[發明專利]BSND基因SNP突變位點分型引物及其在冠心病預測中的應用

在審

• 申請號: 201811009584.3
• 申請日: 2018-08-31
• 公開（公告）號: CN109295197A
• 公開（公告）日: 2019-02-01
• 發明（設計）人: 毛源;袁杭;曹鵬;鄭偉
• 申請（專利權）人: 南京金域醫學檢驗所有限公司
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;C12N15/11
• 代理公司: 南京縱橫知識產權代理有限公司 32224
• 代理人: 董建林

本發明屬于生物技術領域，特別涉及BSND基因SNP突變位點分型引物及其在冠心病預測中的應用，包含：1）擴增rs6682884位點的引物：上游引物序列5’ACCCAAGGCTGAGATGTTTGTG3’；下游引物序列5’CTCCATATCATCCCATTTTGCA3’；2）進行突變位點分型的探針：C型探針序列5’CCGTAGCTTCTCGTC3’；A型探針序列5’CGTAGCTTCTAGTCTGG3’。本發明公開了一種新的能夠解釋中國漢族人群的冠心病遺傳基礎的與冠心病易感性相關的BSND基因，同時確證了BSND基因上與冠心病易感性密切相關的SNP位點rs6682884，檢測精度和靈敏度高。

技術領域

本發明屬于生物技術領域，特別涉及與冠心病易感性相關的BSND基因上的單核苷酸多態性(single nucleotide polymorphism，SNP)位點，以及用于檢測所述SNP位點的相應體外檢測試劑，尤其涉及所述SNP位點的核酸親和配體在制備用于檢測、篩查或預測漢族人群冠心病易感性的組合物中的應用。

背景技術

冠狀動脈粥樣硬化性心臟病(coronary heart disease，CHD)，簡稱冠心病，是一種病因復雜的疾病，環境和遺傳因素均與冠心病的發生發展有關。在美國及許多發達國家，冠心病位列死亡原因首位。目前，我國冠心病的死亡率也居高不下且呈逐年上升趨勢。2015年中國城市居民冠心病死亡率為110.67/10萬，農村居民為110.91/10萬，與上一年相比略上升。冠心病的發病率也呈現出地域差異，1987年～1993年我國多省市35～64歲人群調查(中國MONICA)發現，最高發病率為108.7/10萬(山東青島)，最低為3.3/10萬(安徽滁州)，有較顯著的地區差異，北方省市普遍高于南方省市。

近年來，對于冠心病的分子學研究也越來越引起重視。自2007年，AnnaHelgadottir和Ruth Mcpherson同時發現了9p21區域冠心病與冠心病顯著關聯之后，陸續有50多個冠心病易感位點被發現。但這些位點均為歐美人群的易感位點，與中國人群的相關性尚未驗證。我國在2011年發表了第一篇關于中國人群冠心病易感位點的文章，研究證實了一個新的與中國漢族人冠心病相關的易感位點6p24.1(rs6903956)。2016年，高敏等對歐美人群的5個易感位點與漢族人冠心病的相關性進行了研究，結果表明其中僅有一個與中國漢族冠心病遺傳易感性顯著相關。

我國對于冠心病的分子研究還處于起步階段，已知用來解釋中國漢族人群的冠心病遺傳基礎的基因及位點的數量較少，為了提高漢族人群冠心病易感性檢測、篩查或預測的準確度，從而更容易、更直接、更靈敏且更特異性地檢測、篩查或預測漢族人群冠心病易感性，有必要尋找新的與冠心病易感性相關的易感基因和SNP位點。因此，本研究針對中國江蘇人群進行冠心病相關基因篩查，得出了一項與冠心病易感性有關的SNP位點突變。

發明內容

本發明旨在提供一種新的能夠解釋中國漢族人群的冠心病遺傳基礎的與冠心病易感性相關的BSND基因，同時確證了BSND基因上與冠心病易感性密切相關的SNP位點rs6682884。

為了實現上述發明目的，本發明采用的技術方案為：BSND基因SNP突變位點分型引物，包含：

1)擴增rs6682884位點的引物：

上游引物序列5’ACCCAAGGCTGAGATGTTTGTG3’；

下游引物序列5’CTCCATATCATCCCATTTTGCA3’；

2)進行突變位點分型的探針：

A型探針序列5’CGTAGCTTCTAGTCTGG3’；

C型探針序列5’CCGTAGCTTCTCGTC3’。

所述的C型探針的5’端使用FAM熒光基團修飾，3’端使用MGB修飾；A型探針的5’端使用VIC熒光基團修飾，3’端使用MGB修飾。