[發明專利]一種細菌耐藥基因檢測的方法

有效

• 申請號: 201811257679.7
• 申請日: 2018-10-26
• 公開（公告）號: CN111100935B
• 公開（公告）日: 2023-03-31
• 發明（設計）人: 李慶閣;安曉霞;廖逸群;許曄
• 申請（專利權）人: 廈門大學
• 主分類號: C12Q1/689
• 分類號: C12Q1/689;C12N15/11
• 代理公司: 中國貿促會專利商標事務所有限公司 11038
• 代理人: 楊棽;林遠成

1.一種探針組，其包含一種檢測探針，以及至少兩種的媒介子探針，其中，

所述媒介子探針各自獨立地從5'至3'方向包含媒介子序列和靶特異性序列，所述靶特異性序列包含與特異于一種細菌耐藥基因的一種靶核酸序列或一種對照序列互補的序列，所述媒介子序列包含不與所述靶核酸序列或對照序列互補的序列，并且，所有媒介子探針所包含的媒介子序列彼此不同；和

所述檢測探針從3'至5'方向包含，與每一種媒介子序列或其部分互補的捕獲序列，以及模板序列；并且，所述檢測探針標記有報告基團和淬滅基團，其中，所述報告基團能夠發出信號，并且，所述淬滅基團能夠吸收或淬滅所述報告基團發出的信號；并且，所述檢測探針在與其互補序列雜交的情況下發出的信號不同于在未與其互補序列雜交的情況下發出的信號。

2.如權利要求1所述的探針組，其中，所述探針組具有選自下列的一個或多個特征：

(1)所述探針組包含2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種或更多種媒介子探針；

(2)所有媒介子探針所包含的媒介子序列彼此不同；并且，所有媒介子探針所包含的靶特異性序列彼此不同；

(3)所有媒介子探針各自靶向不同的靶核酸序列；

(4)至少一條媒介子探針或其所包含的靶特異性序列靶向對照序列；

(5)每一種細菌耐藥基因各自獨立地選自能夠導致細菌耐受碳青霉烯類抗生素的基因、能夠導致細菌耐受β-內酰胺類抗生素的基因、能夠導致細菌耐受頭孢菌素類抗生素的基因、能夠導致細菌耐受多粘菌素類抗生素的基因、能夠導致細菌耐受萬古霉素類抗生素的基因、能夠導致細菌耐受紅霉素的基因、能夠導致細菌耐受甲氧西林類抗生素的基因、能夠導致細菌耐受大環內酯類抗生素的基因，或其任何組合；

(6)所述探針組還包含上游寡核苷酸序列；其中，針對每一種靶核酸序列和媒介子探針，提供一種上游寡核苷酸序列，所述上游寡核苷酸序列包含與所述靶核酸序列互補的序列；并且，當與所述靶核酸序列雜交時，所述上游寡核苷酸序列位于所述媒介子探針的靶特異性序列的上游；

(7)所述探針組還包含下游寡核苷酸序列；其中，針對每一種靶核酸序列和媒介子探針，提供一種下游寡核苷酸序列，所述下游寡核苷酸序列包含與所述靶核酸序列互補的序列；并且，當與所述靶核酸序列雜交時，所述下游寡核苷酸序列位于所述媒介子探針的靶特異性序列的下游。

3.如權利要求2所述的探針組，其中，所述媒介子探針或其所包含的靶特異性序列靶向2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種、10種或更多種細菌耐藥基因的特異性核酸序列。

4.如權利要求2所述的探針組，其中，所述不同的靶核酸序列各自特異于相同或不同的細菌耐藥基因。

5.如權利要求2所述的探針組，其中，所述對照序列為不含有細菌耐藥基因的序列。

6.如權利要求5所述的探針組，其中，所述對照序列為不存在于細菌或人中的序列。

7.如權利要求5所述的探針組，其中，所述對照序列為擬南芥特異性序列。

8.如權利要求2所述的探針組，其中，每一種細菌耐藥基因各自獨立地選自，SPM、GIM、NDM、IMP、VIM、SIM、CTX-M、OXA-51、GES、PER、OXA-58、ACT、CMY I、ACC、CMY II、DHA、FOX、OXA-24、KPC、OXA-23、OXA-48、VEB、SHV、mecA、mecC、vanA、vanB、vanM、ermA、ermB、ermC、mcr-1、qnrA、qnrB和qnrS，或其任何組合。

9.如權利要求2所述的探針組，其中，所述探針組包含所述上游寡核苷酸序列和下游寡核苷酸序列，并且所述的上游寡核苷酸序列和下游寡核苷酸序列的5'端含有一段相同的寡核苷酸序列。

10.如權利要求9所述的探針組，其中，所述探針組進一步包含通用引物，其具有與所述相同的寡核苷酸序列互補的序列。