[發(fā)明專利]自閉癥生物標志物及其應用

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201811120111.0
• 申請日: 2018-09-25
• 公開（公告）號: CN109182577B
• 公開（公告）日: 2022-03-15
• 發(fā)明（設計）人: 王明幫;王艷;周家秀;何福生
• 申請（專利權）人: 深圳市英馬諾生物科技有限公司
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6869;C12N15/11
• 代理公司: 深圳市六加知識產權代理有限公司 44372
• 代理人: 曲衛(wèi)濤

1.一種篩選易患自閉癥的生物樣品的系統(tǒng)，其特征在于，包括：

自閉癥生物標志物檢測裝置，所述自閉癥生物標志物檢測裝置用于分別檢測待測生物樣品和健康對照樣品中的宏基因組測序數(shù)據(jù)，并確定兩者的腸道菌群毒力因子基因的多態(tài)性；

其中，腸道菌群毒力因子基因的多態(tài)性是指樣品中所含的腸道菌群毒力因子基因的種類多樣性；多態(tài)性高是指樣品中所含的腸道菌群毒力因子基因的種類多；

以及

分析裝置，所述分析裝置與所述自閉癥生物標志物檢測裝置相連，用于從所述自閉癥生物標志物檢測裝置接收所述待測生物樣品和健康對照樣品中的腸道菌群毒力因子基因的多態(tài)性確定結果，并基于所述多態(tài)性確定結果確定所述待測生物樣品是否易患自閉癥，其中，所述待測生物樣品的腸道菌群毒力因子基因的多態(tài)性顯著高于健康對照樣品，是所述待測生物樣品易患自閉癥的指示，

其中，所述待測生物樣品和健康對照樣品均為糞便樣品，分別來自待測個體和健康人；

其中，所述自閉癥生物標志物檢測裝置包括：

糞便DNA提取單元；

宏基因組建庫和測序單元；以及

多態(tài)性確定單元，

其中，所述多態(tài)性確定單元適于基于宏基因組測序數(shù)據(jù)分別確定所述待測生物樣品和健康對照樣品的腸道菌群毒力因子基因的多態(tài)性，

其中，所述宏基因組建庫和測序單元適于實施鳥槍法宏基因組測序，

其中，采用Illumina HiSeq 2500測序平臺作為所述宏基因組建庫和測序單元，

其中，在所述多態(tài)性確定單元中，基于宏基因組測序數(shù)據(jù)分別確定所述待測生物樣品和健康對照樣品的腸道菌群毒力因子基因的多態(tài)性，進一步包括：將所述宏基因組測序數(shù)據(jù)比對到毒力因子基因數(shù)據(jù)庫virulence factor database, http://www.mgc.ac.cn/VFs/main.htm，以便得到各樣品的腸道菌群毒力因子基因的多態(tài)性。

2.根據(jù)權利要求1所述的系統(tǒng)，其特征在于，在所述分析裝置中，基于所述多態(tài)性確定結果確定所述待測生物樣品是否易患自閉癥進一步包括：通過多維方差分析對所述待測生物樣品和健康對照樣品中的腸道菌群毒力因子基因的多態(tài)性進行顯著差異分析，并對顯著差異分析結果進行稀疏偏最小二乘判別分析，以便確定所述待測生物樣品的腸道菌群毒力因子基因的多態(tài)性是否顯著高于健康對照樣品。