[發明專利]一種基于人工模擬核酸分子信標的檢測幽門螺桿菌克拉霉素耐藥位點的方法與試劑盒有效
| 申請號: | 201810901562.1 | 申請日: | 2018-08-09 |
| 公開(公告)號: | CN110819725B | 公開(公告)日: | 2022-08-23 |
| 發明(設計)人: | 葛猛;余倩;潘世讓;王宏偉 | 申請(專利權)人: | 北京福安華生物科技有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/689 | 分類號: | C12Q1/689;C12Q1/686;C12Q1/04;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245 | 代理人: | 關暢;陳曉慶 |
| 地址: | 100070 北京市豐臺區總*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 基于 人工 模擬 核酸 分子 標的 檢測 幽門 螺桿 克拉 霉素 耐藥 方法 試劑盒 | ||
1.用于檢測幽門螺桿菌克拉霉素耐藥位點A2143G和/或A2142G和/或A2142C的成套分子信標,其由用于檢測幽門螺桿菌克拉霉素耐藥位點A2143G的分子信標Hp-A2143G-ANABMB、用于檢測幽門螺桿菌克拉霉素耐藥位點A2142G的分子信標Hp-A2142G-ANABMB和用于檢測幽門螺桿菌克拉霉素耐藥位點A2142C的分子信標Hp-A2142C-ANABMB組成;
所述分子信標Hp-A2143G-ANABMB的序列為序列表中序列5,其中,序列5第1位為5-甲基異胞嘧啶脫氧核苷酸殘基,第4位為異鳥嘌呤脫氧核苷酸殘基,第11位和第14位均為鎖核苷酸殘基,第22位為5-甲基異胞嘧啶脫氧核苷酸殘基,第25位為異鳥嘌呤脫氧核苷酸殘基,其余核苷酸殘基均為天然核苷酸殘基;
所述分子信標Hp-A2142G-ANABMB的序列為序列表中序列6,其中,序列6第1位為5-甲基異胞嘧啶脫氧核苷酸殘基,第4位為異鳥嘌呤脫氧核苷酸殘基,第11位和第13位均為鎖核苷酸殘基,第22位為5-甲基異胞嘧啶脫氧核苷酸殘基,第25位為異鳥嘌呤脫氧核苷酸殘基,其余核苷酸殘基均為天然核苷酸殘基;
所述分子信標Hp-A2142C-ANABMB的序列為序列表中序列7,其中,序列7第1位為5-甲基異胞嘧啶脫氧核苷酸殘基,第4位為異鳥嘌呤脫氧核苷酸殘基,第11位和第13位均為鎖核苷酸殘基,第22位為5-甲基異胞嘧啶脫氧核苷酸殘基,第25位為異鳥嘌呤脫氧核苷酸殘基,其余核苷酸殘基均為天然核苷酸殘基。
2.根據權利要求1所述的成套分子信標,其特征在于:所述分子信標Hp-A2143G-ANABMB、所述分子信標Hp-A2142G-ANABMB和所述分子信標Hp-A2142C-ANABMB的兩端均標記有熒光基團和淬滅基團。
3.用于檢測幽門螺桿菌克拉霉素耐藥位點A2143G和/或A2142G和/或A2142C的成套試劑,所述成套試劑由成套試劑1、成套試劑2和成套試劑3組成;
所述成套試劑1由權利要求1或2中所述的分子信標Hp-A2143G-ANABMB和與能從幽門螺桿菌基因組中擴增得到含有所述分子信標Hp-A2143G-ANABMB環狀區識別序列的引物對組成;
所述成套試劑2由權利要求1或2中所述的分子信標Hp-A2142G-ANABMB和與能從幽門螺桿菌基因組中擴增得到含有所述分子信標Hp-A2142G-ANABMB環狀區識別序列的引物對組成;
所述成套試劑3由權利要求1或2中所述的分子信標Hp-A2142C-ANABMB和與能從幽門螺桿菌基因組中擴增得到含有所述分子信標Hp-A2142C-ANABMB環狀區識別序列的引物對組成。
4.根據權利要求3所述的成套試劑,其特征在于:所述引物對由序列表中序列8所示的單鏈DNA和序列表中序列9所示的單鏈DNA組成。
5.用于檢測幽門螺桿菌克拉霉素耐藥位點A2143G和/或A2142G和/或A2142C的試劑盒,含有權利要求1或2所述的成套分子信標或權利要求3或4所述的成套試劑。
6.權利要求1或2所述的成套分子信標或權利要求3或4所述的成套試劑或權利要求5所述的試劑盒在檢測或輔助檢測待測樣本是否含有幽門螺桿菌克拉霉素耐藥位點A2143G和/或A2142G和/或A2142C中的應用;所述應用為非疾病和診斷治療目的。
7.權利要求1或2所述的成套分子信標或權利要求3或4所述的成套試劑或權利要求5所述的試劑盒在檢測或輔助檢測待測樣本是否含有克拉霉素耐藥幽門螺桿菌中的應用;所述應用為非疾病和診斷治療目的。
8.權利要求1或2所述的成套分子信標或權利要求3或4所述的成套試劑或權利要求5所述的試劑盒在制備診斷或輔助診斷待測患者是否感染克拉霉素耐藥幽門螺桿菌的產品中的應用。
9.根據權利要求6-8任一所述的應用,其特征在于:所述克拉霉素耐藥幽門螺桿菌為含有克拉霉素耐藥位點A2143G和/或A2142G和/或A2142C的幽門螺桿菌。
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