[發明專利]抗腫瘤藥物的篩選方法在審
| 申請號： | 201811145989.X | 申請日： | 2018-09-28 |
| 公開（公告）號： | CN109207593A | 公開（公告）日： | 2019-01-15 |
| 發明（設計）人： | 張卓;陳河兵;李昊;江帥;李睿江;洪浩;李宛瑩;黃昕;趙誠輝;伯曉晨 | 申請（專利權）人： | 中國人民解放軍軍事科學院軍事醫學研究院 |
| 主分類號： | C12Q1/6886 | 分類號： | C12Q1/6886 |
| 代理公司： | 北京超凡志成知識產權代理事務所(普通合伙) 11371 | 代理人： | 李進 |
| 地址： | 100000 北*** | 國省代碼： | 北京;11 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 抗腫瘤藥物 基因組 篩選 目標類型 重疊基因組 腫瘤 基因 抗腫瘤藥物篩選 癌癥 評定 本質屬性 全基因組 治療效果 重疊基因 必需性 普適性 比對 兩組 下調 分析 | ||
1.一種抗腫瘤藥物的篩選方法，其特征在于，包括以下步驟：將某種藥物的有效下調表達基因組與目標類型腫瘤的候選癌癥基因組進行比對，得到有效下調表達基因組和候選癌癥基因組的重疊基因組；
所述重疊基因組占所述候選癌癥基因組的30％以上時，該藥物為目標類型腫瘤的抗腫瘤藥物。
2.根據權利要求1所述的篩選方法，其特征在于，所述重疊基因組占所述候選癌癥基因組的35％以上時，該藥物為目標類型腫瘤的抗腫瘤藥物。
3.根據權利要求1所述的篩選方法，其特征在于，所述某種藥物的有效下調表達基因組中的基因為該藥物的下調表達基因組按顯著性排序前20％表達下調的基因，優選為前15％表達下調的基因，進一步優選為前10％表達下調的基因。
4.根據權利要求3所述的篩選方法，其特征在于，所述藥物的下調表達基因組通過LINCS計劃得到。
5.根據權利要求1所述的篩選方法，其特征在于，所述目標類型腫瘤為至少1種類型腫瘤，優選為23種類型腫瘤。
6.根據權利要求1所述的篩選方法，其特征在于，所述候選癌癥基因組中包括候選癌癥基因，所述候選癌癥基因為所述目標類型腫瘤中80％以上腫瘤的顯著上調表達基因。
7.根據權利要求6所述的篩選方法，其特征在于，所述腫瘤的顯著上調表達基因為腫瘤細胞的必需基因。
8.根據權利要求6所述的篩選方法，其特征在于，所述腫瘤的顯著上調表達基因通過分析篩選腫瘤細胞中表達上調的基因得到。
9.根據權利要求8所述的篩選方法，其特征在于，所述腫瘤細胞中表達上調的基因通過TCGA數據庫得到。
10.根據權利要求8或9所述的篩選方法，其特征在于，所述分析篩選包括：腫瘤的顯著上調表達基因為腫瘤細胞的必需基因中前1000個表達顯著上調的基因，同時為腫瘤細胞的全基因組中前5000個表達顯著上調的基因。
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