[發明專利]基于惰性真桿菌預測艾滋病人HAART治療效果的引物

有效

• 申請號: 201810641541.0
• 申請日: 2018-06-21
• 公開（公告）號: CN108796100B
• 公開（公告）日: 2020-09-29
• 發明（設計）人: 朱寶利;封雨晴;張瑞芬;律娜;李晶
• 申請（專利權）人: 中國科學院微生物研究所
• 主分類號: C12Q1/689
• 分類號: C12Q1/689;C12Q1/04;C12R1/01
• 代理公司: 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245
• 代理人: 關暢;張立娜

本發明公開了一種基于惰性真桿菌預測艾滋病人HAART治療效果的引物。本發明提供了用于鑒定惰性真桿菌的物質在制備用于預測艾滋病人HAART治療效果的產品中的應用。本發明對HIV病人經過HAART治療后的效果差異跟腸道菌群結構之間做關聯性研究，進而找到HAART治療效果不同的兩組人之間的菌株——惰性真桿菌(Eubacterium siraeum)，并設計得到特異性鑒定引物。本發明對于幫助HIV患者及時調整治療方案，找到更加有效地治療方法具有重要意義。本發明還對指導患者通過服用益生菌、益生元等來調整患者的腸道微生物的組成來更好地促進HAART治療的效果具有重要意義。

技術領域

本發明涉及生物技術領域，特別涉及一種基于惰性真桿菌預測艾滋病人HAART治療效果的引物。

背景技術

近年來，腸道微生物成為了熱門研究領域之一。隨著研究的日益深入，研究者發現腸道微生物作為人體的一個“器官”，通過其代謝產物、影響宿主的免疫系統等方式來影響宿主的健康。比如，Ⅱ型糖尿病、癌癥、高血壓、神經系統退行性疾病等都已經被證明與腸道微生物有著密切的關系。

人類免疫缺陷病毒(HIV)，即艾滋病(AIDS)病毒，是造成人類免疫系統缺陷的病毒。它能夠通過破壞人體的T淋巴細胞，進而阻斷細胞免疫和體液免疫過程，導致免疫系統癱瘓，從而使各種疾病在人體內蔓延，最終導致艾滋病。隨著1996年美籍華裔科學家何大一提出雞尾酒療法，HIV患者機體的免疫功能部分甚至全部恢復，病程進展得以延緩，壽命延長，生活質量提高。

高通量測序作為腸道微生物研究的重要技術手段，在疾病與腸道微生物的關聯性研究中起到了非常重要的作用。高通量測序和生物信息技術的結合已經被廣泛應用于人體腸道樣本的微生物的研究當中。通過兩種技術手段，我們可以發現腸道微生物在不同的條件下的結構的不同，從而發現其中在物種水平和基因水平的生物標志物，通過生物標志物將兩組不同的人通過腸道微生物的生物標記物加以區分。

基于腸道微生物能夠調節機體的免疫系統，促進機體免疫細胞的增殖、分化的認識，近年來逐漸有研究將注意力轉移到腸道微生物與艾滋病之間的關系上。但是這些研究只是針對不同的人群去分析HIV感染的病人和健康人之間在腸道微生物的多樣性、結構和豐度的差異。但是這些研究只是機械地告訴人們HIV病人的腸道微生物和健康人之間的差別，并不能給臨床的治療提供任何參考，相應的臨床應用價值也不明確。目前沒有關于HIV病人經過HAART治療后的效果差異跟腸道菌群結構之間做關聯性研究。

發明內容

本發明的目的是對HIV病人經過HAART治療后的效果差異跟腸道菌群結構之間做關聯性研究，進而找到HAART治療效果不同的兩組人之間的菌株，針對相應的菌株進行檢測來預測HAART治療效果的不同。

第一方面，本發明要求保護用于鑒定惰性真桿菌(Eubacterium siraeum)的物質在制備用于預測艾滋病人HAART治療效果的產品中的應用。

其中，所述用于鑒定惰性真桿菌(Eubacterium siraeum)的物質可為用于鑒定腸道中惰性真桿菌(Eubacterium siraeum)的物質，進一步可為能夠鑒定待測DNA樣品中是否含有SEQ ID No.1的第832-1087位所示DNA片段的物質；所述待測DNA樣品為來自于艾滋病人的糞便樣本中的基因組DNA(不僅僅包含了細菌，還有真菌，病毒和宿主的DNA)。

進一步地，所述用于鑒定惰性真桿菌(Eubacterium siraeum)的物質可為如下引物對或含有所述引物對的試劑或試劑盒：

(a)由SEQ ID No.2所示的單鏈DNA和SEQ ID No.3所示的單鏈DNA組成的引物對；

(b)由將SEQ ID No.2和SEQ ID No.3經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的兩條單鏈DNA分子組成的，且與(a)中所述引物對功能相同的引物對；