[發明專利]與母雞儲精能力相關的SNP分子標記及其應用

有效

• 申請號: 201810555246.3
• 申請日: 2018-05-31
• 公開（公告）號: CN110551824B
• 公開（公告）日: 2023-02-03
• 發明（設計）人: 李世軍;周慧敏;莫長歡;馬帥
• 申請（專利權）人: 華中農業大學
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 武漢宇晨專利事務所(普通合伙) 42001
• 代理人: 江麗麗;王敏鋒

本發明提供了一種與母雞儲精能力相關的SNP分子標記及其應用，通過全基因組關聯分析（GWAS）和限制性內切酶長度多態性（PCR?RFLP）技術方法，在母雞基因組上篩選到1個與母雞儲精能力相關聯的SNP分子標記，位于母雞1號染色體。該SNP位點的多態性與母雞儲精能力DN（授精一次至母雞產出最后一枚受精蛋之間間隔的天數）和FN（授精一次后母雞所產受精蛋的個數）顯著關聯，所述SNP分子標記多態性位點表現為CC基因型，則是母雞儲精能力的有利標記，可以用于母雞儲精能力的篩選和改良。

技術領域

本發明屬于家畜分子標記技術領域，具體涉及1個與母雞儲精能力相關的SNP分子標記及其應用。

背景技術

母雞的儲精能力是指母雞在自然交配或者人工授精(Artificial insemination，AI)之后能夠儲存精子并持續產受精蛋的能力(Duration of fertility)。在許多品種或品系的群體中，研究者發現母雞的儲精能力均會存在明顯的個體差異，反映為一次自然交配或者人工授精后母雞產受精蛋個數(FN，The number of fertile eggs after AI)或持續天數(DN，The days post-insemination until the last fertile egg)的差異。在家禽育種和種蛋生產過程中，母雞的儲精能力長短是決定進行人工授精頻率的關鍵因素，如火雞的儲精性狀長達一至兩個月，因此在火雞種蛋的生產過程中，對其人工授精只需要一個月進行一次，甚至對于即將要開產的火雞，可提前半個月進行人工授精來提高種蛋的獲得(Bakst,2010)。而白來航(White leghorn)和京紅母雞(JingHong brown layers)的儲精性狀一般只有兩周左右，麻鴨(Anas platyrhyncha domestica)的儲精性狀也只有13天左右(Lake and Stewart,1978；Blackburn et al.,2009；Liu et al.,2015)，生產上為了保證90％以上的種蛋受精率，對它們進行人工授精一般需要一周進行一次。在目前大規模集約生產中人工授精技術被普遍采用的情況下，選擇儲精能力長的母雞，對母雞儲精性狀進行改良，能夠有效地降低種蛋生產過程中人工授精的頻率，進而減少種公雞的飼養量，從而減少飼養成本，同時減少母雞對人工授精產生的應激反應，增加生產效益。利用全基因組關聯分析(GWAS)檢測與性狀相關聯的SNPs及基因組區域，可大大提高工作效率和統計效力。本研究是利用雞全基因組SNP芯片(600K，Affymetrix)對雞儲精能力進行全基因組關聯分析，在全基因組范圍內檢測與母雞儲精性狀相關聯SNPs及基因組區域的報道。該項研究工作在國家基金(項目編號：31372301，項目名稱：雞貯精能力差異相關新基因的篩選及其分子機制初探)和西藏自治區重點研發及轉化計劃(項目編號：CGZH2017000237)及自主創新基金重大培育項目：利用吐-萊資源群體發掘雞抗熱高產基因及其組合(項目編號：2662018PY088)資助下完成。

發明內容

本發明的目的在于提供一個與母雞儲精能力相關的SNP分子標記及其應用，通過全基因組關聯分析首次在母雞基因組1號染色體上找到1個與儲精能力關聯的SNP分子標記。

本發明通過以下技術方案實現：

一種與母雞儲精能力相關的SNP分子標記，位于1號染色體，該分子標記的核苷酸序列(SEQ ID NO.1)如下所示：

AAAAGCATTTGCATGAGATATATTARCATTTTATTCATGACAAAAGGAAAT

上述序列第26位的堿基R是A或C，導致多態性。

通過下述方法篩選獲得：

1)實驗樣品采集：采集試驗雞血樣用于DNA提取；

2)母雞儲精能力的測定：測量試驗雞一次人工授精后母雞產受精蛋個數(FN)和持續天數(DN)，重復測量三次，取三次所測結果的平均值，作為該試驗雞的儲精能力；