[發明專利]咽頰炎鏈球菌的特異基因序列、其檢測引物及其應用

在審

• 申請號: 201811002448.1
• 申請日: 2018-08-30
• 公開（公告）號: CN110872632A
• 公開（公告）日: 2020-03-10
• 發明（設計）人: 李南南;揭著業;易吉;吳逵;朱師達;賈慧玨;仝欣;羅慧娟;陳小芳
• 申請（專利權）人: 深圳華大生命科學研究院
• 主分類號: C12Q1/689
• 分類號: C12Q1/689;C12Q1/04;C12Q1/6851;C12N15/11;C12R1/46
• 代理公司: 深圳鼎合誠知識產權代理有限公司 44281
• 代理人: 孫銀行;彭家恩

一種咽頰炎鏈球菌的特異基因序列、其檢測引物及其應用。本發明的特異基因序列選自SEQ ID NO：1?7中任一條序列。引物包括SEQ ID NO：10和SEQ ID NO：11所示的序列。本發明證實了咽頰炎鏈球菌與結直腸癌的相關性，因此通過檢測腸道中咽頰炎鏈球菌的特定基因，能夠實現對結直腸癌的發生與發展的早期檢測和及時干預治療。

技術領域

本發明涉及腸道微生物檢測技術領域，具體涉及一種咽頰炎鏈球菌的特異基因序列、其檢測引物及其應用。

背景技術

據統計，結直腸癌(colorectal cancer，CRC)在各類癌癥中發病率排名第三，致死率排名第四，近55％的發病案例發生在較發達國家。在年齡小于40歲的人中發生率較低，但隨著年齡增加發生率亦逐漸增高。通常認為飲食習慣的西方化會增加CRC發病率，但目前美國及其他高收入國家發病率卻保持穩定甚至下降，推測與乙狀結腸鏡檢查及結腸鏡下的息肉切除術的增加有關。結直腸癌也是目前最可預防的腫瘤之一，醫學界認為如果及早發現，腸癌是最易治愈的癌癥。

傳統的結直腸癌篩選方法主要是結腸鏡檢查，另外還有活體組織檢查和脫落細胞學檢查，這幾種檢查方法都是侵入式的，尤其是脫落細胞學檢查取材繁瑣，不易獲得滿意的標本，臨床應用少。所以如果沒有相關癥狀，很多人并不愿意去做結直腸癌的早期篩查。

發明內容

本發明提供一種咽頰炎鏈球菌的特異基因序列、其檢測引物及其應用，本發明的引物能夠用于結直腸癌的檢測。

根據第一方面，一種實施例中提供一種咽頰炎鏈球菌(Streptococcusanginosus)的分離的特異基因序列，該特異基因序列選自SEQ ID NO：1-7中任一條序列。

優選地，上述特異基因序列是SEQ ID NO：1所示的序列。

根據第二方面，一種實施例中提供一種咽頰炎鏈球菌的分離的特異基因序列，該特異基因序列是以SEQ ID NO：10和SEQ ID NO：11所示的序列作為引物對對含有咽頰炎鏈球菌的人腸道菌群或人腸道菌群核酸提取物進行PCR擴增得到的產物。

根據第三方面，一種實施例中提供第一方面或第二方面的特異基因序列作為結直腸癌腫瘤標志物在制備檢測結直腸癌的試劑或試劑盒中的用途，所述試劑或試劑盒中包含檢測所述特異基因序列的引物對；

優選地，所述引物對是SEQ ID NO：10和SEQ ID NO：11所示的序列。

根據第四方面，一種實施例中提供一種檢測結直腸癌的引物對，該引物對包括SEQID NO：10和SEQ ID NO：11所示的序列。

根據第五方面，一種實施例中提供一種檢測結直腸癌的試劑盒，該試劑盒包括序列為SEQ ID NO：10和SEQ ID NO：11所示的引物對；任選的，還包括DNA聚合酶和/或可用于定量PCR的熒光染料。

根據第六方面，一種實施例中提供一種序列為SEQ ID NO：10和SEQ ID NO：11所示的引物對在制備檢測結直腸癌的試劑盒中的用途。

根據第七方面，一種實施例中提供一種檢測人腸道中咽頰炎鏈球菌的方法，包括采用SEQ ID NO：10和SEQ ID NO：11所示的序列的引物對對人腸道菌群或人腸道菌群核酸提取物進行PCR擴增，進而分析上述咽頰炎鏈球菌的特異基因序列在樣本中的存在情況。

優選地，上述PCR擴增是定量PCR擴增。

優選地，上述定量PCR擴增確定上述特異基因序列在樣本中的量，并根據臨界值判斷上述咽頰炎鏈球菌在人腸道中的存在量。

根據第八方面，一種實施例中提供一種序列為SEQ ID NO：10和SEQ ID NO：11所示的引物對在檢測人腸道中咽頰炎鏈球菌中的用途。