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[發(fā)明專利]檢測NAT2基因突變分型的引物、試劑盒和方法在審

專利信息
申請?zhí)枺?/td> 201811157443.6 申請日: 2018-09-30
公開(公告)號: CN109337970A 公開(公告)日: 2019-02-15
發(fā)明(設(shè)計)人: 牛林梅;吳鵬飛;王淑一 申請(專利權(quán))人: 杭州艾迪康醫(yī)學檢驗中心有限公司
主分類號: C12Q1/6883 分類號: C12Q1/6883;C12N15/11
代理公司: 杭州千克知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 33246 代理人: 黎雙華
地址: 310030 浙江省杭州*** 國省代碼: 浙江;33
權(quán)利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關(guān)鍵詞: 代謝表型 分型 引物 突變 個體化治療 核苷酸序列 分型檢測 基因突變 檢測結(jié)果 擴增檢測 藥物代謝 對引物 抗結(jié)核 試劑盒 異煙肼 種檢測 檢測 治療
【說明書】:

發(fā)明公開了一種檢測與異煙肼等藥物代謝有關(guān)的NAT2(N?acetyltransferase 2,NAT2)基因突變分型的引物和方法,其包括擴增檢測核苷酸序列的2對引物;采用PCR擴增技術(shù)和Sanger測序技術(shù)。本發(fā)明可快速地將NAT2基因突變分型檢測出來,并可判斷其代謝表型。利用本發(fā)明完成的檢測結(jié)果準確,在抗結(jié)核治療時,可結(jié)合患者NAT2基因型的不同或代謝表型實施個體化治療方案。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明屬生命科學和生物技術(shù)領(lǐng)域,特別涉及檢測與異煙肼等藥物代謝有關(guān)的NAT2基因分型的引物和方法。

背景技術(shù)

結(jié)核病(TB)是由結(jié)核分枝桿菌引起的以肺部病變?yōu)橹鞯穆詡魅拘约膊 =陙砥浒l(fā)病率在全球范圍內(nèi)都有升高的趨勢。在WHO推薦的標準抗結(jié)核化療方案中,異煙肼是不可替代的一線抗結(jié)核藥,其常見的不良反應(yīng)有肝損傷、胃腸道反應(yīng)和皮疹等。抗結(jié)核藥物誘導(dǎo)的肝損傷(anti-tuberculosisdrug-induced hepatotoxicity,ATDH)在結(jié)核病標準治療中發(fā)生率約為2%~28%,是結(jié)核患者停止化療的最常見原因之一。ATDH如果沒有及時發(fā)現(xiàn)并停止用藥,將導(dǎo)致患者肝衰竭甚至死亡。

異煙肼為胺類化合物,在體內(nèi)通過N-乙酰基轉(zhuǎn)移酶2(N-acetyltransferase 2,NAT2)代謝,最終產(chǎn)生無毒的乙酰肼及二乙酰肼。N-乙酰基轉(zhuǎn)移酶2由NAT2基因編碼,是藥物二相代謝酶,催化乙酰基團從乙酰CoA轉(zhuǎn)移到其作用底物芳香胺及雜環(huán)胺類物質(zhì)上,在人體對芳香胺類及雜環(huán)類物質(zhì)的活化和(或)滅活以及某些藥物的代謝過程中起著重要的作用。

NAT2基因的單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)可引起相應(yīng)代謝酶含量或酶活性的改變,從而影響個體的藥物代謝能力。NAT2基因多態(tài)性由其編碼區(qū)的點突變所造成,根據(jù)野生型與突變型的組合形成不同的基因型:野生純合的快乙酰型、野生突變雜合的中間型、突變純合的慢乙酰型。研究發(fā)現(xiàn)快代謝型患者中極少出現(xiàn)藥物性肝損傷,慢代謝型患者較易出現(xiàn)藥物性肝損傷。

因此,在抗結(jié)核治療時,結(jié)合患者NAT2基因型的不同或代謝表型實施個體化治療方案:對慢代謝型患者,在治療初期減少異煙肼的用量,可減少藥物不良反應(yīng),提高患者依從性;對快代謝型患者,則適當增加異煙肼劑量,可提高早期療效。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的是提供一種檢測NAT2基因突變分型的引物,采用PCR技術(shù),可用于快速檢測結(jié)核病患者NAT2基因分型并判斷患者的代謝表型。

檢測NAT2基因突變分型的引物,其特征在于所使用的擴增引物和測序引物均為:

NAT2-1-F:CGAGGAAATCAAATGCTAAAG

NAT2-1-R:GCTCTCTCCTGATTTGGTCC

NAT2-2-F:AGGATCAGCCTCAGGTGC

NAT2-2-R:TTTTATGGATGAAAGTATTTGATG。

本發(fā)明還提供了檢測NAT2基因突變分型的試劑盒,包括

①血液樣本DNA抽提試劑;

②檢測體系PCR擴增反應(yīng)試劑;包括擴增引物

③測序體系試劑;包括測序引物;

④陽性對照品和陰性對照品。

其中,擴增引物和測序引物堿基序列均為:

NAT2-1-F:CGAGGAAATCAAATGCTAAAG

NAT2-1-R:GCTCTCTCCTGATTTGGTCC

NAT2-2-F:AGGATCAGCCTCAGGTGC

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