[發明專利]一種紅鰭鲌DNA條形碼序列及其應用在審
| 申請號: | 201810829904.3 | 申請日: | 2018-07-25 |
| 公開(公告)號: | CN109055405A | 公開(公告)日: | 2018-12-21 |
| 發明(設計)人: | 劉紅艷;熊飛 | 申請(專利權)人: | 江漢大學 |
| 主分類號: | C12N15/53 | 分類號: | C12N15/53;C12Q1/6888 |
| 代理公司: | 北京華沛德權律師事務所 11302 | 代理人: | 房德權 |
| 地址: | 430056 湖北省武*** | 國省代碼: | 湖北;42 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 紅鰭 細胞色素c氧化酶亞基I 標準檢測序列 物種鑒定 應用 物種 基因 | ||
本發明公開了一種紅鰭鲌DNA條形碼序列及其應用,屬于物種鑒定技術領域。所述紅鰭鲌DNA條形碼序列為SEQ ID NO:1。所述紅鰭鲌DNA條形碼序列為紅鰭鲌COI(cytochrome c oxidase subunit I,細胞色素c氧化酶亞基I)基因。該DNA條形碼序列可以作為紅鰭鲌DNA的標準檢測序列,有效的對紅鰭鲌物種進行鑒定。
技術領域
本發明屬于物種鑒定技術領域,具體涉及一種紅鰭鲌DNA條形碼序列 及其應用。
背景技術
紅鰭鲌(Culter erythropterus),隸屬鯉科(Cyprinidae)鲌亞科 (Culterinae)鲌屬(Culter),廣泛分布于我國的江河湖泊中,紅鰭鲌 喜棲息于湖泊水草茂盛處或江河緩流區,幼魚喜集群在淺水區,屬于肉食 性的雜食魚類,肉質潔白細嫩,味道鮮美,深受消費者喜愛。鲌亞科魚類 往往由于形態學特征的相似,不同種屬的魚類常常會產生混淆,難以區分, 因此,有必要對物種進行有效的鑒定。
DNA條形碼是指生物體內能夠代表該物種的、有足夠變異的、標準的、 易擴增并且相對較短的DNA片段,可以快速、準確的進行物種鑒定。線 粒體DNA的COI基因具有長度適中、進化速率適中和富含系統進行發育信 息等特點。在研究中,能夠較好地對物種的COI基因片段進行有效擴增。 因此,在動物物種分類和鑒定中,COI基因作為條形碼應用有很大的潛力。
物種鑒定一直是分類學乃至幾乎所有生物領域上的研究至關重要的 基礎步驟。因此,準確的對物種鑒定和分類就顯得尤其重要。目前,各國 研究者已經開展了從湖泊到海洋不同地理區域的魚類DNA條形碼研究計 劃,研究表明DNA條形碼在物種鑒定方面具有高效可行性。大量的研究結 果顯示以COI基因為標記的DNA條形碼能夠準確的對各類動物進行物種鑒 定,可以選用COI基因作為各種動物條形碼數據庫的標準條形碼。
在實際操作中,往往會遇到標本量較少以及樣本保存不完整等問題, 這樣給傳統的物種分類和鑒定研究帶來了很大的困難。在現有的技術中 心,均沒有紅鰭鲌DNA條形碼序列以及紅鰭鲌COI基因作為紅鰭鲌DNA條 形碼標準檢測序列的記載和報道。
采用DNA條形碼結合傳統的分類學方法,對物種高效準確的鑒定和分 類起著重要的作用。
發明內容
本發明目的是提供一種可以作為紅鰭鲌DNA的標準檢測序列,能夠有 效的對紅鰭鲌物種進行鑒定。
本發明所采用的技術方案是:
一種紅鰭鲌DNA條形碼序列,所述序列為SEQ ID NO:1。
優選地,所述紅鰭鲌DNA條形碼序列為紅鰭鲌COI(cytochrome c oxidasesubunit I,細胞色素c氧化酶亞基I)基因。
一種紅鰭鲌DNA條形碼標準檢測序列的應用,該DNA條形碼序列可以 作為紅鰭鲌DNA的標準檢測序列,有效的對紅鰭鲌物種進行鑒定。
本發明具有以下優點:
本發明所得到的紅鰭鲌DNA條形碼序列可以作為紅鰭鲌DNA的標準檢 測序列,對紅鰭鲌物種高效和準確的進行鑒定和分類。在實際工作中,有 時要進行魚卵和魚苗的物種鑒定,魚卵很難通過傳統的形態學方法進行鑒 定,另外處于生長發育期的魚苗形態特征也還不是很顯著,無法通過傳統 的形態學進行鑒定的時候,這時借助于物種的DNA標準條形碼,就很容易 對該物種的魚卵和魚苗進行鑒定。有時在物種鑒定的時候,會遇到樣本不 完整或殘缺不全,也給傳統的物種分類和鑒定帶來困難,這時借助于物種 的DNA標準條形碼,可以很快的進行準確的鑒定。有時同一屬內甚至亞科 內的不同物種形態相似,有時會出現同一物種,會錯誤的把它界定為不同 的物種,或者不同的物種,錯誤的把它界定為同一物種,分類關系混亂, 利用該物種的標準條形碼可以方便快捷的對其物種進行準確的鑒定。
具體實施方式
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