[發(fā)明專利]基因組學(xué)及生物信息學(xué)的微生物組學(xué)在線分析平臺架構(gòu)有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201811244122.X | 申請日: | 2018-10-24 |
| 公開(公告)號: | CN109448788B | 公開(公告)日: | 2022-03-15 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 周煌凱;夏昊強;高川;陸才瑞;張羽;陶勇;羅玥;張秋雪;黃文杰 | 申請(專利權(quán))人: | 廣州基迪奧生物科技有限公司 |
| 主分類號: | G16B20/00 | 分類號: | G16B20/00;G16B40/00;G16B40/30;G16B45/00 |
| 代理公司: | 廣州三環(huán)專利商標代理有限公司 44202 | 代理人: | 顏希文;宋靜娜 |
| 地址: | 510000 廣東省廣州市廣州國*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 基因組 生物 信息學(xué) 微生物 在線 分析 平臺 架構(gòu) | ||
1.一種基因組學(xué)及生物信息學(xué)的微生物組學(xué)在線分析平臺架構(gòu),包括:
底層支撐層,包括生物信息分析模塊和云平臺支撐模塊,所述生物信息分析模塊用于利用云平臺支撐模塊針對16S、ITS、18S以及微生物宏基因組測序進行個性化分析,與數(shù)據(jù)以及功能層、交互層交互,最后通過交互層以交互界面的形式對用戶呈現(xiàn),所述云平臺支撐模塊包含云平臺所需的軟硬件條件,所述生物信息分析模塊從所述數(shù)據(jù)以及功能層獲得原始數(shù)據(jù);
所述生物信息分析模塊的分析包括但不限于分組分析、OTU篩選、物種組成分析、OTU物種注釋、Alpha多樣性分析、Beta多樣性分析、功能分析、差異分析、個性報告生成;
所述生物信息分析模塊的分析過程包括對原始數(shù)據(jù)進行處理;進行OTU聚類及統(tǒng)計;進行物種組成分析、Alpha多樣性分析、Beta多樣性分析、功能分析、環(huán)境因子分析;生物信息分析模塊于實現(xiàn)個性化分析后,通過交互層以交互界面的形式對用戶呈現(xiàn);
數(shù)據(jù)以及功能層,用于向所述底層支撐層提供用戶數(shù)據(jù)和系統(tǒng)數(shù)據(jù),所述數(shù)據(jù)以及功能層的用戶數(shù)據(jù)包含客戶樣本相關(guān)的環(huán)境因素數(shù)據(jù)、動態(tài)分析結(jié)果,以及其他用戶數(shù)據(jù),所述系統(tǒng)數(shù)據(jù)包括為用戶提供的自主選用的各類分析流程和各類個性化分析工具;
交互層,用于將所述生物信息分析模塊的分析結(jié)果以交互界面的形式對用戶呈現(xiàn)。
2.如權(quán)利要求1所述的一種基因組學(xué)及生物信息學(xué)的微生物組學(xué)在線分析平臺架構(gòu),其特征在于:所述云平臺支撐模塊包括底層基礎(chǔ)的硬件層,為軟件運行和用戶交互提供環(huán)境的平臺架構(gòu)層,以及為用戶提供數(shù)據(jù)分析的應(yīng)用軟件層。
3.如權(quán)利要求1所述的一種基因組學(xué)及生物信息學(xué)的微生物組學(xué)在線分析平臺架構(gòu),其特征在于:所述交互層包括分析操作模塊和個性化結(jié)果導(dǎo)出模塊。
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