[發(fā)明專利]一種山羊毛色相關(guān)的分子標(biāo)記方法及其應(yīng)用

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201811323682.4
• 申請(qǐng)日: 2018-11-08
• 公開（公告）號(hào): CN111154887B
• 公開（公告）日: 2022-06-17
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 賀建寧;張連凱;柳楠;劉積鳳;孔凡虎
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 青島農(nóng)業(yè)大學(xué)
• 主分類號(hào): C12Q1/6888
• 分類號(hào): C12Q1/6888
• 代理公司: 北京一格知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 11316
• 代理人: 趙永偉;李魏英

本發(fā)明提供一種山羊毛色相關(guān)的分子標(biāo)記方法及其應(yīng)用，涉及分子生物學(xué)技術(shù)領(lǐng)域，(1)以待測(cè)山羊的MC1R基因組作為模板，用引物：F:CATGGTGTCCAGCCTCTG，R:TCACCAGGAGCACTGCAG，對(duì)其進(jìn)行PCR擴(kuò)增，得到PCR產(chǎn)物；(2)將步驟(1)得到的PCR產(chǎn)物進(jìn)行電泳回收、測(cè)序，利用PCR?SSCP方法檢測(cè)MC1R基因多態(tài)性，依據(jù)帶型，為AA、AG、GG，所述AA為野生純合型，所述AG為雜合型，所述GG為突變純合型；(3)攜帶純合GG基因型的山羊毛色為白色的概率為84.15％，且在內(nèi)蒙古白絨山羊中僅檢測(cè)到純合GG基因型；攜帶等位基因A的個(gè)體全部為黑色或青色，且A對(duì)G為顯性基因；分子標(biāo)記的位點(diǎn)是MC1R基因g.436bp。本發(fā)明提供的山羊毛色相關(guān)的分子標(biāo)記可以用于山羊育種中，選擇毛色，推動(dòng)山羊育種發(fā)展。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及分子生物學(xué)技術(shù)領(lǐng)域，具體是一種山羊毛色相關(guān)的分子標(biāo)記方法及其應(yīng)用。

背景技術(shù)

隨著人民生活水平的不斷提高，羊毛產(chǎn)品越來越受到大家的喜愛，羊毛因其優(yōu)質(zhì)的毛纖維及其色彩多樣的天然毛色越來越受到重視。直接利用天然色，可免去深加工中漂白染色的程序，節(jié)約成本，亦可減少對(duì)環(huán)境的污染。羊毛毛色形成過程復(fù)雜，但主要受控于遺傳因素。基因主要通過調(diào)控黑色素細(xì)胞的生成和分布來影響被毛顏色。掌握毛色遺傳規(guī)律，發(fā)掘控制毛色相關(guān)基因，科學(xué)育種，將有利于提高毛產(chǎn)量。另外，羊毛毛色在畜牧業(yè)中是識(shí)別動(dòng)物品種和個(gè)體的重要依據(jù)和主要標(biāo)志，是生產(chǎn)性能測(cè)定等工作中不可缺少的內(nèi)容之一。同樣，不同毛色山羊的經(jīng)濟(jì)價(jià)值也不盡相同。所以對(duì)山羊毛色相關(guān)基因的篩選意義重大。

哺乳動(dòng)物毛色的顏色是由色素顆粒控制的，色素顆粒沉積的多少?zèng)Q定了動(dòng)物的毛色,而控制色素沉著的是相應(yīng)的酶蛋白，這些蛋白質(zhì)由不同的色素沉著基因編碼。這些基因在不同的時(shí)期起著不同的作用，從多方面調(diào)節(jié)動(dòng)物毛色使動(dòng)物毛色表現(xiàn)出種屬的差異，并代表其不同的生產(chǎn)性能。代群體遺傳學(xué)對(duì)毛色遺傳的研究表明，所有動(dòng)物的毛色遺傳取決于色原體基因和著色基因(即控制氧化酶的基因)。色原體基因決定顏色，著色基因決定顏色的深淺度，任何個(gè)體毛色的表現(xiàn)都是這兩種基因共同作用的結(jié)果。同時(shí)具有特定的遺傳特征與形成的某一表型之間的關(guān)系是非常復(fù)雜的，會(huì)受到許多因素包括參與基因表達(dá)的發(fā)育性的、環(huán)境性的、隨機(jī)性的和外成性事件的影響。

MC1R基因，即黑素皮質(zhì)素受體1(melanocortin1 re-ceptor)基因，又稱促黑素細(xì)胞激素受體(m elanocytestim-ulatinghorm onereceptor，MSHR)基因，在小鼠的研究中發(fā)現(xiàn)，MC1R 基因第549個(gè)核苷酸位置的一個(gè)移碼突變，導(dǎo)致隱性黃鼠出現(xiàn)，第206個(gè)核苷酸位置的一個(gè)點(diǎn)突變，導(dǎo)致煙色鼠的出現(xiàn)。在對(duì)馬的研究中也發(fā)現(xiàn)，MC1R基因的一個(gè)錯(cuò)義突變，使第83 位的核苷酸由絲氨酸變?yōu)楸奖彼幔瑥亩柜R表現(xiàn)栗色毛性狀。2000年，W anger等又發(fā)現(xiàn)馬存在一個(gè)新的MC1R基因多態(tài)位點(diǎn)，使第84個(gè)核苷酸位置由天冬氨酸突變?yōu)樘於０贰Ｔ谄渌锓N，如狐貍、豬、狗和兔等中，也發(fā)現(xiàn)MC1R基因突變會(huì)引起相應(yīng)的毛色變異。但目前尚未深入探討山羊該基因與毛色形成的關(guān)系。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明提供一種山羊毛色相關(guān)的分子標(biāo)記方法及其應(yīng)用，解決了現(xiàn)有技術(shù)中山羊育種不能有效選擇毛色的技術(shù)問題。

本發(fā)明是這樣實(shí)現(xiàn)的：包括以下步驟：

(1)以待測(cè)山羊的MC1R基因組作為模板，用引物對(duì)其進(jìn)行PCR擴(kuò)增，得到PCR產(chǎn)物，所述引物序列為序列F:CATGGTGTCCAGCCTCTG，R:TCACCAGGAGCACTGCAG；

(2)將步驟(1)得到的PCR產(chǎn)物進(jìn)行電泳回收、測(cè)序，利用PCR-SSCP方法檢測(cè)MC1R基因多態(tài)性，依據(jù)帶型，為AA、AG、GG，所述AA為野生純合型為純黑色，所述AG為雜合型灰色或青色，所述GG為突變純合型為白色；

作為一種優(yōu)選的實(shí)施方案，分子標(biāo)記的位點(diǎn)是MC1R基因g.436bp。