[發(fā)明專利]一種卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)區(qū)分肝癌分化等級的方法在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201810946331.2 | 申請日: | 2018-08-20 |
| 公開(公告)號: | CN109214433A | 公開(公告)日: | 2019-01-15 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 林宏心;韋超;王光興;卓雙木 | 申請(專利權(quán))人: | 福建師范大學 |
| 主分類號: | G06K9/62 | 分類號: | G06K9/62;G06N3/04 |
| 代理公司: | 福州元創(chuàng)專利商標代理有限公司 35100 | 代理人: | 蔡學俊 |
| 地址: | 350117 福建省福州市閩侯縣*** | 國省代碼: | 福建;35 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò) 肝癌 分化 圖像 采集 圖像數(shù)據(jù)集 訓(xùn)練集圖像 垂直對稱 提取圖像 像素調(diào)整 原始像素 連接層 主觀性 光子 顯微鏡 卷積 剪裁 耗時 輸出 概率 | ||
本發(fā)明涉及一種卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)區(qū)分肝癌分化等級的方法。該方法包括步驟:步驟S1、準備數(shù)據(jù):通過多光子顯微鏡采集肝癌的MPM圖像;步驟S2、擴大肝癌MPM圖像數(shù)據(jù)集:通過對步驟S1采集的原始像素大小為512×512的圖像進行像素調(diào)整,水平對此旋轉(zhuǎn)、垂直對稱旋轉(zhuǎn)、剪裁等手段,得到訓(xùn)練集圖像數(shù)量擴大為原來的16倍;步驟S3、設(shè)計卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),得到分化等級的區(qū)分結(jié)果:設(shè)計卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的結(jié)構(gòu);卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)一共8層:第1層到第5層整體稱為卷積層,用于提取圖像中的詳細特征;第6層到第8層為3個全連接層,第8層后輸出肝癌圖像分化等級的概率。本發(fā)明能夠有效克服目前臨床活檢技術(shù)中耗時、漏診、主觀性強的缺點。
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明屬于醫(yī)學圖像處理領(lǐng)域,特別涉及一種卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)區(qū)分肝癌分化等級的方法。
背景技術(shù)
肝癌是最常見的致命惡性腫瘤,僅在中國,2015年就有466100例新增病例喝422100例死亡病例。低分化的肝癌具有較強的侵襲性和較差的預(yù)后,從而導(dǎo)致了較低的5年生存率。不同腫瘤分化等級的肝癌患者對應(yīng)不同的預(yù)后和治療策略,具有截然不同的結(jié)果。因此,肝癌分化等級的區(qū)分具有巨大的臨床價值。目前,常用的方法,如組織病理學檢查和B超,很容易受到檢查人員經(jīng)驗和辨別力的影響。開發(fā)一種新方法來實現(xiàn)無標記、快速、量化和自動的區(qū)分肝癌的分化等級是很有必要的。
近年來,多光子顯微鏡(MPM)已經(jīng)成為一種有前景的快速、無標記、高分辨率的顯微成像技術(shù),非常適合用于檢查未加工過的組織樣本。MPM也將成為癌癥檢測和研究中不可替代的成像技術(shù)。該技術(shù)使用較長波長的近紅外激光對生物組織中的深層物質(zhì)進行成像,由于精確定位和較小的光損傷,組織樣本可以被長時間地觀察。作為非線性光學效應(yīng)的兩種主要形式,在不需要任何外源性染料的情況下,二次諧波發(fā)生(SHG)可成像膠原蛋白,雙光子激發(fā)熒光(TPEF)可揭示肝細胞的形態(tài)。SHG和TPEF的結(jié)合使用可精確測定與肝疾病相關(guān)的膠原蛋白的形態(tài)和結(jié)構(gòu)。
機器學習技術(shù)目前非常適合分析醫(yī)學數(shù)據(jù)。基于醫(yī)學圖像的機器學習可以顯著地提高肝疾病的檢測準確率。深度學習是一種由多計算層組成的機器學習,它使算法能夠基于實例學習而不是手工設(shè)計來執(zhí)行相應(yīng)的預(yù)測功能。近年來,一種特殊的深度學習技術(shù)—卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(CNN),已經(jīng)成為醫(yī)學圖像中診斷疾病的高度精確算法,所獲得的精確度和準確性可與專家媲美。例如,基于多組學特征,深度學習被用來區(qū)分肝癌患者的生存亞群。此外,Li等人還發(fā)現(xiàn),多個全連接卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和極限學習體系結(jié)構(gòu)的結(jié)合,可以準確地預(yù)測肝癌核分級。最近,深度學習已經(jīng)進一步應(yīng)用于MPM圖像,如血管分割,卵巢癌診斷。然而還未有深度,學習應(yīng)用在肝癌MPM圖像方面的研究報道。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的目的在于提供一種卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)區(qū)分肝癌分化等級的方法,能夠有效克服目前臨床活檢技術(shù)中耗時、漏診、主觀性強的缺點。
為實現(xiàn)上述目的,本發(fā)明的技術(shù)方案是:一種卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)區(qū)分肝癌分化等級的方法,包括如下步驟:
步驟S1、準備數(shù)據(jù):通過多光子顯微鏡采集肝癌的MPM圖像,單張圖像大小為425.10×425.10 μm2,像素為512×512;
步驟S2、擴大肝癌MPM圖像數(shù)據(jù)集:將步驟S1采集的原始像素大小為512×512的圖像調(diào)整為像素大小為2000×2000的原圖像,并對原圖像進行水平對稱旋轉(zhuǎn),得到一組新圖像;再對新圖像和原圖像進行垂直對稱旋轉(zhuǎn),使得訓(xùn)練集的圖像數(shù)量擴大為原來的4倍;將擴大的訓(xùn)練集中每張圖像平均剪裁成4部分,構(gòu)成新的訓(xùn)練集,至此訓(xùn)練集圖像數(shù)量擴大為原來的16倍,即有原圖像數(shù)×16張像素大小為1000×1000的數(shù)據(jù)集;
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