[發(fā)明專利]黃麻中耐鹽性狀的分子標記及其應用

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• 申請?zhí)枺?/td>: 201810859542.2
• 申請日: 2018-08-01
• 公開（公告）號: CN108913803A
• 公開（公告）日: 2018-11-30
• 發(fā)明（設計）人: 楊澤茂;粟建光;戴志剛;劉嬋;唐蜻;程超華;許英;陳基權;謝冬微
• 申請（專利權）人: 中國農業(yè)科學院麻類研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 北京超凡志成知識產權代理事務所(普通合伙) 11371
• 代理人: 劉丹丹

本發(fā)明涉及植物育種技術領域，具體而言，涉及一種黃麻中耐鹽性狀的分子標記及其應用。其中所述分子標記為mk5633SNP位點，標記所在Scaffold編號為AWUE01017764.1，在Scaffold上的位置為367位，參考序列的堿基為G，變異的堿基為A。本發(fā)明提供的mk5633SNP位點能夠應用于黃麻耐鹽品種的培育中，還可以用于種群遺傳結構和遺傳變異水平等方面的研究。

技術領域

本發(fā)明涉及植物育種技術領域，具體而言，涉及一種黃麻中耐鹽性狀 的分子標記及其應用。

背景技術

土壤鹽漬化已經(jīng)演變?yōu)橐粋€全球性問題，是導致土地荒漠化和耕地退 化的重要因素之一，也已成為人類面臨的重大危機。土壤鹽漬化問題嚴重 影響了植物的生長和發(fā)育，已經(jīng)成為自然界主要的非生物脅迫之一。目 前，全球鹽堿地面積已達9.5億hm²。土壤鹽漬化已成為制約糧食生產和影 響糧食安全的重要因素。然而人口的快速增長與糧食短缺的矛盾日益加 重，通過篩選和培育耐鹽作物新品種的方法來改良、利用鹽堿地，被認為 是一種具有經(jīng)濟和生態(tài)雙重效益的解決方案。

黃麻為椴樹科(Tiliaceae)，黃麻屬(Corchorus)植物，一年生草本韌皮纖 維作物，目前世界上主栽的黃麻主要有兩種，即圓果種黃麻(Corchorus. capsularis，南亞的印度、孟加拉、尼泊爾等國稱為white jute)和長果種黃 麻(Corchorus.olitorius，南亞稱為tossa jute)。

黃麻是世界上最重要的韌皮纖維作物之一，其纖維吸濕性好，散水 快，具有抗菌抑菌、可降解和環(huán)境友好等特性，在商業(yè)上擁有“金色纖維” 的美稱，是麻紡工業(yè)的重要原料，在世界上黃麻產量與種植面積僅次于棉 花。黃麻又是一種重要的耐鹽經(jīng)濟作物，它能夠在沿海灘涂、鹽堿土地大 面積種植。

目前，黃麻耐鹽性研究進展緩慢，人們對黃麻耐鹽性方面的認識還處 于初始階段，有關黃麻耐鹽性分子機制的報道較少，前人對黃麻耐鹽性的 報道也相對較少。總體來說黃麻分子生物學基礎比較薄弱。分析黃麻在鹽 脅迫下的基因表達變化，尋找黃麻鹽脅迫響應基因，并對其進行功能預測 及代謝通路分析，加深對黃麻耐鹽機理研究，這將有利于培育黃麻優(yōu)良耐 鹽品種，對其他植物耐鹽性的研究也具有重要意義。

有鑒于此，特提出本發(fā)明。

發(fā)明內容

本發(fā)明涉及一種新穎的與黃麻耐鹽性狀有關的SNP位點，并對該SNP 位點的檢測、應用等方面進行研究。

該SNP位點存在于黃麻基因組中，與影響黃麻耐鹽性狀的QTL qJST-1 連鎖，因而能夠用于黃麻耐鹽性狀的相關研究。

采用該SNP位點能夠用于耐鹽抗性的黃麻植物的培育和鑒定。

與現(xiàn)有技術相比，本發(fā)明的有益效果為：

本發(fā)明提供的mk5633SNP位點能夠應用于黃麻耐鹽品種的培育中，還 可以用于種群遺傳結構和遺傳變異水平等方面的研究。

附圖說明

為了更清楚地說明本發(fā)明具體實施方式或現(xiàn)有技術中的技術方案，下 面將對具體實施方式或現(xiàn)有技術描述中所需要使用的附圖作簡單地介紹， 顯而易見地，下面描述中的附圖是本發(fā)明的一些實施方式，對于本領域普 通技術人員來講，在不付出創(chuàng)造性勞動的前提下，還可以根據(jù)這些附圖獲 得其他的附圖。

圖1為本發(fā)明實施例中所采用的GBS技術路線示意圖；

圖2為本發(fā)明實施例中遺傳圖譜信息分析內容的流程示意圖；

圖3為本發(fā)明實施例中GBS文庫構建流程示意圖；