[發明專利]一種預測黃牛生長性狀和肉質指標的方法及試劑盒

有效

• 申請號: 201810866518.1
• 申請日: 2018-08-01
• 公開（公告）號: CN108624703B
• 公開（公告）日: 2019-12-13
• 發明（設計）人: 寧凱林;王小清;蔣宇;張華琦;林理麗
• 申請（專利權）人: 貴州梵凈山農業高科技股份有限公司
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888
• 代理公司: 52114 貴陽睿騰知識產權代理有限公司
• 代理人: 谷慶紅

本發明提供了一種預測黃牛生長性狀和肉質指標的方法，其特征在于檢測CMYA5所包含的SNP位點。其中所述生長性狀為毛重、凈肉率，所述肉質指標是指肌間脂肪含量，所述SNP是2779T>A、3066A>C和/或7706A>C的組合。本發明還提供了用于預測黃牛生長性狀和肉質指標的試劑盒，其包含檢測前述幾個SNP或其組合的試劑。本發明檢測得到的SNP還可作為育種標記，用于黃牛育種方法。

技術領域

本發明屬于基因工程技術領域，具體涉及一種通過檢測基因單核苷酸多態性的牛肉質和生長特性的檢測方法、試劑盒及其應用。

背景技術

隨著生活水平的不斷提高，人們對肉質品質的要求也越來越高。牛肉具有高蛋白、低脂肪、低膽固醇等特點，營養豐富，一直是世界肉業發達國家肉類消費的首選，我國的牛肉消費量也在逐年上升。度量肉質品質的指標主要包括pH值、系水力、肌內脂肪含量、嫩度、肉色、肌纖維直徑、熟肉率、貯存損失等。適當提高肌間脂肪含量能改善肉質嫩度和多汁性，從而提高肉的品質。

目前，貴州省尚未有專門化的肉牛品種。本地牛品種長期以來是作為役用家畜存在，主要用于耕地、拉車等，普遍具有體格小、生長速度慢、產肉性能低等缺點，因此，需系統地實施科學的群體選育技術，使肉牛群得到整體的遺傳改良，彌補本地牛之不足。近年來，利用外地牛雜交改良本地牛雜交的技術方興未艾，像利用西門塔爾、夏洛來、安格斯、利木贊、皮埃蒙特、海福特、和牛等雜交改良所產后代，大都具有良好的生長趨勢和產肉性能，但母牛繁殖率較低，難產現象頻出，同時，牛犢死淘率高，并且雜交牛育肥期飼料管理成本高。其中，我國多地區常選用西門塔爾牛與本地牛進行雜交，常因母牛個體小，骨盆狹窄和骨盆不稱，妨礙雜交牛胎兒通過產道，或雜交牛胎兒過大，以致分娩時間過長，造成雜交牛胎兒不能正常產出。如今，和牛與本地牛進行雜交深受養殖研究者青睞，其中，和牛不僅具有西門塔爾、夏洛來、安格斯、利木贊、皮埃蒙特、海福特等外來牛生長速度快、產肉量高的特點，還改善了這些外來牛脂肪沉積能力差的缺點，進而改善了雜交牛的肉質，但是與和牛雜交的母牛受精率低，所產雜交牛的體格較小，并且后代飼養成本高。如今，外來品種雜交牛雖然改善了生長狀況和產肉率，但其由于適應性差，進而導致成活率低，發病率高，同時，雜交牛耐粗料能力差，進而增加了養殖戶的經濟成本，并且，雜交牛的選育處于薄弱發展階段，由于選育標準不合理，進而使得雜交牛經過幾代乃至幾十代的雜交后，群體仍然雜亂，無鮮明特點，所以，雜交牛的發展并不理想。

單核苷酸多態性(SNP)是指基因組DNA序列中由于單個核苷酸(A/T/C/G)的替換而引起的多態性，包括堿基的插入、缺失以及重復序列拷貝數的變化。根據它們在基因組中分布的位置可分為基因編碼區SNPs(cSNPs)、基因周邊SNPs(pSNPs)和基因間SNPs(iSNPs)等三類。對于發生在基因編碼區的SNPs可以分為同義突變和非同義突變，特別是后者引起的序列改變能使所編碼的氨基酸產生變化，進而可能影響合成的蛋白質結構和功能，最終影響個體表型變化。這些SNPs不僅對個體表現型具有重要意義，而且在群體遺傳和生物進化研究中也可以作為重要的遺傳標記。

CMYA家族基因與動物的肌肉組織的組成具有密切的關系。CMYA是原發性心肌癥相關蛋白(cardiomyopathy associated protein,CMYA)，目前關于CMYA家族基因的研究主要集中于對該基因與肌蛋白的相互作用。近年來，對CMYA5基因的研究主要集中在雞、小鼠和人上。對于人CMYA5基因的功能，研究發現，CMYA5是歐美國家精神分裂癥新易感基因，在中國人群中也是一個精神分裂癥易感基因。朱吉等【湖南黑豬CMYA5基因與肌肉品質的相關性分析，湖南農業大學學報(自然科學版)，第38卷第1期，2012年2月】的研究則發現，湖南黑豬CMYA5基因多態性與肌肉品質性狀相關，該基因可作為豬肉質性狀候選基因。然而，對于牛CMYA5基因的功能則研究甚少。

發明內容

本發明的目的在于篩選與黃牛生長性狀和肉質相關的單核苷酸多態性，用于預測黃牛生長性狀和肉質。本發明解決其技術問題是采取以下技術方案實現的：