[發(fā)明專利]一種凹尾擬鲿DNA條形碼序列及其應(yīng)用

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 201810829076.3
• 申請日: 2018-07-25
• 公開（公告）號(hào): CN109055568A
• 公開（公告）日: 2018-12-21
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 劉紅艷;熊飛
• 申請（專利權(quán)）人: 江漢大學(xué)
• 主分類號(hào): C12Q1/6888
• 分類號(hào): C12Q1/6888;C12Q1/686;C12N15/11
• 代理公司: 北京華沛德權(quán)律師事務(wù)所 11302
• 代理人: 房德權(quán)

本發(fā)明公開了一種凹尾擬鲿DNA條形碼序列及其應(yīng)用，屬于物種鑒定技術(shù)領(lǐng)域。所述凹尾擬鲿DNA條形碼序列為SEQ ID NO:1。所述凹尾擬鲿DNA條形碼序列為凹尾擬鲿COI(cytochrome c oxidase subunit I，細(xì)胞色素c氧化酶亞基I)基因。該DNA條形碼序列可以作為凹尾擬鲿DNA的標(biāo)準(zhǔn)檢測序列，有效的對凹尾擬鲿物種進(jìn)行鑒定。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明屬于物種鑒定技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及一種凹尾擬鲿DNA條形碼序 列及其應(yīng)用。

背景技術(shù)

凹尾擬鲿(Pseudobagrus emarginatus)，隸屬鲿科(Bagridae)， 擬鲿屬(Pseudobagrus)，主要分布于長江中上游的干流及其支流，如金 沙江、雅礱江、烏江、青衣江、大渡河、涪江、岷江、嘉陵江等。凹尾擬 鲿生活在江河或溪流的底層，一般以小魚、水生昆蟲以及甲殼類等為食。 目前，擬鲿屬的分類存在較大的問題，屬的界定和屬下分類較為混亂，因 此，有必要對擬鲿屬魚類物種進(jìn)行有效的鑒定。

DNA條形碼是指生物體內(nèi)能夠代表該物種的、有足夠變異的、標(biāo)準(zhǔn)的、 易擴(kuò)增并且相對較短的DNA片段，可以快速、準(zhǔn)確的進(jìn)行物種鑒定。線 粒體DNA的COI基因具有長度適中、進(jìn)化速率適中和富含系統(tǒng)進(jìn)行發(fā)育信 息等特點(diǎn)。在研究中，能夠較好地對物種的COI基因片段進(jìn)行有效擴(kuò)增。 因此，在動(dòng)物物種分類和鑒定中，COI基因作為條形碼應(yīng)用有很大的潛力。

物種鑒定一直是分類學(xué)乃至幾乎所有生物領(lǐng)域上的研究至關(guān)重要的 基礎(chǔ)步驟。因此，準(zhǔn)確的對物種鑒定和分類就顯得尤其重要。目前，各國 研究者已經(jīng)開展了從湖泊到海洋不同地理區(qū)域的魚類DNA條形碼研究計(jì) 劃，研究表明DNA條形碼在物種鑒定方面具有高效可行性。大量的研究結(jié) 果顯示以COI基因?yàn)闃?biāo)記的DNA條形碼能夠準(zhǔn)確的對各類動(dòng)物進(jìn)行物種鑒 定，可以選用COI基因作為各種動(dòng)物條形碼數(shù)據(jù)庫的標(biāo)準(zhǔn)條形碼。

在實(shí)際操作中，往往會(huì)遇到標(biāo)本量較少以及樣本保存不完整等問題， 這樣給傳統(tǒng)的物種分類和鑒定研究帶來了很大的困難。在現(xiàn)有的技術(shù)中 心，均沒有凹尾擬鲿DNA條形碼序列以及凹尾擬鲿COI基因作為凹尾擬鲿 DNA條形碼標(biāo)準(zhǔn)檢測序列的記載和報(bào)道。

采用DNA條形碼結(jié)合傳統(tǒng)的分類學(xué)方法，對物種高效準(zhǔn)確的鑒定和分 類起著重要的作用。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的是提供一種可以作為凹尾擬鲿DNA的標(biāo)準(zhǔn)檢測序列，能 夠有效的對凹尾擬鲿物種進(jìn)行鑒定。

本發(fā)明所采用的技術(shù)方案是：

一種凹尾擬鲿DNA條形碼序列，所述序列為SEQ ID NO:1。

優(yōu)選地，所述凹尾擬鲿DNA條形碼序列為凹尾擬鲿COI(cytochrome c oxidasesubunit I，細(xì)胞色素c氧化酶亞基I)基因。

一種凹尾擬鲿DNA條形碼標(biāo)準(zhǔn)檢測序列的應(yīng)用，該DNA條形碼序列可 以作為凹尾擬鲿DNA的標(biāo)準(zhǔn)檢測序列，有效的對凹尾擬鲿物種進(jìn)行鑒定。

本發(fā)明具有以下優(yōu)點(diǎn)：

本發(fā)明所得到的凹尾擬鲿DNA條形碼序列可以作為凹尾擬鲿DNA的標(biāo) 準(zhǔn)檢測序列，對凹尾擬鲿物種高效和準(zhǔn)確的進(jìn)行鑒定和分類。在實(shí)際工作 中，有時(shí)要進(jìn)行魚卵和魚苗的物種鑒定，魚卵很難通過傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)方法 進(jìn)行鑒定，另外處于生長發(fā)育期的魚苗形態(tài)特征也還不是很顯著，無法通 過傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)進(jìn)行鑒定的時(shí)候，這時(shí)借助于物種的DNA標(biāo)準(zhǔn)條形碼，就 很容易對該物種的魚卵和魚苗進(jìn)行鑒定。有時(shí)在物種鑒定的時(shí)候，會(huì)遇到樣本不完整或殘缺不全，也給傳統(tǒng)的物種分類和鑒定帶來困難，這時(shí)借助 于物種的DNA標(biāo)準(zhǔn)條形碼，可以很快的進(jìn)行準(zhǔn)確的鑒定。有時(shí)同一屬內(nèi)甚 至亞科內(nèi)的不同物種形態(tài)相似，有時(shí)會(huì)出現(xiàn)同一物種，會(huì)錯(cuò)誤的把它界定 為不同的物種，或者不同的物種，錯(cuò)誤的把它界定為同一物種，分類關(guān)系 混亂，利用該物種的標(biāo)準(zhǔn)條形碼可以方便快捷的對其物種進(jìn)行準(zhǔn)確的鑒 定。