[發(fā)明專利]結直腸癌標志物及其應用

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 201811184826.2
• 申請日: 2018-10-11
• 公開（公告）號: CN111041090A
• 公開（公告）日: 2020-04-21
• 發(fā)明（設計）人: 李南南;易吉;吳逵;朱師達;羅慧娟;陳小芳
• 申請（專利權）人: 深圳華大生命科學研究院
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;C12N15/11
• 代理公司: 北京清亦華知識產(chǎn)權代理事務所(普通合伙) 11201
• 代理人: 趙天月

本發(fā)明涉及基因檢測領域，具體涉及一種結直腸癌標志物及其應用。所述標志物包括選自下列中的至少一種：SEQ ID NO:1；來源于消化鏈球菌且與所述SEQ ID NO:1具有95％以上同源性的核酸序列。同時還提供了引物對、核酸探針、構建體以及試劑盒以及對待測者進行結直腸癌檢測的系統(tǒng)。通過本發(fā)明提供的標志物可以實現(xiàn)結直腸癌的快速檢測。

技術領域

本發(fā)明涉及基因檢測領域，具體涉及一種結直腸癌標志物及其應用，尤其涉及一種結直腸癌標志物、引物對、核酸探針、試劑盒以及對待測者進行結直腸癌檢測的系統(tǒng)。

背景技術

據(jù)統(tǒng)計，結直腸癌(colorectal cancer，CRC)在各類癌癥中發(fā)病率排名第三，致死率排名第四，近55％的發(fā)病案例發(fā)生在較發(fā)達國家。在年齡小于40歲的人中發(fā)生率較低，但隨著年齡增加發(fā)生率亦逐漸增高。通常認為飲食習慣的西方化會增加CRC發(fā)病率，但目前美國及其他高收入國家發(fā)病率卻保持穩(wěn)定甚至下降，推測與乙狀結腸鏡檢查及結腸鏡下的息肉切除術的增加有關。結直腸癌也是目前最可預防的腫瘤之一，醫(yī)學界認為如果及早發(fā)現(xiàn)，腸癌是最易治愈的癌癥。傳統(tǒng)的結直腸癌篩選方法主要是結腸鏡檢查，另外還有活體組織檢查和脫落細胞學檢查，這幾種檢查方法都是侵入式的，尤其是脫落細胞學檢查取材繁瑣，不易獲得滿意的標本，臨床應用少。所以如果沒有相關癥狀，很多人并不愿意去做結直腸癌的早期篩查。

因此，針對結直腸癌的早期診斷和篩查，還需要進一步改進。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明旨在至少在一定程度上解決相關技術中的技術問題之一。為此，本發(fā)明的一個目的在于提出一種結直腸癌腫瘤標志物、引物對、試劑盒以及對待測者進行結直腸癌檢測的系統(tǒng)。本發(fā)明提供的結直腸癌腫瘤標志物能夠用于結直腸癌病人的早期篩查和診斷。

本發(fā)明是基于發(fā)明人的如下發(fā)現(xiàn)所獲得的：

人體腸道微生物組包含了數(shù)量巨大的微生物，它們參與食物藥物代謝、人體免疫調(diào)節(jié)，在保持人體健康中起著極其重要的作用。有大量文獻報道消化鏈球菌與結直腸癌有很強的相關性，研究疾病的不同階段中微生物組成分的改變能夠作為一種新的用于癌癥診斷及預后效果測試的手段：因此本研究想通過測定腸道中消化鏈球菌的特定基因，來對結直腸癌的發(fā)生與發(fā)展進行早期檢測和及時干預治療。

在有case-control的人群中對消化鏈球菌的特異性基因進行定量PCR(qPCR)檢測，確定基因的量，分析并驗證這些基因預測結直腸癌的概率。以開發(fā)結直腸癌患者的腸道微生物基因檢測試劑盒，為廣大人群提供快速簡便的結腸癌早期篩查、診斷的有效措施。為實現(xiàn)結直腸癌的早期預警、診斷和干預提供依據(jù)。

具體而言，本發(fā)明提供了如下技術方案：

根據(jù)本發(fā)明的第一方面，本發(fā)明提供了一種結直腸癌標志物，所述結直腸癌標志物包括選自下列中的至少一種：SEQ ID NO:1；或者來源于消化鏈球菌且與所述SEQ ID NO:1具有95％以上同源性的核酸序列。研究表明消化鏈球菌與結直腸癌具有很強的相關性，本發(fā)明通過利用宏基因組測序研究，篩選了消化鏈球菌中與結直腸癌相關性強的特定核酸序列，作為結直腸癌檢測的標志物，能夠用于結直腸癌的早期診斷和篩查。其中，結直腸癌標志物可以為SEQ ID NO:1，也可以是來源于消化鏈球菌且與SEQ ID NO:1具有95％以上同源性的核酸序列，優(yōu)選為具有98％以上同源性的核酸序列，更優(yōu)選為具有99％以上同源性的核酸序列。通過這些標志物可以用來反映結直腸癌的情況。

在本發(fā)明的一些實施例中，所述來源于消化鏈球菌且與所述SEQ ID NO:1具有同源性的核酸序列可以表現(xiàn)為：與SEQ ID NO:1所示核酸序列存在密碼子簡并的核酸序列。即將SEQ ID NO:1所示核酸序列進行同義替換所得到的核酸序列，也可以作為結直腸癌標志物。