[發(fā)明專利]影響番茄果色形成調(diào)控基因YFT2的可變剪切子及應(yīng)用

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 201810610111.2
• 申請日: 2018-06-13
• 公開（公告）號(hào): CN108866075A
• 公開（公告）日: 2018-11-23
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 趙凌俠;陳露露;李文貞;趙偉華;溫騰健;杜可玉;李勇鵬;馮學(xué)超
• 申請（專利權(quán)）人: 上海交通大學(xué)
• 主分類號(hào): C12N15/29
• 分類號(hào): C12N15/29;C12N15/113;C07K14/415;C12N15/82;A01H5/08;A01H6/82
• 代理公司: 上海漢聲知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 31236
• 代理人: 莊文莉

本發(fā)明公開了一種影響番茄果色形成調(diào)控基因YFT2的可變剪切子及應(yīng)用；具體涉及調(diào)控番茄果實(shí)顏色蛋白質(zhì)的基因核苷酸序列、啟動(dòng)子序列和該蛋白的氨基酸序列，以及基因可變剪切的2種方式。本發(fā)明利用自然黃果番茄突變體黃櫻桃22號(hào)，通過構(gòu)建黃櫻桃22號(hào)×LA1585F₂突變?nèi)后w，成功地定位出影響黃櫻桃22號(hào)果實(shí)顏色的YFT2基因。構(gòu)建過表達(dá)載體，在黃櫻桃22號(hào)中對(duì)YFT2進(jìn)行轉(zhuǎn)基因互補(bǔ)實(shí)驗(yàn)，可以恢復(fù)番茄果色為紅色。通過RACE得到了該基因的轉(zhuǎn)錄本全長，發(fā)現(xiàn)在黃櫻桃22號(hào)中存在一個(gè)可變剪切，導(dǎo)致YFT2蛋白不能正常合成，進(jìn)而影響果色。本發(fā)明為通過可變剪切影響番茄果色提供基礎(chǔ)。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明屬于分子生物學(xué)和遺傳學(xué)領(lǐng)域，特別涉及一種影響番茄果色形成調(diào)控基因YFT2的可變剪切子及應(yīng)用。

背景技術(shù)

番茄(Solanum lycopersicum；2n＝24)屬于茄科(Solanaceae)番茄屬(Lycopersicon)植物，是世界上極其重要蔬菜作物之一。番茄果實(shí)屬于漿果，是番茄經(jīng)濟(jì)性狀最重要的部分，可以生吃，烹飪或加工。

番茄果實(shí)顏色是番茄果實(shí)成熟變化的外在體現(xiàn)，是由植物色素分子葉綠素、黃酮類化合物和類胡蘿卜素的共同決定的。這些色素分子對(duì)番茄自身繁衍后代和對(duì)人類抵抗癌癥和心血管疾病都有積極作用。隨著人們生活水平的提高，番茄果實(shí)營養(yǎng)價(jià)值已提到重要位置，而作為外部品質(zhì)性狀果色更是吸引消費(fèi)者購買的直接因素。因此果實(shí)顏色是一個(gè)十分重要的番茄育種性狀，關(guān)系到其營養(yǎng)價(jià)值和市場需求。研究番茄果色性狀會(huì)提高番茄品質(zhì)育種進(jìn)程，產(chǎn)生一定的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。

目前研究表明番茄果色的形成和調(diào)控是一個(gè)復(fù)雜的代謝網(wǎng)絡(luò)，番茄果色形成受到植物眾多生物合成代謝途徑(類胡蘿卜素合成、黃酮類化合物合成、葉綠素合成與降解)及相關(guān)調(diào)控基因調(diào)控；也受到植物質(zhì)體發(fā)育的影響；同時(shí)還和乙烯、ABA、光信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的相關(guān)。番茄成熟果實(shí)中主要色素分子是番茄紅素，早些時(shí)候的研究主要關(guān)注于類胡蘿卜素代謝途徑，目前該途徑上的結(jié)構(gòu)基因已經(jīng)清楚。現(xiàn)在人們開始注意到番茄色素化合物的積累還和質(zhì)體發(fā)育，植物激素，光信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)相關(guān)，但是現(xiàn)有的研究結(jié)果很難全面闡明番茄果實(shí)顏色形成和調(diào)控機(jī)制。因此篩選新的番茄果色突變體以及通過圖位克隆鑒定參與番茄果實(shí)顏色形成和調(diào)控的基因尤為重要。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的在于提供一種影響番茄果色形成調(diào)控基因YFT2的可變剪切子及應(yīng)用；具體是提供一個(gè)控制番茄黃果色性狀的基因和導(dǎo)致黃果性狀產(chǎn)生的原因，可用于今后篩選黃果番茄品種，進(jìn)行品質(zhì)改良。

本發(fā)明的目的是通過以下技術(shù)方案來實(shí)現(xiàn)的：

本發(fā)明涉及一種黃果番茄果色調(diào)控基因YFT2，其DNA序列如SED ID NO:1所示。

優(yōu)選的，所述基因YFT2編碼的蛋白的氨基酸序列如SED ID NO:2所示。

優(yōu)選的，所述調(diào)控基因YFT2的前體mRNA具有兩種可變的如SED ID NO:4和SED IDNO:5所示的剪切形式。

本發(fā)明還涉及一種所述的黃果番茄果色調(diào)控基因YFT2在調(diào)控番茄黃果色中的應(yīng)用。

本發(fā)明還涉及一種所述的黃果番茄果色調(diào)控基因YFT2在番茄育種中的應(yīng)用。

本發(fā)明還涉及一種黃果番茄果色調(diào)控蛋白，其氨基酸序列如SED ID NO:2所示。

本發(fā)明還涉及一種所述的黃果番茄果色調(diào)控蛋白在調(diào)控番茄黃果色中的應(yīng)用。

本發(fā)明還涉及一種所述的黃果番茄果色調(diào)控蛋白在番茄育種中的應(yīng)用。

本發(fā)明還涉及一種黃果番茄果色調(diào)控基因YFT2的啟動(dòng)子，編碼所述啟動(dòng)子的堿基序列如SED ID NO:3所示。

本發(fā)明還涉及一種所述的啟動(dòng)子在調(diào)控番茄黃果色中的應(yīng)用。