA，

2sRv12(SEQ ID NO.8)：TCAAATGAGTGCCCTAAGCA；

或者：

2sFw13(SEQ ID NO.9)：AATGGATTGCAGCAAAAAGC，

2sRv13(SEQ ID NO.10)：GATGCAGGAGTGCCAAAAGT；

或者：

2sFw14(SEQ ID NO.11)：TTCGAGCCCTAACAGGAGAA，

2sRv14(SEQ ID NO.12)：TAAAGGGCAGACGCAATAGG；

或者：

2sFw16(SEQ ID NO.13)：TGTTCGACTACGCTCATGCT，

2sRv16(SEQ ID NO.14)：GAGAGCTGCACCGACAGTTT；

或者：

2sFw17(SEQ ID NO.15)：TTTCCCCTGACTGCGTATCT，

2sRv17(SEQ ID NO.16)：CTGAATCCGTTCACAGCAAA；

或者：

2sFw18(SEQ ID NO.17)：TCAGATGTTTTGGCACATCG，