[發(fā)明專利]堿基識別方法及裝置、生成彩色圖像的方法及系統(tǒng)

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201810939942.4
• 申請日: 2018-08-17
• 公開（公告）號: CN109117796B
• 公開（公告）日: 2021-01-08
• 發(fā)明（設計）人: J奧維利.亞當斯;張必良;李俞鋒;鄔捷豪
• 申請（專利權）人: 廣州市銳博生物科技有限公司
• 主分類號: G06K9/00
• 分類號: G06K9/00;G06K9/20
• 代理公司: 廣州華進聯(lián)合專利商標代理有限公司 44224
• 代理人: 黃曉慶

一種堿基識別方法及裝置、生成彩色圖像的方法及系統(tǒng)、計算機設備和計算機存儲介質(zhì)，一個實施例中的方法包括：獲取彩色堿基圖像，所述彩色堿基圖像通過采集攜帶熒光標記的堿基發(fā)射出的光學信號，并對采集的光學信號進行彩色成像獲得；對所述彩色堿基圖像進行堿基識別，獲得堿基識別結果。本實施例方案無需復雜的光學硬件系統(tǒng)，就可以實現(xiàn)對堿基的識別，簡化了識別方案且該提高了效率。

技術領域

本申請涉及分子生物學、光學以及計算科學技術領域，尤其涉及核酸檢測技術領域，特別是涉及一種堿基識別方法、一種堿基識別裝置、一種生成彩色圖像的方法、一種生成彩色圖像的系統(tǒng)、一種計算機設備和一種計算機存儲介質(zhì)。

背景技術

堿基識別是高通量基因測序的核心環(huán)節(jié)，它主要是指從含有堿基信息的熒光點圖中獲得基因序列信息。現(xiàn)有技術普遍采用多個單色相機配合其特定的分光棱鏡采集熒光信號，主要通過判定單色圖像中不同熒光點的強度來識別堿基。然而目前的堿基識別方式復雜且效率較低。

發(fā)明內(nèi)容

基于此，有必要針對上述技術問題，提供一種堿基識別方法及裝置、生成彩色圖像的方法及系統(tǒng)、計算機設備和計算機存儲介質(zhì)。

一種堿基識別方法，所述方法包括：

獲取彩色堿基圖像，所述彩色堿基圖像通過采集攜帶熒光標記的堿基發(fā)射出的光學信號，并對采集的光學信號進行彩色成像獲得；

對所述彩色堿基圖像進行堿基識別，獲得堿基識別結果。

一個實施例中，對彩色堿基圖像進行堿基識別，獲得堿基識別結果，包括：確定所述彩色堿基圖像的各光點的第一光點顏色信息；基于各光點的第一光點顏色信息，確定各堿基類別對應的第一參考顏色信息；基于各光點的第一光點顏色信息和各堿基類別對應的第一參考顏色信息，確定第一堿基識別結果，所述第一堿基識別結果包括所述彩色堿基圖像中的光點所屬的堿基類別。

一個實施例中，確定所述彩色堿基圖像的各光點的第一光點顏色信息，包括：確定所述彩色堿基圖像的各光點的光點位置信息，所述光點位置信息包括光點中心像素；基于各光點的光點中心像素，以及該光點中心像素的鄰域像素，確定各光點的第一光點顏色信息。

一個實施例中，確定所述彩色堿基圖像的各光點的光點位置信息，包括：檢測所述彩色堿基圖像中的各光點的圖像邊緣，并確定圖像邊緣的曲率半徑；基于各光點的圖像邊緣，確定各光點的光點中心像素的位置坐標，所述光點位置信息包括所述圖像邊緣的曲率半徑以及所述光點中心像素的位置坐標。

一個實施例中，確定所述彩色堿基圖像的各光點的光點位置信息，還包括：在檢測所述彩色堿基圖像中的各光點的圖像邊緣之前，對所述彩色堿基圖像進行圖像銳化處理。

一個實施例中，確定所述彩色堿基圖像的各光點的光點位置信息之前，還包括步驟：對預定列數(shù)的各小區(qū)的圖像進行圖像拼接，獲得預定列數(shù)全景圖像；

此時，確定所述彩色堿基圖像的各光點的光點位置信息，包括：確定所述預定列數(shù)全景圖像中的各光點的光點位置信息。

一個實施例中的所述預定列數(shù)為一條泳道對應的列數(shù)。

一個實施例中，基于各光點的光點中心像素，以及該光點中心像素的鄰域像素，確定各光點的第一光點顏色信息，包括：任意一個光點的第一光點顏色信息，為該光點的光點中心像素以及該光點中心像素的N鄰域像素的顏色信息的平均值，所述顏色信息包括RGB值和強度值。

一個實施例中，確定所述彩色堿基圖像的各光點的光點位置信息之后，還包括步驟：在識別出的光點中心像素的周圍繪制預定圖形。

一個實施例中，還包括步驟：將確定的各光點的光點位置信息進行存儲。