[發(fā)明專利]適用于單分子測序的設(shè)備及對核酸分子進行測序的方法在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201810608501.6 | 申請日: | 2018-06-13 |
| 公開(公告)號: | CN109082362A | 公開(公告)日: | 2018-12-25 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 邱創(chuàng)汎;潘詔智;蔡經(jīng)緯;陳柏樺;邱建豪 | 申請(專利權(quán))人: | 體學(xué)生物科技股份有限公司 |
| 主分類號: | C12M1/00 | 分類號: | C12M1/00;C12Q1/6869 |
| 代理公司: | 北京同立鈞成知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11205 | 代理人: | 張曉霞;臧建明 |
| 地址: | 中國臺灣新竹科學(xué)工業(yè)*** | 國省代碼: | 中國臺灣;71 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 測序 觀察區(qū) 核酸分子 核酸固定 單分子 核酸片段 設(shè)備提供 時間縮短 樣本制備 高通量 聚合酶 鄰近 | ||
1.一種適用于單分子測序的設(shè)備,其特征在于,包括:
至少一個納米井,其中所述至少一個納米井具有觀察區(qū);
多個核酸固定部分,設(shè)置在所述觀察區(qū)中或鄰近所述觀察區(qū);
多種類型的核酸片段,分別被固定到所述多個核酸固定部分;以及
至少一個聚合酶,設(shè)置在所述觀察區(qū)中。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的設(shè)備,其特征在于,所述觀察區(qū)的直徑介于10nm到500nm范圍內(nèi),且所述觀察區(qū)的高度小于200nm。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的設(shè)備,其特征在于,所述多種類型的核酸片段是直線型核酸片段。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的設(shè)備,其特征在于,所述多種類型的核酸片段在長度上包括50個核苷酸到200個核苷酸。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的設(shè)備,其特征在于,所述至少一個聚合酶為一個聚合酶。
6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的設(shè)備,其特征在于,所述多種類型的核酸片段在長度上包括多于200個核苷酸。
7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的設(shè)備,其特征在于,所述至少一個聚合酶包括多個聚合酶,所述設(shè)備還包括位于所述觀察區(qū)中的多個聚合酶固定部分,且所述多個聚合酶被固定到所述多個聚合酶固定部分。
8.一種對核酸分子進行測序的方法,其特征在于,包括:
(a)提供至少一個納米井,其中所述至少一個納米井具有觀察區(qū);
(b)將多種類型的核酸片段通過多個核酸固定部分固定到所述觀察區(qū);
(c)向所述至少一個納米井中提供一個引物及多個經(jīng)標(biāo)記核苷酸,其中所述引物與所述多種類型的核酸片段中的一者在所述觀察區(qū)中形成引物-核酸片段復(fù)合體;以及
(d)通過使用聚合酶并將所述多個經(jīng)標(biāo)記核苷酸納入到所述引物-核酸片段復(fù)合體中來起始所述引物-核酸片段復(fù)合體的新生鏈合成反應(yīng),以形成新生鏈;以及
(e)通過檢測經(jīng)納入后所述多個經(jīng)標(biāo)記核苷酸的序列來確定所述多種類型的核酸片段的序列。
9.根據(jù)權(quán)利要求8所述的方法,其特征在于,還包括以下步驟:
(f)將所述新生鏈離解;以及
(g)重復(fù)步驟(c)到步驟(f)。
10.根據(jù)權(quán)利要求8所述的方法,其特征在于,所述觀察區(qū)的直徑介于10nm到500nm之間,且所述觀察區(qū)的高度小于200nm。
11.根據(jù)權(quán)利要求8所述的方法,其特征在于,所述多種類型的核酸片段在長度上包括50個核苷酸到200個核苷酸。
12.根據(jù)權(quán)利要求11所述的方法,其特征在于,步驟(c)還包括添加所述聚合酶。
13.根據(jù)權(quán)利要求8所述的方法,其特征在于,所述多種類型的核酸片段在長度上包括多于200個核苷酸。
14.根據(jù)權(quán)利要求13所述的方法,其特征在于,還包括將多個聚合酶通過多個聚合酶固定部分固定到所述觀察區(qū),其中在步驟(d)中使用的所述聚合酶是所述多個聚合酶中的一者。
15.根據(jù)權(quán)利要求14所述的方法,其特征在于,所述固定所述多個聚合酶的步驟是在步驟(c)之前執(zhí)行。
16.根據(jù)權(quán)利要求14所述的方法,其特征在于,還包括以下步驟:
(f)將所述新生鏈離解;以及
(g)重復(fù)步驟(c)到步驟(f),其中在所重復(fù)的步驟(d)中使用的所述聚合酶是所述多個聚合酶中的一者。
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