[發明專利]位于白菜A04染色體上的抗霜霉病基因BrRLP48及與其相連鎖的SNP標記有效
| 申請號: | 201811086138.2 | 申請日: | 2018-09-18 |
| 公開(公告)號: | CN109136401B | 公開(公告)日: | 2019-06-18 |
| 發明(設計)人: | 于拴倉;張彬;蘇同兵;張鳳蘭;李佩榮;李盼;余陽俊;張德雙;趙岫云;汪維紅 | 申請(專利權)人: | 北京市農林科學院 |
| 主分類號: | C12Q1/6895 | 分類號: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245 | 代理人: | 關暢;陳曉慶 |
| 地址: | 100097 北京市海淀區*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 抗霜霉病基因 白菜 白菜霜霉病 自交系 染色體 分子標記 分子育種 抗性品種 抗性 表型 可用 位點 抗病 群體 成功 | ||
本發明公開了位于白菜A04染色體上的抗霜霉病基因BrRLP48及與其相連鎖的SNP標記。本發明利用白菜抗病自交系“MM”和感病自交系“白陽”的DH群體和F2群體在白菜第4號染色體上成功定位到與白菜霜霉病抗性相關的QTL位點Br?DM04,可以解釋22.3%的表型變異,并找到抗霜霉病基因及與其連鎖的SNP分子標記A04_5326733。基于KASP技術的分子標記A04_5326733可用于白菜霜霉病抗性品種鑒定及分子育種。
技術領域
本發明屬于生物技術領域,具體涉及位于白菜A04染色體上的抗霜霉病基因BrRLP48及 與其相連鎖的SNP標記。
背景技術
大白菜原產我國,是我國栽培面積最大的蔬菜作物,目前已逐漸成為世界性的蔬菜作物。 據農業部統計,我國大白菜年種植面積近4000萬畝,占全國蔬菜總播種面積的15%左右,可 見大白菜在我國菜籃子工程中舉足輕重。植物病害是影響植物正常生長重大威脅之一。尤其 在農業生產中,病害會直接影響農作物的產量和質量。霜霉病是由專性寄生霜霉菌 (Hyaloperonosporaparasitica)引起的真菌病害,是危害大白菜的三大病害(病毒病、霜 霉病和軟腐病)之一,該病流行范圍廣、發病速度快,對白菜的產量和品質造成嚴重影響, 流行年份發病率高達80-90%,減產30-50%。生產中通常使用殺菌劑進行霜霉病防治,不僅 增加了生產成本,造成環境污染,還可能引起霜霉菌生理小種的變異及病原菌的抗藥性。因 此,霜霉病抗性品種的培育成為降低病害損失的最安全高效的方法之一。
遺傳學研究表明,白菜霜霉病抗性是一個復雜的數量性狀,涉及多種抗病基因,依靠傳 統的育種方法獲得抗病白菜的周期較長。隨著分子生物學的發展,分子輔助育種技術可以在 早世代進行準確、穩定的選擇,從而加速育種進程,提高育種效率,但該技術的基礎是必須 具有優良的目標基因及與其緊密連鎖的分子標記。
發明內容
本發明的第一個目的是提供檢測白菜基因組中A04_5326733位點的多態性或基因型的物 質或A04_5326733位點的新用途。
本發明提供了檢測白菜基因組中A04_5326733位點的多態性或基因型的物質或A04_5326733位點在如下(1)-(6)任一中的應用:
(1)鑒定或輔助鑒定白菜霜霉病抗性;
(2)篩選或輔助篩選抗霜霉病的白菜品種;
(3)白菜育種;
(4)制備鑒定或輔助鑒定白菜霜霉病抗性的產品;
(5)制備篩選或輔助篩選抗霜霉病的白菜品種的產品;
(6)制備白菜育種的產品;
所述A04_5326733位點為白菜基因組中序列1自5’端起第101位核苷酸,A04_5326733 位點為T/A多態。
上述應用中,所述檢測白菜基因組中A04_5326733位點的多態性或基因型的物質包括由 引物1、引物2和引物3所組成的引物組;
所述引物1為如下a1)或a2):
a1)序列2所示的單鏈DNA分子;
a2)將a1)限定的單鏈DNA分子進行一個或幾個堿基的缺失、插入和/或改變得到的與 a1)限定的單鏈DNA分子具有相同功能的單鏈DNA分子;
所述引物2為如下b1)或b2):
b1)序列3所示的單鏈DNA分子;
b2)將b1)限定的單鏈DNA分子進行一個或幾個堿基的缺失、插入和/或改變得到的與 b1)限定的單鏈DNA分子具有相同功能的單鏈DNA分子;
所述引物3為如下c1)或c2):
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