[發明專利]用于人類基因組成熟tRNA譜檢測的接頭、引物組和試劑盒有效
| 申請號: | 201811302188.X | 申請日: | 2018-11-02 |
| 公開(公告)號: | CN109306373B | 公開(公告)日: | 2021-11-26 |
| 發明(設計)人: | 歐旭敏;潘秋衛;程安春;汪銘書;朱德康 | 申請(專利權)人: | 四川農業大學;西北民族大學 |
| 主分類號: | C12Q1/6851 | 分類號: | C12Q1/6851;C12N15/11 |
| 代理公司: | 成都玖和知識產權代理事務所(普通合伙) 51238 | 代理人: | 胡琳梅 |
| 地址: | 611130 四*** | 國省代碼: | 四川;51 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 用于 人類基因組 成熟 trna 檢測 接頭 引物 試劑盒 | ||
1.用于人類基因組成熟tRNA譜檢測的引物組,其特征在于,包括表1中如SEQ ID NO.2~115所示的57對引物:
表1.用于人類基因組成熟tRNA譜檢測的引物組
其中,R=A/G,Y=C/T,M=A/C,K=G/T,S=C/G,W=A/T,H=A/C/T,B=C/G/T,V=A/C/G,D=A/G/T,N=A/C/G/T。
2.用于人類基因組成熟tRNA譜檢測的試劑盒,其特征在于,包括核苷酸序列如SEQ IDNO.1所示的接頭和權利要求1所述的引物組。
3.一種非疾病診斷目的的人類基因組成熟tRNA譜檢測方法,其特征在于,具體步驟如下:
(1)抽提總RNA的同時,tRNA去氨基酸;
(2)將步驟(1)所得抽提總RNA與核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示接頭混合,孵育,得含有連接tRNA的混合液;
(3)將步驟(2)所得混合液與特異性下游引物混合物混合配置成退火溶液,連接tRNA退火化;所述特異性下游引物混合物為權利要求2所述引物組中的下游引物混合物;
(4)退火化的連接tRNA與mRNA共反轉錄;
(5)qPCR檢測;
步驟(2)中,孵育的具體方法如下:
(2-1)配置退火溶液,90℃孵育3分鐘;
(2-2)加入退火緩沖液,37℃孵育20分鐘;
(2-3)配置連接反應體系,37℃孵育60分鐘;
步驟(5)中,qPCR的反應體系如下:2×SYBRTM Green PCR Master Mix 5μl,cDNA 2μl,10pm上游引物混合物0.25μl,10pm下游引物混合物0.25μl,雙蒸水2.5μl,tRNA譜檢測的引物組序列如權利要求1中表1所示;反應程序如下:95℃預變性30s,95℃變性10s,58.3℃退火延伸30s,72℃延伸30s,45次循環,95℃、60s,65℃、60s,65-95℃、15s,每個循環增加0.3℃。
4.根據權利要求3所述的檢測方法,其特征在于,步驟(1)中,總RNA抽提過程中,洗脫前加入10μl脫?;彌_液在37℃孵育40分鐘,然后加入20μlTE緩沖液洗脫,即可在總RNA抽提的同時實現tRNA去氨基酸。
5.根據權利要求3所述的檢測方法,其特征在于,步驟(3)中,退火化的條件為:65℃孵育5分鐘,立即冰上孵育5分鐘。
6.權利要求1所述引物組或權利要求2所述試劑盒在非疾病診斷目的的人類基因組成熟tRNA譜檢測中的應用。
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