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[發明專利]制備帶有雙鏈分子標簽的二代測序接頭的方法在審

專利信息
申請號: 201811247524.5 申請日: 2018-10-25
公開(公告)號: CN109402224A 公開(公告)日: 2019-03-01
發明(設計)人: 鄭賢杰;朱垚;曹振;曹欣茹;宋東亮 申請(專利權)人: 翌圣生物科技(上海)有限公司
主分類號: C12Q1/6811 分類號: C12Q1/6811
代理公司: 上海精晟知識產權代理有限公司 31253 代理人: 馮子玲
地址: 200120 上海市浦*** 國省代碼: 上海;31
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: 雙鏈分子 標簽 退火 接頭序列 測序 制備 限制性內切酶 雙鏈 測序平臺 酶切位點 隨機堿基 退火程序 信息基礎 序列片段 補齊 混勻 堿基 酶切 合成 回收 分析
【權利要求書】:

1.一種制備帶有雙鏈分子標簽的二代測序接頭的方法,其特征在于,包括:

步驟一:合成接頭序列,接頭序列包含第一序列和第二序列,其中,所述第二序列包括:限制性內切酶的保護堿基和5個隨機堿基的雙鏈分子標簽,以及限制性內切酶HpyAV的酶切位點,第一序列和第二序列中具有互補的序列片段,

步驟二:接頭序列退火,混勻第一序列和第二序列,在退火體系中按退火程序退火形成雙鏈,

步驟三:補齊步驟二中所形成的雙鏈的接頭,

步驟四:酶切并回收接頭。

2.如權利要求1所述的制備帶有雙鏈分子標簽的二代測序接頭的方法,其特征在于:

其中,所述第二序列中還具有隨機堿基的單鏈分子標簽。

3.如權利要求1所述的制備帶有雙鏈分子標簽的二代測序接頭的方法,其特征在于:

其中,所述第二序列中還具有樣本標簽。

4.如權利要求1所述的制備帶有雙鏈分子標簽的第二代測序接頭的方法,其特征在于:

步驟三中,采用T4DNA聚合酶延伸補平步驟二中的退火產物。

5.如權利要求1所述的制備帶有雙鏈分子標簽的第二代測序接頭的方法,其特征在于:

步驟四中,采用限制性內切酶HpyAV酶切步驟三中的延伸產物,然后去除50bp以內的殘余雙鏈小片段,保留接頭。

6.如權利要求1所述的制備帶有雙鏈分子標簽的第二代測序接頭的方法,其特征在于:

第一序列的序列如下:

5-A*A*TGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTCTTTCCCTACACGAC-GCTCTTCCGAT*C*T-3。

7.如權利要求1所述的制備帶有雙鏈分子標簽的第二代測序接頭的方法,其特征在于:

第二序列的序列如下:

5-NNNN-ANNNNNGAAGG-AG*A*TCGGAAGAGC-ACACGTCTGAACTCCAGTCAC-NNNN-NNNNNNNN-ATCTCGTATGCCGTCTTCTGCT*T*G-3

其中,第1至4位為限制性內切酶的保護堿基,堿基數0-10個,第6位至第10位是五個隨機堿基的雙鏈分子標簽,

第50位至第53位是四個隨機堿基的單鏈分子標簽,

第54位至第61位是6-8個堿基的樣本標簽,

第5位至第15位是為限制性內切酶HpyAV的酶切位點。

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