[發明專利]柳樹耐鹽性狀主效QTL的分子標記及應用

在審

• 申請號: 201811364868.4
• 申請日: 2018-11-13
• 公開（公告）號: CN109609672A
• 公開（公告）日: 2019-04-12
• 發明（設計）人: 李敏;王瑩;郭聰;談峰;馮新民;馬祥建;王奎山;沈悅;王永強
• 申請（專利權）人: 江蘇沿江地區農業科學研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 上海唯源專利代理有限公司 31229
• 代理人: 曾耀先

1.一種柳樹耐鹽性狀主效QTL的分子標記，其特征在于，所述的柳樹耐鹽性狀主效QTL位點的分子標記特異性檢測柳樹SNP位點M24340和柳樹SNP位點M36640。

2.根據權利要求1所述的柳樹耐鹽性狀主效QTL的分子標記，其特征在于，所述的柳樹耐鹽性狀主效QTL位點的分子標記包括第一分子標記和第二分子標記，所述第一分子標記特異性檢測所述柳樹SNP位點M24340，所述第二分子標記特異性檢測所述柳樹SNP位點M36640。

3.根據權利要求2所述的柳樹耐鹽性狀主效QTL的分子標記，其特征在于，所述第一分子標記是第一CAPS2分子標記，所述第一CAPS2分子標記包括SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示的第一引物對，所述第二分子標記是第二dCAPS2分子標記，所述第二dCAPS2分子標記包括SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示的第二引物對。

4.一種利用分子標記檢測柳樹耐鹽性狀的方法，其特征在于，包括以下步驟：

(1)提取待測柳樹的基因組DNA；

(2)采用上述的柳樹耐鹽性狀主效QTL位點的分子標記對所述基因組DNA進行檢測；

(3)當檢測到所述柳樹SNP位點M24340為C且檢測到所述柳樹SNP位點M36640為T時，所述待測柳樹為耐鹽性柳樹，否則，所述待測柳樹為非耐鹽性柳樹。

5.根據權利要求4所述的利用分子標記檢測柳樹耐鹽性狀的方法，其特征在于，在所述步驟(2)中，采用CAPS2/dCAPS2分子標記對所述基因組DNA進行檢測的步驟包括：

(21)對所述基因組DNA采用所述第一引物對進行PCR擴增獲得第一擴增產物，采用NsiI酶切所述第一擴增產物；

(22)對所述基因組DNA采用所述第二引物對進行PCR擴增獲得第二擴增產物，采用NlaIII酶切所述第二擴增產物；

在所述步驟(3)中，若所述第一擴增產物酶切得到220bp和81bp的產物則表明檢測到所述柳樹SNP位點M24340為C，若所述第二擴增產物酶切得到67bp和24bp的產物則表明檢測到所述柳樹SNP位點M36640為T。

6.一種利用分子標記輔助耐鹽性柳樹育種的方法，其特征在于，包括以下步驟：

(A)提取待測柳樹的基因組DNA；

(B)采用上述的柳樹耐鹽性狀主效QTL位點的分子標記對所述基因組DNA進行檢測；

(C)當檢測到所述柳樹SNP位點M24340為C且檢測到所述柳樹SNP位點M36640為T時，所述待測柳樹為耐鹽性柳樹，將所述耐鹽性柳樹應用于柳樹品質育種。

7.根據權利要求6所述的利用分子標記輔助耐鹽性柳樹育種的方法，其特征在于，在所述步驟(B)中，采用CAPS2/dCAPS2分子標記對所述基因組DNA進行檢測的步驟包括：

(B1)對所述基因組DNA采用所述第一引物對進行PCR擴增獲得第一擴增產物，采用NsiI酶切所述第一擴增產物；

(B2)對所述基因組DNA采用所述第二引物對進行PCR擴增獲得第二擴增產物，采用NlaIII酶切所述第二擴增產物；

在所述步驟(C)中，若所述第一擴增產物酶切得到220bp和81bp的產物則表明檢測到所述柳樹SNP位點M24340為C，若所述第二擴增產物酶切得到67bp和24bp的產物則表明檢測到所述柳樹SNP位點M36640為T。

8.根據權利要求1至3中任一權利要求所述的柳樹耐鹽性狀主效QTL的分子標記在檢測柳樹耐鹽性狀中的應用。

9.根據權利要求1至3中任一權利要求所述的柳樹耐鹽性狀主效QTL的分子標記在對柳樹耐鹽性進行選擇中的應用。

10.根據權利要求1至3中任一權利要求所述的柳樹耐鹽性狀主效QTL的分子標記在耐鹽性柳樹的分子標記輔助育種中的應用。