[發(fā)明專(zhuān)利]檢測(cè)圖像上的亮斑的方法和裝置、圖像配準(zhǔn)方法和裝置

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201810961202.0
• 申請(qǐng)日: 2018-08-22
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN112285070B
• 公開(kāi)（公告）日: 2022-11-11
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 李林森;徐偉彬;金歡;姜澤飛;周志良;顏欽
• 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人: 深圳市真邁生物科技有限公司
• 主分類(lèi)號(hào): G01N21/64
• 分類(lèi)號(hào): G01N21/64
• 代理公司: 暫無(wú)信息
• 代理人: 暫無(wú)信息

1.一種對(duì)圖像上的亮斑進(jìn)行檢測(cè)的方法，其特征在于，所述圖像采集自發(fā)生堿基延伸反應(yīng)的一個(gè)視野，發(fā)生堿基延伸反應(yīng)的該視野上存在多個(gè)帶有光學(xué)可檢測(cè)標(biāo)記的核酸分子，至少一部分所述核酸分子在所述圖像上表現(xiàn)為亮斑，所述方法包括：

利用k1*k2矩陣對(duì)所述圖像上的亮斑進(jìn)行檢測(cè)，判定所述矩陣的中心像素值不小于第一預(yù)設(shè)值、所述矩陣非中心任一像素值不小于第二預(yù)設(shè)值并且所述矩陣的中心像素值不小于所述矩陣非中心任一像素值的矩陣對(duì)應(yīng)一個(gè)候選亮斑，k1和k2均為大于1的奇數(shù)，k1*k2矩陣包含k1*k2個(gè)像素點(diǎn)，所述第一預(yù)設(shè)值和/或所述第二預(yù)設(shè)值與所述圖像的平均像素值相關(guān)；以及

確定所述候選亮斑是否為所述亮斑；

確定所述候選亮斑是否為所述亮斑包括：

計(jì)算一個(gè)所述候選亮斑對(duì)應(yīng)的連通域的大小Area=A*B，判定對(duì)應(yīng)的連通域的大小大于第三預(yù)設(shè)值的候選亮斑為一個(gè)所述亮斑，A表示以所述候選亮斑對(duì)應(yīng)的矩陣的中心的所在行的連通大小，B表示以所述候選亮斑對(duì)應(yīng)的矩陣的中心的所在列的連通大小，定義一個(gè)k1*k2矩陣中大于平均像素值的相連像素為一個(gè)所述候選亮斑對(duì)應(yīng)的連通域，和/或

計(jì)算一個(gè)所述候選亮斑的分值Score=((k1*k2-1)CV-EV)/((CV + EV)/(k1*k2))，判定分值大于第四預(yù)設(shè)值的所述候選亮斑為一個(gè)所述亮斑，CV表示所述候選亮斑對(duì)應(yīng)的矩陣的中心像素值，EV表示所述亮斑對(duì)應(yīng)的所述矩陣的非中心像素值的總和。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其特征在于，所述圖像為二值化圖像，判定對(duì)應(yīng)的相連像素的大小不小于第五預(yù)設(shè)值的所述候選亮斑為一個(gè)所述亮斑。

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法，其特征在于，所述圖像為預(yù)處理后的圖像，所述預(yù)處理包括去背景和/或墨西哥帽變換。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的方法，其特征在于，基于所述圖像的至少一部分區(qū)域的灰度均值進(jìn)行所述去背景。

5.根據(jù)權(quán)利要求1-4任一項(xiàng)所述的方法，其特征在于，還包括：

若判定所述候選亮斑為所述亮斑，計(jì)算所述亮斑的亞像素中心坐標(biāo)和/或所述亞像素中心坐標(biāo)的強(qiáng)度值，

若判定所述候選亮斑非為所述亮斑，丟棄所述候選亮斑。

6.一種圖像配準(zhǔn)方法，其特征在于，包括利用圖像上的亮斑實(shí)現(xiàn)所述配準(zhǔn)，所述圖像上的亮斑為利用權(quán)利要求1-5任一項(xiàng)所述的方法檢測(cè)獲得。

7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的方法，其特征在于，所述方法包括：

基于參考圖像對(duì)待配準(zhǔn)圖像進(jìn)行第一配準(zhǔn)，所述參考圖像和所述待配準(zhǔn)圖像對(duì)應(yīng)相同視野，包括，

確定所述待配準(zhǔn)圖像上的預(yù)定區(qū)域和所述參考圖像上的相應(yīng)預(yù)定區(qū)域的第一偏移量，基于所述第一偏移量移動(dòng)所述待配準(zhǔn)圖像上的所有亮斑，獲得第一配準(zhǔn)后的待配準(zhǔn)圖像；

基于所述參考圖像對(duì)第一配準(zhǔn)后的待配準(zhǔn)圖像進(jìn)行第二配準(zhǔn)，包括，

合并所述第一配準(zhǔn)后的待配準(zhǔn)圖像和所述參考圖像，獲得合并圖像，

計(jì)算所述合并圖像上的預(yù)定區(qū)域的所有重合亮斑的偏移量，以確定第二偏移量，距離小于預(yù)定像素的兩個(gè)或多個(gè)亮斑為一個(gè)所述重合亮斑，

基于該第二偏移量移動(dòng)所述第一配準(zhǔn)后的待配準(zhǔn)圖像上的所有亮斑，以實(shí)現(xiàn)對(duì)所述待配準(zhǔn)圖像的配準(zhǔn)。

8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的方法，其特征在于，所述參考圖像通過(guò)構(gòu)建獲得，構(gòu)建所述參考圖像包括：

獲取第一圖像和第二圖像，所述第一圖像和所述第二圖像與所述待配準(zhǔn)圖像對(duì)應(yīng)相同視野；

基于第一圖像對(duì)第二圖像進(jìn)行粗配準(zhǔn)，包括確定所述第二圖像和所述第一圖像的偏移量，基于該偏移量移動(dòng)所述第二圖像，獲得粗配準(zhǔn)后的第二圖像；

合并所述第一圖像和粗配準(zhǔn)后的第二圖像，以獲得所述參考圖像。

9.根據(jù)權(quán)利要求7所述的方法，其特征在于，所述參考圖像和所述待配準(zhǔn)圖像為二值化圖像。