[發明專利]鴨坦布蘇病毒的qPCR檢測方法在審
| 申請號: | 201810851970.0 | 申請日: | 2018-07-30 |
| 公開(公告)號: | CN108950071A | 公開(公告)日: | 2018-12-07 |
| 發明(設計)人: | 陳國強;時長軍;李永旺;王凱民;張嶸;陳雷;朱婷;陸春華 | 申請(專利權)人: | 中華人民共和國蘇州出入境檢驗檢疫局;蘇州西山生物技術有限公司;江蘇出入境檢驗檢疫局動植物與食品檢測中心 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12R1/93 |
| 代理公司: | 蘇州創元專利商標事務所有限公司 32103 | 代理人: | 馬明渡;楊超 |
| 地址: | 215021 江蘇*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 病毒 待測樣品 重組質粒 標準品 檢測 熔解曲線分析 上游引物序列 下游引物序列 病毒分離株 標準曲線 基因設計 擴增反應 一對引物 熒光信號 靶序列 活疫苗 靈敏性 核酸 引物 采集 | ||
1.一種鴨坦布蘇病毒的引物對,其特征在于:其中一條引物DTMUV-F為針對鴨坦布蘇病毒的E蛋白基因設計的上游引物,該上游引物的序列為5’-GGCAATGGCTGTGGCTTGTT-3’;另一條引物DTMUV-R為針對鴨坦布蘇病毒的E蛋白基因設計的下游引物,該下游引物的序列為5’-TTGTGGTAGGTGCTCGCTTCC-3’ 。
2.一種鴨坦布蘇病毒的qPCR檢測方法,其特征在于:該檢測方法包括以下步驟:
第一步,引物和標準品重組質粒的合成:針對鴨坦布蘇病毒的E蛋白基因設計了權利要求1所述的一對引物,所述引物在DTMUV BYD-1株的靶序列被人工連接到pUC57載體上,形成標準品重組質粒;
第二步,分別以所述標準品重組質粒和待測樣品中的核酸為模板,進行qPCR擴增反應,其中,所述標準品重組質粒的梯度濃度為2.0×108~2.0×10-1 copies/μL,每個濃度梯度重復3次,qPCR擴增反應的20 μL反應體系為:
2×SYBR? Premix Ex Taq?(TliRNaseH Plus) 10 μL;
50×ROX 0.4 μL;
引物DTMUV-F 20 μM,0.2 μL;
引物DTMUV-R 20 μM,0.2 μL;
去離子水 4.2 μL;
核酸模板 5 μL;
qPCR擴增反應后,采集熒光信號,得到qPCR產物的Ct值并進行熔解曲線分析,當Ct值≤36且Tm值在82.9~83.3之間時,代表生物樣品中含有鴨坦布蘇病毒,為陽性;當Ct值大于36,或者Tm值小于82.9或大于83.3時,代表生物樣品中不含有鴨坦布蘇病毒,為陰性;
第三步,通過所述標準品重組質粒的Ct值和各個梯度濃度建立標準曲線,最后,根據標準曲線和待測樣品的Ct值得到待測樣品的含量。
3. 根據權利要求2所述的鴨坦布蘇病毒的qPCR檢測方法,其特征在于:在所述第二步中,qPCR擴增反應條件為:95℃預變性30 s,之后擴增40個循環,每個循環95℃變性5 s,60℃退火延伸31 s,采集信號;循環結束后65℃~95℃以0.1℃遞增,每個溫度處理5 s,讀值并繪制熔解曲線。
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