[發(fā)明專利]柳樹速生性狀主效QTL的分子標(biāo)記及應(yīng)用

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 201811350007.0
• 申請日: 2018-11-13
• 公開（公告）號: CN109234441A
• 公開（公告）日: 2019-01-18
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 李敏;王瑩;郭聰;談峰;馮新民;馬祥建;王奎山;沈悅;王永強(qiáng)
• 申請（專利權(quán)）人: 江蘇沿江地區(qū)農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 上海唯源專利代理有限公司 31229
• 代理人: 曾耀先

1.一種柳樹速生性狀主效QTL的分子標(biāo)記，其特征在于，所述的柳樹速生性狀主效QTL位點(diǎn)的分子標(biāo)記特異性檢測柳樹SNP位點(diǎn)M50353和柳樹SNP位點(diǎn)M166141。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的柳樹速生性狀主效QTL的分子標(biāo)記，其特征在于，所述的柳樹速生性狀主效QTL位點(diǎn)的分子標(biāo)記包括第一分子標(biāo)記和第二分子標(biāo)記，所述第一分子標(biāo)記特異性檢測所述柳樹SNP位點(diǎn)M50353，所述第二分子標(biāo)記特異性檢測所述柳樹SNP位點(diǎn)M166141。

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的柳樹速生性狀主效QTL的分子標(biāo)記，其特征在于，所述第一分子標(biāo)記是第一CAPS分子標(biāo)記，所述第一CAPS分子標(biāo)記包括SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示的第一引物對，所述第二分子標(biāo)記是第二dCAPS分子標(biāo)記，所述第二dCAPS分子標(biāo)記包括SEQID NO:3和SEQ ID NO:4所示的第二引物對。

4.一種利用分子標(biāo)記檢測柳樹速生性狀的方法，其特征在于，包括以下步驟：

(1)提取待測柳樹的基因組DNA；

(2)采用上述的柳樹速生性狀主效QTL位點(diǎn)的分子標(biāo)記對所述基因組DNA進(jìn)行檢測；

(3)當(dāng)檢測到所述柳樹SNP位點(diǎn)M50353為T且檢測到所述柳樹SNP位點(diǎn)M166141為G時(shí)，所述待測柳樹為速生性柳樹，否則，所述待測柳樹為非速生性柳樹。

5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的利用分子標(biāo)記檢測柳樹速生性狀的方法，其特征在于，在所述步驟(2)中，采用CAPS/dCAPS分子標(biāo)記對所述基因組DNA進(jìn)行檢測的步驟包括：

(21)對所述基因組DNA采用所述第一引物對進(jìn)行PCR擴(kuò)增獲得第一擴(kuò)增產(chǎn)物，采用SspI酶切所述第一擴(kuò)增產(chǎn)物；

(22)對所述基因組DNA采用所述第二引物對進(jìn)行PCR擴(kuò)增獲得第二擴(kuò)增產(chǎn)物，采用MspI酶切所述第二擴(kuò)增產(chǎn)物；

在所述步驟(3)中，若所述第一擴(kuò)增產(chǎn)物酶切得到300bp和58bp的產(chǎn)物則表明檢測到所述柳樹SNP位點(diǎn)M50353為T，若所述第二擴(kuò)增產(chǎn)物酶切得到287bp和18bp的產(chǎn)物或者得到278bp和18bp的產(chǎn)物則表明檢測到所述柳樹SNP位點(diǎn)M166141為G。

6.一種利用分子標(biāo)記輔助速生性柳樹育種的方法，其特征在于，包括以下步驟：

(A)提取待測柳樹的基因組DNA；

(B)采用上述的柳樹速生性狀主效QTL位點(diǎn)的分子標(biāo)記對所述基因組DNA進(jìn)行檢測；

(C)當(dāng)檢測到所述柳樹SNP位點(diǎn)M50353為T且檢測到所述柳樹SNP位點(diǎn)M166141為G時(shí)，所述待測柳樹為速生性柳樹，將所述速生性柳樹應(yīng)用于柳樹品質(zhì)育種。

7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的利用分子標(biāo)記輔助速生性柳樹育種的方法，其特征在于，在所述步驟(B)中，采用CAPS/dCAPS分子標(biāo)記對所述基因組DNA進(jìn)行檢測的步驟包括：

(B1)對所述基因組DNA采用所述第一引物對進(jìn)行PCR擴(kuò)增獲得第一擴(kuò)增產(chǎn)物，采用SspI酶切所述第一擴(kuò)增產(chǎn)物；

(B2)對所述基因組DNA采用所述第二引物對進(jìn)行PCR擴(kuò)增獲得第二擴(kuò)增產(chǎn)物，采用MspI酶切所述第二擴(kuò)增產(chǎn)物；

在所述步驟(C)中，若所述第一擴(kuò)增產(chǎn)物酶切得到300bp和58bp的產(chǎn)物則表明檢測到所述柳樹SNP位點(diǎn)M50353為T，若所述第二擴(kuò)增產(chǎn)物酶切得到287bp和18bp的產(chǎn)物或者得到278bp和18bp的產(chǎn)物則表明檢測到所述柳樹SNP位點(diǎn)M166141為G。

8.根據(jù)權(quán)利要求1至3中任一權(quán)利要求所述的柳樹速生性狀主效QTL的分子標(biāo)記在檢測柳樹速生性狀中的應(yīng)用。

9.根據(jù)權(quán)利要求1至3中任一權(quán)利要求所述的柳樹速生性狀主效QTL的分子標(biāo)記在對柳樹速生性進(jìn)行選擇中的應(yīng)用。

10.根據(jù)權(quán)利要求1至3中任一權(quán)利要求所述的柳樹速生性狀主效QTL的分子標(biāo)記在速生性柳樹的分子標(biāo)記輔助育種中的應(yīng)用。