[發明專利]制備帶有雙鏈分子標簽的二代測序接頭的方法在審
| 申請號: | 201811247524.5 | 申請日: | 2018-10-25 |
| 公開(公告)號: | CN109402224A | 公開(公告)日: | 2019-03-01 |
| 發明(設計)人: | 鄭賢杰;朱垚;曹振;曹欣茹;宋東亮 | 申請(專利權)人: | 翌圣生物科技(上海)有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6811 | 分類號: | C12Q1/6811 |
| 代理公司: | 上海精晟知識產權代理有限公司 31253 | 代理人: | 馮子玲 |
| 地址: | 200120 上海市浦*** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 雙鏈分子 標簽 退火 接頭序列 測序 制備 限制性內切酶 雙鏈 測序平臺 酶切位點 隨機堿基 退火程序 信息基礎 序列片段 補齊 混勻 堿基 酶切 合成 回收 分析 | ||
1.一種制備帶有雙鏈分子標簽的二代測序接頭的方法,其特征在于,包括:
步驟一:合成接頭序列,接頭序列包含第一序列和第二序列,其中,所述第二序列包括:限制性內切酶的保護堿基和5個隨機堿基的雙鏈分子標簽,以及限制性內切酶HpyAV的酶切位點,第一序列和第二序列中具有互補的序列片段,
步驟二:接頭序列退火,混勻第一序列和第二序列,在退火體系中按退火程序退火形成雙鏈,
步驟三:補齊步驟二中所形成的雙鏈的接頭,
步驟四:酶切并回收接頭。
2.如權利要求1所述的制備帶有雙鏈分子標簽的二代測序接頭的方法,其特征在于:
其中,所述第二序列中還具有隨機堿基的單鏈分子標簽。
3.如權利要求1所述的制備帶有雙鏈分子標簽的二代測序接頭的方法,其特征在于:
其中,所述第二序列中還具有樣本標簽。
4.如權利要求1所述的制備帶有雙鏈分子標簽的第二代測序接頭的方法,其特征在于:
步驟三中,采用T4DNA聚合酶延伸補平步驟二中的退火產物。
5.如權利要求1所述的制備帶有雙鏈分子標簽的第二代測序接頭的方法,其特征在于:
步驟四中,采用限制性內切酶HpyAV酶切步驟三中的延伸產物,然后去除50bp以內的殘余雙鏈小片段,保留接頭。
6.如權利要求1所述的制備帶有雙鏈分子標簽的第二代測序接頭的方法,其特征在于:
第一序列的序列如下:
5-A*A*TGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTCTTTCCCTACACGAC-GCTCTTCCGAT*C*T-3。
7.如權利要求1所述的制備帶有雙鏈分子標簽的第二代測序接頭的方法,其特征在于:
第二序列的序列如下:
5-NNNN-ANNNNNGAAGG-AG*A*TCGGAAGAGC-ACACGTCTGAACTCCAGTCAC-NNNN-NNNNNNNN-ATCTCGTATGCCGTCTTCTGCT*T*G-3
其中,第1至4位為限制性內切酶的保護堿基,堿基數0-10個,第6位至第10位是五個隨機堿基的雙鏈分子標簽,
第50位至第53位是四個隨機堿基的單鏈分子標簽,
第54位至第61位是6-8個堿基的樣本標簽,
第5位至第15位是為限制性內切酶HpyAV的酶切位點。
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