[發(fā)明專(zhuān)利]結(jié)核分枝桿菌的利福平耐藥性診斷標(biāo)志物及其應(yīng)用

在審

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201810696405.1
• 申請(qǐng)日: 2018-06-29
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN108950031A
• 公開(kāi)（公告）日: 2018-12-07
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 李海成;陳亮;郭卉欣
• 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人: 周琳
• 主分類(lèi)號(hào): C12Q1/689
• 分類(lèi)號(hào): C12Q1/689;C12Q1/02;C12R1/32
• 代理公司: 廣州嘉權(quán)專(zhuān)利商標(biāo)事務(wù)所有限公司 44205
• 代理人: 鄭瑩

本發(fā)明公開(kāi)了一種結(jié)核分枝桿菌的利福平耐藥性診斷標(biāo)志物，由Rv0840c、Rv2386c、Rv1130組成，當(dāng)Rv0840c、Rv2386c、Rv1130的表達(dá)量高于正常表達(dá)量時(shí)，判斷結(jié)核分枝桿菌對(duì)利福平耐藥。本發(fā)明公開(kāi)了結(jié)核分枝桿菌的利福平耐藥性診斷標(biāo)志物可實(shí)現(xiàn)結(jié)核分枝桿菌利福平耐藥性的快速臨床檢測(cè)，并為治療利福平耐藥提供了潛在靶點(diǎn)。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及一種結(jié)核分枝桿菌的利福平耐藥性診斷標(biāo)志物及其應(yīng)用。

背景技術(shù)

耐藥結(jié)核病是全球結(jié)核病防控工作中面臨的重大難題，尤其是耐多藥結(jié)核病和廣泛耐藥結(jié)核病嚴(yán)重威脅人類(lèi)身體健康，2013年報(bào)告顯示雖然新發(fā)結(jié)核病患者減少，但耐多藥結(jié)核病的診治遠(yuǎn)遠(yuǎn)未達(dá)到預(yù)期目標(biāo)。耐藥結(jié)核病的及時(shí)有效監(jiān)測(cè)是結(jié)核病防治工作的關(guān)鍵，目前我國(guó)結(jié)核病實(shí)驗(yàn)室對(duì)耐藥結(jié)核病的診斷包括傳統(tǒng)比例法藥敏、BACTEC MGIT 960系統(tǒng)以及基于分子生物學(xué)的快速診斷方法等。

現(xiàn)有檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌異煙肼耐藥的技術(shù)主要有包括兩大類(lèi)：基于培養(yǎng)的藥敏檢測(cè)、基于分子生物學(xué)基礎(chǔ)的快速藥敏檢測(cè)。現(xiàn)有技術(shù)的缺點(diǎn)主要包括：耗時(shí)長(zhǎng)，需要建立在分離培養(yǎng)的基礎(chǔ)上進(jìn)行藥敏檢測(cè)，分離培養(yǎng)需要4-8周時(shí)間，在此基礎(chǔ)上進(jìn)行后續(xù)的傳統(tǒng)固體比例法(4-8周)或者液體藥敏(1-2周)的時(shí)間；場(chǎng)地限制，兩種培養(yǎng)方法均需要體積較的培養(yǎng)箱，為保證生物安全需要固定的培養(yǎng)房間；耐藥靶點(diǎn)局限，新興的以分子生物學(xué)為基礎(chǔ)的快速診斷技術(shù)大大縮短了診斷周期1-2小時(shí)以?xún)?nèi)，但是受目前研究水平的限制，目前最優(yōu)的Xpert MTB/RIF利福平耐藥檢測(cè)靶點(diǎn)局限于ropB基因的突變位點(diǎn)；而臨床有Xpert MTB/RIF報(bào)告利福平耐藥但臨床利福平敏感的情況，提示利福平耐藥可能有其它基因位點(diǎn)的突變。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的在于提供一種結(jié)核分枝桿菌的利福平耐藥性診斷標(biāo)志物及其應(yīng)用。

本發(fā)明所采取的技術(shù)方案是：

一種結(jié)核分枝桿菌的利福平耐藥性診斷標(biāo)志物，由Rv0840c、Rv2386c、Rv1130組成。

進(jìn)一步地，當(dāng)Rv0840c、Rv2386c、Rv1130的表達(dá)量高于正常表達(dá)量時(shí)，判斷結(jié)核分枝桿菌對(duì)利福平耐藥。

一種用于檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌利福平耐藥性的試劑盒，該試劑盒中含有定量Rv0840c、Rv2386c、Rv1130表達(dá)量的試劑。

進(jìn)一步地，當(dāng)Rv0840c、Rv2386c、Rv1130表達(dá)量高于正常表達(dá)量時(shí)，判斷結(jié)核分枝桿菌對(duì)利福平耐藥。

一種檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌利福平耐藥性的方法，包括以下步驟：

1)定量待測(cè)結(jié)核分枝桿菌中Rv0840c、Rv2386c、Rv1130表達(dá)量；

2)根據(jù)Rv0840c、Rv2386c、Rv1130表達(dá)量，判斷結(jié)核分枝桿菌利福平耐藥性。

進(jìn)一步地，當(dāng)Rv0840c、Rv2386c、Rv1130表達(dá)量高于正常表達(dá)量時(shí)，判斷結(jié)核分枝桿菌對(duì)利福平耐藥。

本發(fā)明的有益效果是：

本發(fā)明公開(kāi)了結(jié)核分枝桿菌的利福平耐藥性診斷標(biāo)志物可實(shí)現(xiàn)結(jié)核分枝桿菌利福平耐藥性的快速臨床檢測(cè)，并為治療利福平耐藥提供了潛在靶點(diǎn)。

附圖說(shuō)明

圖1為利福平耐藥菌株與對(duì)照組基因組甲基化水平的熱圖；

圖2為利福平耐藥過(guò)程中甲基化水平發(fā)生變化的基因經(jīng)的KEGG分析結(jié)果；

圖3為利福平耐藥菌株與對(duì)照組基因組轉(zhuǎn)錄組水平的熱圖；

圖4為利福平耐藥過(guò)程中表達(dá)水平發(fā)生變化的基因的KEGG分析結(jié)果。

具體實(shí)施方式