[發明專利]一種基于偏微分方程的MALDI質譜峰檢測方法有效
| 申請號: | 201811031626.3 | 申請日: | 2018-09-05 |
| 公開(公告)號: | CN109271913B | 公開(公告)日: | 2022-03-29 |
| 發明(設計)人: | 李遠祿;李俊;趙偉靜;蔣民;周慧敏;孫雙龍 | 申請(專利權)人: | 南京信息工程大學 |
| 主分類號: | G06K9/00 | 分類號: | G06K9/00;G01N27/626 |
| 代理公司: | 南京蘇高專利商標事務所(普通合伙) 32204 | 代理人: | 柏尚春 |
| 地址: | 210044 江蘇*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 基于 微分方程 maldi 質譜峰 檢測 方法 | ||
1.一種基于偏微分方程的MALDI質譜峰檢測方法,其特征在于包括步驟:
(1)輸入待處理的MALDI質譜信號,并對MALDI質譜做基線校正;
(2)對校正后的信號f(x),使用下式的導數譜方法對其做增強:
F(x)=f(x)-c·f(x)(2)
f(x)是基線校正后的MALDI質譜信號,F(x)是增強后的MALDI質譜信號,c是增強系數,將增強后的噪聲信號作為分數階擴散模型的初始信號u(x,0),經擴散后得到增強后的信號,由此得到時間-空間分數階擴散導數譜模型,其中,x是空間長度;所述的時間-空間分數階擴散導數譜模型如下公式:
其中,t是時間長度,c是增強系數,g[u(x,t)]是擴散函數,如下公式:
t0=0,t1=τ,…,tk=kτ,k=1,2,…,N,
x0=0,x1=h,…,xi=ih,i=1,2,…,M,
λ是控制擴散強度的閾值,其取值范圍為500-2000,α表示時間分數階次,β表示空間分數階次,τ和h分別為時間和空間步長,k和i分別為時間和空間序列,M由質譜信號長度確定,N由去噪保峰效果確定;
(3)對時間分數階導數進行基于Caputo分數階定義的離散化;
(4)對空間分數階導數進行基于Riemann-Liouville分數階定義的離散化;
(5)使用卷積運算,得到可保證運行效率的增強平滑的有限差分方法,即作為MALDI質譜峰檢測中平滑步驟的方法;
(6)對通過分數階擴散平滑最終獲得的MALDI質譜信號做峰識別;
(7)輸出峰識別得到的MALDI譜峰列表。
2.根據權利要求1所述的一種基于偏微分方程的MALDI質譜峰檢測方法,其特征在于:在步驟(1)中,所述的基線校正包括三次樣條插值法。
3.根據權利要求1所述的一種基于偏微分方程的MALDI質譜峰檢測方法,其特征在于:在步驟(3)中,所述的Caputo分數階定義如下公式:
導數離散化可得:
其中,表示離散后的u(xi,tk),k和i分別為時間和空間序列,
4.根據權利要求1所述的一種基于偏微分方程的MALDI質譜峰檢測方法,其特征在于:在步驟(4)中,所述的空間分數階導數的離散化如下公式:
其中
5.根據權利要求1所述的一種基于偏微分方程的MALDI質譜峰檢測方法,其特征在于:在步驟(5)中,所述的差分方法如下:
Uk=Γ(3-α)ταg·(Uk-1*r)+Uk-1,k=1,
其中
6.根據權利要求1所述的一種基于偏微分方程的MALDI質譜峰檢測方法,其特征在于:在步驟(6)中,所述的峰識別方法包括選擇幅度閾值和局部極大值法。
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