[發明專利]一種通過函數擬合確定DNA片段臨界聚乙二醇濃度的系統及方法

在審

• 申請號: 201811036503.9
• 申請日: 2018-09-07
• 公開（公告）號: CN109022268A
• 公開（公告）日: 2018-12-18
• 發明（設計）人: 柏錦程;張振
• 申請（專利權）人: 南京微略生物科技有限公司
• 主分類號: C12M1/38
• 分類號: C12M1/38;C12M1/36;C12M1/34;C12M1/00;C12N15/10
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• 代理人: 暫無信息

本發明專利公布了通過函數擬合確定DNA片段臨界聚乙二醇濃度的系統及方法，裝置包括：控制模塊、PCR擴增儀、容器箱、渦旋震蕩儀、磁分離架、真空泵、干燥箱、紫外分光光度計、若干羧基磁顆粒、2根離心管。本發明避免了凝膠電泳的過程，節約時間，通過控制模塊設定各個儀器的運行參數并接受數據信息，節約人力和時間，具備一定自動化水平，通過多次改變聚乙二醇濃度獲得多組數據，數據來源更為真實可靠，通過曲線擬合得到函數關系，定量直觀有效，更為準確，提供一種擁有一定自動能力、可應用于含磁顆粒DNA溶液、耗時較少、操作簡便、精度更高的通過函數擬合確定DNA片段臨界聚乙二醇濃度的系統及方法。

技術領域

本發明涉及微量DNA提取領域，尤其涉及通過函數擬合確定DNA片段臨界聚乙二醇濃度的系統及方法。

背景技術

DNA分子的提取及其樣品的制備在分子生物醫學中具有重要作用，尤其是在相關的醫學研究中，更是必不可少的前提條件，而微量DNA提取對于一些疾病的分子診斷和微生物的分子檢測具有重要作用，其提取的高效性直接影響著診斷與檢測的靈敏度

目前，為了進行快速且高效的DNA提取，利用不同聚乙二醇(PEG)濃度下不同長度的DNA片段會形成不同沉淀，并在沉淀后在堿基和羧基的相互作用下吸附結合到磁顆粒表面上去，而在離子濃度較低的溶液中這種吸附又會逐漸接觸，從磁顆粒的表面脫附下來，由此完成DNA的微量提取的原理，以羧基修飾的磁顆粒作為載體，在聚乙二醇(PEG)和鹽的共同作用下，進行微量DNA的可逆吸附與脫附，以此實現核酸DNA的分離和純化。

采用聚乙二醇與羧基磁性顆粒結合提取微量DNA的方法與傳統的凝膠電泳DNA提取法相比，聚乙二醇與羧基磁性顆粒結合提取微量DNA的方法在DNA的沉淀分離方面更為快速且有效，操作簡單，且在高通量自動化的操作平臺也很適用。

雖然聚乙二醇與羧基磁性顆粒結合提取微量DNA的方法具備明顯的優勢，但也存在一些問題，其中最為主要的問題是聚乙二醇的濃度選擇，不同的聚乙二醇濃度不僅可使得相應的DNA片段發生沉淀，其沉淀速度也收到濃度的影響，使得所要提取的目標DNA片段發生最快速沉淀的聚乙二醇濃度即為臨界聚乙二醇濃度。

以前研究臨界聚乙二醇濃度的方法有：沉淀法、熒光影像法、粘度測定法、動態光散射法等，但這些方法不能在含有磁顆粒的DNA溶液中使用，因此不適用于聚乙二醇與羧基磁性顆粒結合提取微量DNA的方法，現有的凝膠電泳法雖可確定臨界聚乙二醇濃度，但其凝膠電泳過程耗時比較長，且需要認為判斷，得出的臨界聚乙二醇濃度并不精確，因此目前需要一種可靠有效的方法來確定聚乙二醇與羧基磁性顆粒結合提取微量DNA片段的臨界聚乙二醇濃度。

發明內容

本發明的目的是解決微量DNA片段提取過程中臨界聚乙二醇濃度難以確定問題，提供一種可應用于含磁顆粒DNA溶液、耗時較少、操作簡便、精度更高的通過函數擬合確定DNA片段臨界聚乙二醇濃度的系統及方法。