[發(fā)明專利]一組玉米SSR分子標(biāo)記及其應(yīng)用

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201810488914.5
• 申請(qǐng)日: 2018-05-21
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN108384884B
• 公開(kāi)（公告）日: 2021-02-09
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 關(guān)海濤;張瑞英;張曉磊;溫洪濤;黃盈瑩
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 黑龍江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全研究所
• 主分類號(hào): C12Q1/6895
• 分類號(hào): C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 北京路浩知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11002
• 代理人: 王文君;陳征

本發(fā)明提供了一組玉米SSR分子標(biāo)記及其應(yīng)用，所述一組玉米SSR分子標(biāo)記共17個(gè)，本發(fā)明還提供一套適于毛細(xì)管電泳平臺(tái)的檢測(cè)所述SSR分子標(biāo)記的引物組合。利用這17個(gè)SSR分子標(biāo)記可以：(1)構(gòu)建玉米品種SSR標(biāo)記指紋數(shù)據(jù)庫(kù)；(2)玉米樣本母系溯源分析；(3)玉米品種鑒定及遺傳多樣性分析；(4)區(qū)分玉米德美亞1號(hào)和登海18品種。通過(guò)本發(fā)明的玉米SSR分子標(biāo)記的應(yīng)用，能夠在基因組水平上拓展了玉米可用標(biāo)記位點(diǎn)的范圍；為玉米品種、種質(zhì)資源鑒定，親緣關(guān)系評(píng)價(jià)，細(xì)胞質(zhì)遺傳特性等研究提供新工具，應(yīng)用前景良好。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明屬于農(nóng)作物分子生物學(xué)技術(shù)領(lǐng)域，具體地說(shuō)，涉及一組用于毛細(xì)管電泳檢測(cè)技術(shù)的玉米SSR分子標(biāo)記及其應(yīng)用。

背景技術(shù)

玉米純度鑒定及品種區(qū)分是玉米種子質(zhì)量控制體系中的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。目前玉米純度鑒定及品種區(qū)分方法有形態(tài)鑒定、同工酶或種子貯藏蛋白質(zhì)電泳技術(shù)等。其中，種子貯藏蛋白質(zhì)電泳技術(shù)具有簡(jiǎn)單、快速、準(zhǔn)確、成本低等優(yōu)點(diǎn)，根據(jù)該技術(shù)制定的相關(guān)技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)正在得到廣泛應(yīng)用。然而，由于部分玉米品種間種子貯藏蛋白多態(tài)性差，或譜帶表現(xiàn)為非互補(bǔ)類型等原因，利用種子貯藏蛋白質(zhì)電泳技術(shù)難以找到特征帶，使得部分玉米缺乏快速、可靠的鑒定手段。

DNA分子標(biāo)記技術(shù)的出現(xiàn)為玉米品種鑒定提供了新的手段。其中，SSR標(biāo)記由于具有數(shù)量豐富、多態(tài)性高、遺傳上呈共顯性、擴(kuò)增穩(wěn)定、引物序列易于交流等特點(diǎn)受到廣泛重視。利用簡(jiǎn)單重復(fù)序列(Simple Sequence Repeats,SSR)標(biāo)記技術(shù)進(jìn)行品種鑒定的關(guān)鍵之一是擴(kuò)增片段檢測(cè)技術(shù)。現(xiàn)有研究多利用較為復(fù)雜的聚丙烯酰胺凝膠電泳結(jié)合銀染進(jìn)行檢測(cè)。但該技術(shù)由于分辨率低，難以明確區(qū)分?jǐn)U增片段間幾個(gè)堿基的差異，且對(duì)儀器設(shè)備和人員技能要求相對(duì)較高，不利于普及。而基于毛細(xì)管電泳檢測(cè)技術(shù)的SSR分子標(biāo)記技術(shù)則可以得到定量的DNA片段分析數(shù)據(jù)。與常規(guī)的聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測(cè)方法相比，其結(jié)果更為精確、靈敏、高效，更適用于大批量品種的檢測(cè)分析。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的是提供適用于毛細(xì)管電泳檢測(cè)技術(shù)的一組玉米SSR分子標(biāo)記。

為了實(shí)現(xiàn)本發(fā)明目的，本發(fā)明通過(guò)收集來(lái)源廣泛、表型和基因型豐富、代表性強(qiáng)的玉米材料，對(duì)相應(yīng)材料的玉米基因組進(jìn)行測(cè)序并比較。本發(fā)明提供了一組適用于毛細(xì)管電泳檢測(cè)技術(shù)的玉米SSR分子標(biāo)記，所述分子標(biāo)記為以下17個(gè)SSR分子標(biāo)記的一個(gè)或多個(gè)，17個(gè)SSR分子標(biāo)記分別為PHI015，PHI299852，UMC1245，UMC1632，UMC1134，NC030，PHI109275，PHI072，UMC2214，UMC1073，MMMC0481，UMC1066，PHI024，UMC1639，UMC1155，PHI053，PHI227562。

所述17個(gè)SSR分子標(biāo)記分別依次通過(guò)以下引物擴(kuò)增得到：SEQ ID NO.1-2，SEQ IDNO.3-4，SEQ ID NO.5-6，SEQ ID NO.7-8，SEQ ID NO.9-10，SEQ ID NO.11-12，SEQ IDNO.13-14，SEQ ID NO.15-16，SEQ ID NO.17-18，SEQ ID NO.19-20，SEQ ID NO.21-22，SEQID NO.23-24，SEQ ID NO.25-26，SEQ ID NO.27-28，SEQ ID NO.29-30，SEQ ID NO.31-32，SEQ ID NO.33-34。

進(jìn)一步，本發(fā)明提供了用于擴(kuò)增上述SSR分子標(biāo)記的特異性引物對(duì)，其為以下任一對(duì)：SEQ ID NO.1-2，SEQ ID NO.3-4，SEQ ID NO.5-6，SEQ ID NO.7-8，SEQ ID NO.9-10，SEQID NO.11-12，SEQ ID NO.13-14，SEQ ID NO.15-16，SEQ ID NO.17-18，SEQ ID NO.19-20，SEQ ID NO.21-22，SEQ ID NO.23-24，SEQ ID NO.25-26，SEQ ID NO.27-28，SEQ ID NO.29-30，SEQ ID NO.31-32，SEQ ID NO.33-34。