[發明專利]一種抗原表位的檢測方法、系統及終端設備

有效

• 申請號: 201811153746.0
• 申請日: 2018-09-30
• 公開（公告）號: CN109326324B
• 公開（公告）日: 2022-01-25
• 發明（設計）人: 羊紅光;智杏娟;成彬;柳凌云
• 申請（專利權）人: 河北省科學院應用數學研究所
• 主分類號: G16B20/00
• 分類號: G16B20/00
• 代理公司: 石家莊國為知識產權事務所 13120
• 代理人: 張貴勤

1.一種抗原表位的檢測方法，其特征在于，包括：

獲取訓練樣本和待檢測蛋白質序列，所述訓練樣本包括表位樣本和非表位樣本，所述表位樣本為包含抗原表位的蛋白質序列，所述非表位樣本為未包含抗原表位的蛋白質序列；

分別提取所述表位樣本的特征向量和所述非表位樣本的特征向量；

利用所述表位樣本的特征向量和所述非表位樣本的特征向量對標準神經網絡模型進行訓練，得到預測神經網絡模型；

提取所述待檢測蛋白質序列的特征向量，并將所述待檢測蛋白質序列的特征向量輸入至所述預測神經網絡模型中，得到對應的抗原表位檢測結果；

其中，所述提取所述表位樣本的特征向量，包括，

提取所述表位樣本的位置特征向量；

提取所述表位樣本的理化特征向量；

將所述位置特征向量和所述理化特征向量進行組合，得到所述表位樣本的特征向量；

具體的，所述提取所述表位樣本的位置特征向量，包括，

獲取所述表位樣本包含的氨基酸的種類；

統計每一種氨基酸在所述表位樣本中的位置信息；

根據所述每一種氨基酸的位置信息生成對應的位置向量；

對所述每一種氨基酸的位置向量進行歸一化處理得到對應的概率向量，具體為：根據得到一種氨基酸在所述表位樣本中第i次出現的概率值，將所述一種氨基酸對應的所有概率值進行排列，生成所述一種氨基酸對應的概率向量；

根據所述每一種氨基酸的概率向量計算對應的位置熵，具體為：根據計算所述一種氨基酸的位置熵，h表示所述一種氨基酸的位置熵；

將所有種類的氨基酸對應的位置熵進行排列，生成所述表位樣本的位置特征向量；

其中，d_i為所述一種氨基酸在所述表位樣本中第i次出現的位置信息，c為所述一種氨基酸在所述表位樣本中出現的總次數，p_i為所述一種氨基酸在所述表位樣本中第i次出現的概率值。

2.如權利要求1所述的抗原表位的檢測方法，其特征在于，所述理化特征向量包括親水特征向量；

所述提取所述表位樣本的理化特征向量，包括：

獲取所述表位樣本中的每個氨基酸的親水度；

將所有氨基酸的親水度進行排列，得到所述親水特征向量。

3.如權利要求1所述的抗原表位的檢測方法，其特征在于，所述理化特征向量包括疏水特征向量；

所述提取所述表位樣本的理化特征向量，包括：

獲取所述表位樣本中的每個氨基酸的疏水度；

將所有氨基酸的疏水度進行排列，得到所述疏水特征向量。