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[發(fā)明專利]聯(lián)合attention機(jī)制與神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的生物醫(yī)學(xué)實(shí)體關(guān)系分類方法在審

專利信息
申請?zhí)枺?/td> 201810554915.5 申請日: 2018-06-01
公開(公告)號: CN108875809A 公開(公告)日: 2018-11-23
發(fā)明(設(shè)計(jì))人: 林鴻飛;鄭巍 申請(專利權(quán))人: 大連理工大學(xué)
主分類號: G06K9/62 分類號: G06K9/62
代理公司: 大連智高專利事務(wù)所(特殊普通合伙) 21235 代理人: 劉斌
地址: 116023 遼*** 國省代碼: 遼寧;21
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摘要:
搜索關(guān)鍵詞: 生物醫(yī)學(xué) 實(shí)體關(guān)系 分類 神經(jīng)網(wǎng)絡(luò) 構(gòu)建 向量 單詞 句子 解析 數(shù)據(jù)挖掘技術(shù) 分類模型 分類問題 關(guān)系分類 候選實(shí)體 基本單位 模型輸入 文本處理 重要影響 權(quán)重 加權(quán) 嵌入 聯(lián)合 清晰
【權(quán)利要求書】:

1.一種聯(lián)合attention機(jī)制與神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的生物醫(yī)學(xué)實(shí)體關(guān)系分類方法,其特征在于,包括以下步驟:S1、基于指代解析的文本處理;S2、構(gòu)建基于attention機(jī)制的模型輸入向量;S3、構(gòu)建基于雙向LSTM的生物醫(yī)學(xué)實(shí)體關(guān)系分類模型;S4、利用關(guān)系分類模型進(jìn)行生物醫(yī)學(xué)實(shí)體關(guān)系分類。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種聯(lián)合attention機(jī)制與神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的生物醫(yī)學(xué)實(shí)體關(guān)系分類方法,其特征在于,所述的步驟:

S1、基于指代解析的文本處理:采集公開已標(biāo)注的數(shù)據(jù)集,利用文本處理技術(shù)對文本進(jìn)行初始化處理,利用基于following的指代解析處理和剪枝技術(shù)對句子進(jìn)行處理;

S2、構(gòu)建基于attention機(jī)制的模型輸入向量:所述模型輸入向量包括輸入特征向量、輸入attention向量和句子向量,其處理方法如下:

B1、輸入特征向量的構(gòu)建:給定一個剪枝的句子S={w1,w2,…,wi,…,wn},每個詞wi被表示成三個特征向量:詞自身word、詞的PoS標(biāo)記和位置,分別表示為以及和

B2、輸入attention向量的構(gòu)建:應(yīng)用attention機(jī)制到B1中的初始word嵌入向量以生成面向候選實(shí)體的word嵌入向量;利用兩個長度等于句子最大長度n的行向量αj來量化一個句子中每個單詞wi與第j個候選實(shí)體的相關(guān)程度因子,αj的定義如下公式所示:

其中,j∈{1,2},和分別是單詞wi與第j個候選實(shí)體ej的詞嵌入向量,score函數(shù)被看作面向候選實(shí)體的函數(shù),其定義如下:

其中,符號dot表示兩個向量和上的點(diǎn)積操作;m1是詞嵌入向量的維數(shù);相關(guān)程度因子和作用在單詞wi的最初詞嵌入向量上,二者的聯(lián)合作用αi表示為αi作用到最初詞嵌入向量上看作是面向候選實(shí)體的詞嵌入向量其定義表示為其中符號*表示按位計(jì)算的乘法;

B3、句子向量的構(gòu)建:

構(gòu)建向量用以表示單詞wi的語義,其中xi∈Rm,m=m1+m2+2m3,m2和m3分別是PoS和位置嵌入向量的維數(shù);“||”表示連接操作;句子S表示成一個實(shí)值向量數(shù)組Semb=[x1,x2,…,xi,...,xn];

S3、構(gòu)建基于雙向LSTM的生物醫(yī)學(xué)實(shí)體關(guān)系分類模型:利用雙向帶有長短術(shù)語存儲單元的循環(huán)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行有監(jiān)督學(xué)習(xí)建模;包括:嵌入層,輸入attention層,合并層,雙向LSTM層;利用帶有softmax函數(shù)的邏輯斯諦回歸分類器作為候選實(shí)例的分類器;softmax函數(shù)以雙向LSTM層的輸出hn作為輸入,其輸出y表示候選實(shí)例在每個不同的關(guān)系類別標(biāo)簽上的概率分布;第j類標(biāo)簽的概率分布表示為p(y=j(luò)|S)=softmax(hnWs+bs),S表示句子,Ws是需要學(xué)習(xí)的權(quán)重矩陣,bs是需要學(xué)習(xí)的偏置向量;概率最大的類別對應(yīng)的標(biāo)簽為候選實(shí)例的關(guān)系類型,表示為其中C是生物語料中分類可能有的標(biāo)簽的集合;設(shè)定用于預(yù)測誤差的損失函數(shù)為交叉熵?fù)p失函數(shù)l是訓(xùn)練集中標(biāo)注的樣本數(shù),上標(biāo)k表示第k個被分類的句子,θ為模型中的所有參數(shù);

S4、預(yù)測生物醫(yī)學(xué)實(shí)體關(guān)系:利用步驟S1中的方法對文本進(jìn)行初始處理、指代解析和剪枝;然后利用步驟S2中B1的方法,分別獲取句子中的單詞、每個單詞的PoS標(biāo)簽以及當(dāng)前單詞與兩個實(shí)體的相對距離,查相應(yīng)向量字典得到這些特征的索引符號;基于輸入,模型會輸出每對關(guān)系實(shí)例在各個類別上的概率值,其中概率值最大的那一類即為候選實(shí)例對應(yīng)的類別標(biāo)簽,從而得到實(shí)體間的關(guān)系類型。

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