[發明專利]Morris水迷宮實驗圖像分析系統及方法有效
| 申請號: | 201810939184.6 | 申請日: | 2018-08-17 |
| 公開(公告)號: | CN109272518B | 公開(公告)日: | 2020-05-05 |
| 發明(設計)人: | 劉宏德;羅坤 | 申請(專利權)人: | 東南大學 |
| 主分類號: | G06T7/13 | 分類號: | G06T7/13;G06T7/20;G06T5/00 |
| 代理公司: | 南京蘇高專利商標事務所(普通合伙) 32204 | 代理人: | 馮艷芬 |
| 地址: | 210000 江*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | morris 迷宮 實驗 圖像 分析 系統 方法 | ||
本發明公開了一種Morris水迷宮實驗圖像分析系統及方法,本發明主要實現三個功能:一,計算動物在四個象限中的穿越次數;二,識別動物探查方式;三,計算小鼠穿越熱區圖。主要通過以下步驟完成分析:圖像邊緣檢測、圓形區域識別、目標象限識別、穿越次數計算、探查方式識別、穿越熱區計算和可視化。本發明準確性高,功能齊全。
技術領域
本發明涉及計算機圖像處理,尤其涉及一種Morris水迷宮實驗圖像分析系統及方法。
背景技術
Morris水迷宮實驗強迫實驗動物在游泳池游泳,學習尋找隱藏在水中平臺(platform)的一種實驗,主要用于測試實驗動物對空間的學習和記憶能力(NatProtoc.2006;1(2):848–858.),其基本線索是動物游泳的軌跡和時間信息。實驗的基本裝置包括:恒溫游泳池、逃逸平臺(具體為升降臺)、以及圖像采集和分析系統。一般地,實驗流程包括學習和測試兩個階段:在訓練階段,動物連續訓練4~5天,訓練中,將升降臺抬升出水面。將動物放入池中,記錄其找到升降平臺的時間,此為潛伏時間,如果動物在60秒后仍未找到升降臺,則引導動物去升降平臺,停留10秒。在測試階段,即第5或者6天,撤掉升降臺,然后記錄動物在各象限所滯留的時間,觀測總時間為80秒。實驗中,可以獲得潛伏時間、運動軌跡、平臺穿越次數、探查方式等信息。潛伏時間為在訓練中,動物找到平臺的時間;探查軌跡為動物游泳的路徑軌跡;平臺穿越次數為在測試階段,撤去平臺后,在實驗時間內,實驗動物穿越原站臺位置的次數。動物穿越隱藏站臺位置的次數越多,說明其空間學習記憶能力越好。探查方式包括直線式、趨向式、邊緣式和隨機式。根據這些信息,可以推測動物的空間學習記憶能力。動物Morris水迷宮的成績(結果)與神經遞質、藥物效果等有關,因此該實驗被大量用于神經科學的研究,尤其是退行性疾病(阿爾茲海默癥)的研究,已經是研究海馬回路的關鍵技術。
在這些特征中,運動軌跡、平臺穿越次數、探查方式非常重要,探查軌跡與動物的活躍程度、學習記憶能力相關。平臺穿越次數直接反映了動物的學習記憶能力。探查方式則與動物分析判斷能力和解決問題能力。可見,這三個特征是非常關鍵的指標。目前,國內使用的Morris水迷宮數據分析軟件大都是國外開發,價格不菲(約1萬美元);而且功能不全,不能實現同時獲取這三個重要特征指標。
發明內容
發明目的:本發明針對現有技術存在的問題,提供一種Morris水迷宮實驗圖像分析系統及方法,實現對探查軌跡、平臺穿越次數、探查方式的準確計算。
技術方案:本發明所述的Morris水迷宮實驗圖像分析系統包括:
邊緣檢測模塊,用于對多幀Morris水迷宮實驗圖像進行邊緣檢測,從而獲取圖像中的邊緣特征;
游泳池識別模塊,用于從邊緣特征中識別出半徑介于實驗圖像尺寸1/6到1/1.5的圓或橢圓,作為水迷宮游泳池區域;
象限劃分模塊,用于以識別出的水迷宮游泳池圓心為原點建立坐標系,并對坐標系進行旋轉,使得真實水迷宮游泳池和識別出的水迷宮游泳池的坐標系一致,所述坐標系將水迷宮游泳池區域均分為4個象限;
軌跡識別模塊,用于從邊緣檢測模塊中獲取的邊緣特征中識別出像素為1的像素點的位置和數目,將該像素點集合作為動物運動軌跡,并根據動物運動軌跡計算動物穿越各象限的次數;
熱區圖像形成模塊,用于對于多幀Morris水迷宮實驗圖像進行平滑處理,形成熱區圖像;
探查方式識別模塊,用于根據運動軌跡判別動物的探查方式;
保存模塊,用于將分析得到的運動軌跡、穿越各象限次數、熱區圖像和動物探查方式進行保存。
進一步的,所述邊緣檢測模塊進行邊緣檢測前首先判斷Morris水迷宮實驗圖像是否為RGB三色通道圖像,如果是,則獲取特定單色通道的值形成單色圖像,然后對單色圖像采用Canny算子進行邊緣檢測;否則,直接采用Canny算子做邊緣檢測。
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